SPCS1(signal peptidase complex subunit 1 homolog (S. cerevisiae)) 转至新版数据库

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

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基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
更新时间(date_modified)
ucsc码
ena
ccds数据码
uniprot数据码
pubmed代码
mgd码
rgd码
生命科学数据库(lsdb)
更新时间(date modified)
cosmic
mirbase
基因曾用简称(prev symbol)
基因曾用名称(prev name)
homeodb
cosmic
snornabase
bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
酶代码
中间纤维数据库

收起

基因染色体位置

基因染色体位置

3p21.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

基因序列

基因序列

SPCS1基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

SPCS1基因的碱基突变：           显示全部snp
rs6617       rs8906       rs173492       rs3755798       rs12635140       rs13085442       rs72960229       rs78109019       rs78824443       rs79633493       rs112273172       rs116426983       rs138110000       rs138538919       rs140030572       rs140327464       rs141601903       rs142383492       rs142675355       rs142762908       rs144514501       rs144743254       rs146596724       rs147669558       rs148763875       rs150901717       rs151186583       rs180725283       rs181347654       rs181731892       rs182465283       rs186157740       rs189012511       rs189432234       rs190478850       rs191079275       rs192313354      
rs199974051       rs200504201       rs200515583       rs201055163       rs201293841       rs201648722       rs202111306       rs367696178       rs368768726       rs370937077       rs372471984       rs372890607       rs373203321       rs374028558       rs374398229       rs374412635       rs374987278       rs375371721       rs375704003       rs375726434       rs377090834       rs377500410       rs528564319       rs528624177       rs531086688       rs531126545       rs531361243       rs531651647       rs532530219       rs534961634       rs535010227       rs535887135       rs536758961       rs536965459       rs537003248       rs538417409       rs538588274       rs538815503       rs539340793       rs539885841       rs541267854       rs541886064       rs542283495       rs542319962       rs543881916       rs544923606       rs545994562       rs547679705       rs547840214       rs548403196       rs550269468       rs550305749       rs551000148       rs551269413       rs551665743       rs551874912       rs552615677       rs554798910       rs554799107       rs554837412       rs555126424       rs555339720       rs555920894       rs556830394       rs557182731       rs558725056       rs559712086       rs559819685       rs561124123       rs561967540       rs562146027       rs562367515       rs563677208       rs564838908       rs565075841       rs565826236       rs566147745       rs566245730       rs566935294       rs567649822       rs569552552       rs569677427       rs570233987       rs573036074       rs573427287       rs574812120       rs576080158       rs576674418       rs577574029       rs745394692       rs745571756       rs746066340       rs746252200       rs746889570       rs747204603       rs747294736       rs747971427       rs748181131       rs748913708       rs749142342       rs749820614       rs750112918       rs750515311       rs750664518       rs751025908       rs751690460       rs751966397       rs752624454       rs752641068       rs752649764       rs753056872       rs753406222       rs753819319       rs753959472       rs754430599       rs754517312       rs754676127       rs754735566       rs754895579       rs755278929       rs755367025       rs755685788       rs755931107       rs756089343       rs756349054       rs756478537       rs757517101       rs758341721       rs758448384       rs758900187       rs759281527       rs759543942       rs759740081       rs760190633       rs760296068       rs760606282       rs761247501       rs761824283       rs761912240       rs762585746       rs764137558       rs764330951       rs764333928       rs764680879       rs765050619       rs765099500       rs765655416       rs765727515       rs765984153       rs766329428       rs766638982       rs767093456       rs767766873       rs769133807       rs769202960       rs769489113       rs770210832       rs771100531       rs771717218       rs772053287       rs772142776       rs772181476       rs772693105       rs773233169       rs774475130       rs775349376       rs775639108       rs775889491       rs776011722       rs776208417       rs776961111       rs777525360       rs777888871       rs778072787       rs778644030       rs779115533       rs779227389       rs779413443       rs779419171       rs779791499       rs780447744       rs780718225       rs780738261       rs781501431       rs781583235       rs869071013       rs12486554       rs34017441       rs145663312       rs145894928       rs147659930       rs182890500       rs534720934       rs537295415       rs559855814      

基因表达

基因表达

SPCS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
CATGTTTGCTGACACTTCC
57
CTGTGCTTGATTCTTGAACAG
58
ACGCAGATGGATTACAAGG
58
ACGTACCCGTAGATAAATCCA
59
ACGCAGATGGATTACAAGG
58
ACGTACCCGTAGATAAATCCA
59
CGCAGATGGATTACAAGGG
58
CACGTACCCGTAGATAAATCC
58
CGCAGATGGATTACAAGGG
58
ACGTACCCGTAGATAAATCCA
59
CATGTTTGCTGACACTTCCT
59
CTGTGCTTGATTCTTGAACAG
58
CACGGTCCTTAAGTCTCGG
59
CCCGTAGATAAATCCAACTATTGC
59
CGCAGATGGATTACAAGGG
58
CACGTACCCGTAGATAAATCC
58
ACGCAGATGGATTACAAGG
58
ACGTACCCGTAGATAAATCCA
59
CATGTTTGCTGACACTTCCT
59
CTGTGCTTGATTCTTGAACAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPCS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

SPCS1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005787
C9JBL1(UniProtKB)
IEA
GO:0006465
C9JBL1(UniProtKB)
IEA
GO:0008233
C9JBL1(UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JBL1(UniProtKB)
IEA
GO:0003674
Q9Y6A9(UniProtKB)
ND
GO:0005515
Q9Y6A9(UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y6A9(UniProtKB)
IPI
GO:0005787
Q9Y6A9(UniProtKB)
TAS
GO:0005789
Q9Y6A9(UniProtKB)
TAS
GO:0006465
Q9Y6A9(UniProtKB)
IBA
GO:0006508
Q9Y6A9(UniProtKB)
TAS
GO:0008233
Q9Y6A9(UniProtKB)
IEA
GO:0030176
Q9Y6A9(UniProtKB)
IDA
GO:0045047
Q9Y6A9(UniProtKB)
IBA
GO:0005787
X6R2S6(UniProtKB)
IEA
GO:0006465
X6R2S6(UniProtKB)
IEA
GO:0008233
X6R2S6(UniProtKB)
IEA
GO:0016021
X6R2S6(UniProtKB)
IEA
GO:0043022
X6R2S6(UniProtKB)
IEA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控SPCS1基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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