PIGC(phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C)

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

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基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
更新时间(date_modified)
ucsc码
ena
ccds数据码
uniprot数据码
pubmed代码
mgd码
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更新时间(date modified)
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基因曾用名称(prev name)
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cosmic
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bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
酶代码
中间纤维数据库

收起

基因染色体位置

基因染色体位置

1q23-q25
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes an endoplasmic reticulum associated protein that is involved in glycosylphosphatidylinositol (GPI) lipid anchor biosynthesis. The GPI lipid anchor is a glycolipid found on many blood cells and serves to anchor proteins to the cell surface. The encoded protein is one subunit of the GPI N-acetylglucosaminyl (GlcNAc) transferase that transfers GlcNAc to phosphatidylinositol (PI) on the cytoplasmic side of the endoplasmic reticulum. Two alternatively spliced transcripts that encode the same protein have been found for this gene. A pseudogene on chromosome 11 has also been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

[中文简述(自动翻译):]  此基因编码参与糖基（GPI）脂质锚生物合成的内质网相关的蛋白。该GPI脂质锚是许多血细胞中发现糖脂和用于锚定蛋白到细胞表面。所编码的蛋白质是在内质网的胞质侧转移的GlcNAc以磷脂酰肌醇（PI）的GPI N-乙酰葡糖胺（GlcNAc）转移酶的一个亚基。编码相同蛋白质的两个可变剪接转录物已经发现这种基因。 11号染色体上一个假也已表征。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对PIGC基因的介绍     Wikipedia数据库中对PIGC基因的介绍

