NBPF1(neuroblastoma breakpoint family, member 1)

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

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基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
更新时间(date_modified)
ucsc码
ena
ccds数据码
uniprot数据码
pubmed代码
mgd码
rgd码
生命科学数据库(lsdb)
更新时间(date modified)
cosmic
mirbase
基因曾用简称(prev symbol)
基因曾用名称(prev name)
homeodb
cosmic
snornabase
bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
酶代码
中间纤维数据库

收起

1p36.13
基因染色体位置图

This gene is a member of the neuroblastoma breakpoint family (NBPF) which consists of dozens of recently duplicated genes primarily located in segmental duplications on human chromosome 1. This gene family has experienced its greatest expansion within the human lineage and has expanded, to a lesser extent, among primates in general. Members of this gene family are characterized by tandemly repeated copies of DUF1220 protein domains. Gene copy number variations in the human chromosomal region 1q21.1, where most DUF1220 domains are located, have been implicated in a number of developmental and neurogenetic diseases such as microcephaly, macrocephaly, autism, schizophrenia, mental retardation, congenital heart disease, neuroblastoma, and congenital kidney and urinary tract anomalies. Altered expression of some gene family members is associated with several types of cancer. This gene family contains numerous pseudogenes. [provided by RefSeq, Apr 2013]

[中文简述(自动翻译):]  此基因是神经母细胞瘤的断点家族(NBPF)由数十个主要位于人染色体1该基因家族在片段重复最近重复基因中的一员经历了人类谱系内其最大的膨胀和扩大,在较小程度上,在一般灵长类动物中。此基因家族成员由DUF1220蛋白质结构域的串联重复拷贝特征。在人类染色体区域1q21.1,大多数DUF1220结构域位于基因拷贝数量的变化,已牵涉许多发育和神经源性疾病如小头畸形,大头畸形,孤独症,精神分裂症,精神发育迟缓,先天性心脏疾病,神经母细胞瘤的,和先天肾气和尿道异常。一些基因家族成员的改变的表达与几种类型的癌症相关联。该基因家族包含了许多假。 [由RefSeq的,2013年4月提供]

NBPF1基因的碱基序列:[NCBI]
NBPF1基因的碱基突变:          

NBPF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
GTTTCTGAGGCAATCTGAAGG
59
GACAATTGGCTGGTGAGAG
58
GTTTCTGAGGCAATCTGAAGG
59
ACAGTGCTTAAGCTCCAGG
59
CATACAGGCATCAACCATATCAG
59
GGACAAGAAGGAAACGGTG
58
GCCCTGATGTAGAAACTTCC
58
AAGATTGGCCATCTTCCTG
57
AATTAGGCTGGGTTTCTTTCTG
59
CCTGAGGAAACTTGAGAGG
57
TTTCTGAGGCAATCTGAAGG
57
GACAATTGGCTGGTGAGAG
58
CCCTGATGTAGAAACTTCCC
57
AAAGATTGGCCATCTTCCTG
58
CCCTGATGTAGAAACTTCCC
57
AAGATTGGCCATCTTCCTG
57
GGAGCTCAGGCAATATAAAGTC
59
CTCCCTTCCCGTAACTTCTC
59
CAACCATACAGGCATCAACC
59
AAGAAGGAAACGGTGGGAG
59
      尚未收录相关数据

NBPF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

NBPF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
Q3BBV0(UniProtKB)
IEA
基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

可能调控NBPF1基因的相关microRNA:     


通路基因列表
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neuroblastoma 0.001628651 6 0 BeFree
Central neuroblastoma 0.001628651 6 0 BeFree
Herpes Simplex Infections 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
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