基因序列

基因序列

PIGC基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

PIGC基因的碱基突变：           显示全部snp
rs13932       rs1063412       rs2230471       rs3213563       rs4916258       rs7517064       rs7528603       rs7531056       rs7531430       rs7539186       rs9425618       rs10911765       rs12072189       rs34001453       rs55669322       rs60302909       rs61747502       rs61747503       rs72725210       rs72725266       rs74126218       rs78565583       rs78627507       rs79080789       rs79531617       rs79638479       rs80026935       rs111575250       rs111874360       rs112190936       rs112726514       rs113469701       rs113856916       rs114127178       rs114331647       rs114933316       rs115209243      
rs116313202       rs117006538       rs138512059       rs139014742       rs139238043       rs139756195       rs140747421       rs140753224       rs140958278       rs141135424       rs141515557       rs141877336       rs142189272       rs143548308       rs144080324       rs144595743       rs144764812       rs144974849       rs145178516       rs146481462       rs147442864       rs147497247       rs148171978       rs149404118       rs149668341       rs150087968       rs150227829       rs150619027       rs150967830       rs151276937       rs180968380       rs181333201       rs181854308       rs182740340       rs183856666       rs184420542       rs185108003       rs186506600       rs187368266       rs188094512       rs189029041       rs190663607       rs190950807       rs192534677       rs192616747       rs199500420       rs199866593       rs200105210       rs200424952       rs201429163       rs201517616       rs201621571       rs202003796       rs202159408       rs202218437       rs368132186       rs368791739       rs369050967       rs370127923       rs370525218       rs370586930       rs370905635       rs371175765       rs371586803       rs372409223       rs375259647       rs375570541       rs375615276       rs375726386       rs376403107       rs377525190       rs527675527       rs527688082       rs528087855       rs528332673       rs528611050       rs528685780       rs529622483       rs530712184       rs531541544       rs532346993       rs533031526       rs533755045       rs534317904       rs534329579       rs535039814       rs535366221       rs535487688       rs535828215       rs536261238       rs536871169       rs537370282       rs537640251       rs538347316       rs540178131       rs541170004       rs542023504       rs542339469       rs542750500       rs543886820       rs544154715       rs544813176       rs544972346       rs545163472       rs545618987       rs547023051       rs547127872       rs547849347       rs549965753       rs550442979       rs550776217       rs550979366       rs551305275       rs551328156       rs551464750       rs551479235       rs554101239       rs554660637       rs554828789       rs557299008       rs557561443       rs557822823       rs558618147       rs559302185       rs559788340       rs560296699       rs561555876       rs562344141       rs562860074       rs563373313       rs564057821       rs566468677       rs566587410       rs567493020       rs567604627       rs567766460       rs567827901       rs568400774       rs568687857       rs568953432       rs570199820       rs571524685       rs572057526       rs572169825       rs572561962       rs572687067       rs572748939       rs574182092       rs576277264       rs577758801       rs745563149       rs745756762       rs745973799       rs746026225       rs746524176       rs746703487       rs746794579       rs747021702       rs747577600       rs747682584       rs747943577       rs748141955       rs748493202       rs748767882       rs748811723       rs749059842       rs749584382       rs749852557       rs749950443       rs750452407       rs750507601       rs750813454       rs750959694       rs751058701       rs751068367       rs751316893       rs751893192       rs752438618       rs752452549       rs753320162       rs753554974       rs753907528       rs754245859       rs754754890       rs755064727       rs755188650       rs756094179       rs756248499       rs756529420       rs756810468       rs756863713       rs757152218       rs757401848       rs757531639       rs757613796       rs757745335       rs757969129       rs758030048       rs758231077       rs758574803       rs759018627       rs759539531       rs759645064       rs760006531       rs760099108       rs760752299       rs760843060       rs761097563       rs761695446       rs761746862       rs761851321       rs762235605       rs762479918       rs762595686       rs762655353       rs763063671       rs763082245       rs763300943       rs763887668       rs764022166       rs764213042       rs764484309       rs764691155       rs764903492       rs765297472       rs765469780       rs765821335       rs765916074       rs765919644       rs765931789       rs766259779       rs766307773       rs766631111       rs766714067       rs767380044       rs767476786       rs767529715       rs767703154       rs767708560       rs767758085       rs768109923       rs768329951       rs768479943       rs768531713       rs769365562       rs769732165       rs770142384       rs770671752       rs770687165       rs771014167       rs771428614       rs771863735       rs772574314       rs773092739       rs773759506       rs773913585       rs774143565       rs774320812       rs774372183       rs774871441       rs774960881       rs775021932       rs775482356       rs775512356       rs776008561       rs776080992       rs776173782       rs776479388       rs776975185       rs777046406       rs777363797       rs777551670       rs777606834       rs777888732       rs778252021       rs778509040       rs778818354       rs779645922       rs779776538       rs779814454       rs780133751       rs780508448       rs781298944       rs781352019       rs781716639      

基因表达

基因表达

PIGC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
ACCAATGTCTAAGATGAACGG
58
GCAAAGAACCTTATTGCAATCG
59
GGAACTTGGCTGTGTTGTC
59
TGATGTTCTACCAACCTTTCC
58
AACTCTCGGATCAACCTGG
59
CAGTCTTCAAATTCCTCATGCT
59
GGAACTTGGCTGTGTTGTC
59
TGATGTTCTACCAACCTTTCCT
59
CCAATGTCTAAGATGAACGGG
58
GCAAAGAACCTTATTGCAATCG
59
ATTAAGGGCTGACCTATTGG
57
TTCTGTGTCATGTTCTGGG
57
CGTACTCTTTGCCCTTCTG
58
GCGAATGAGGTAGAATGGAC
58
GGCTTTGTGAGCATTTCAC
57
GTAGCTTGACACAAATTAGCTC
57
TAAGGGCTGACCTATTGGC
59
TTCTGTGTCATGTTCTGGG
57
CAATGTCTAAGATGAACGGGA
57
GCAAAGAACCTTATTGCAATCG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PIGC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

PIGC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000506
Q92535(UniProtKB)
IDA
GO:0003824
Q92535(UniProtKB)
TAS
GO:0005789
Q92535(UniProtKB)
TAS
GO:0006506
Q92535(UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q92535(UniProtKB)
IEA
GO:0016254
Q92535(UniProtKB)
TAS
GO:0017176
Q92535(UniProtKB)
IEA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控PIGC基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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