MRPL55(mitochondrial ribosomal protein L55) 转至新版数据库

基因基本信息

基因基本信息

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    [HGNC]     [GenScript]
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基因名称更名时间(date_name_changed)
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cd
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收起

基因染色体位置

基因染色体位置

1q42.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

Mammalian mitochondrial ribosomal proteins are encoded by nuclear genes and help in protein synthesis within the mitochondrion. Mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) consist of a small 28S subunit and a large 39S subunit. They have an estimated 75% protein to rRNA composition compared to prokaryotic ribosomes, where this ratio is reversed. Another difference between mammalian mitoribosomes and prokaryotic ribosomes is that the latter contain a 5S rRNA. Among different species, the proteins comprising the mitoribosome differ greatly in sequence, and sometimes in biochemical properties, which prevents easy recognition by sequence homology. This gene encodes a 39S subunit protein. Multiple transcript variants encoding two different isoforms were identified through sequence analysis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

[中文简述(自动翻译):]  哺乳动物线粒体核糖体蛋白由核基因编码，并在线粒体内蛋白合成帮助。线粒体核糖体（mitoribosomes）由28S小亚基和大亚基39S的。它们具有约75％的蛋白质，以rRNA的组合物相比，原核核糖体，其中，该比值是相反的。哺乳动物mitoribosomes和原核核糖体之间的另一个区别是，后者包含一个5S rRNA基因。在不同的物种，包括mitoribosome的蛋白质序列中的生化特性，从而防止容易被识别的序列同源性差异很大，有时。这个基因编码39S亚基蛋白。多个转录变异体的编码两个不同的亚型是通过序列分析鉴定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对MRPL55基因的介绍     Wikipedia数据库中对MRPL55基因的介绍

基因序列

基因序列

MRPL55基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

MRPL55基因的碱基突变：           显示全部snp
rs12564763       rs74140963       rs74140965       rs79224560       rs111295721       rs113602555       rs118018346       rs139933214       rs141205409       rs141950039       rs145809265       rs146147136       rs148668437       rs183557984       rs187860837       rs192924501       rs200018997       rs200596637       rs201322831       rs201353580       rs368096867       rs370221036       rs370902163       rs371052237       rs371674227       rs372690646       rs373533039       rs373890223       rs374269957       rs375373877       rs375626807       rs376021962       rs376680919       rs528711259       rs532251809       rs534862518       rs537021688      
rs543832948       rs546279544       rs552362189       rs558737004       rs562024970       rs563610759       rs565885468       rs568392681       rs569624105       rs573089153       rs745466143       rs746166749       rs746702737       rs747405783       rs747426759       rs748821629       rs750175451       rs751426782       rs753502136       rs753942191       rs754473555       rs754559303       rs754956368       rs755882785       rs758299560       rs759693890       rs761629597       rs762932834       rs764114918       rs765181332       rs765396403       rs765729056       rs766639104       rs767415809       rs769399097       rs769989104       rs770610131       rs772608069       rs773798884       rs774948570       rs776829116       rs776934428       rs777609431       rs778455864       rs778543735       rs778915120       rs779771706       rs780899308       rs11706       rs822729       rs822730       rs849749       rs1620734       rs1771454       rs1771475       rs12133342       rs34055261       rs35265990       rs45460992       rs59467911       rs61825156       rs61825157       rs74140967       rs74140968       rs74140969       rs74140970       rs76046017       rs77018872       rs77291864       rs79513918       rs79543795       rs79817796       rs80052991       rs113691540       rs117622323       rs117711049       rs137874015       rs138599574       rs140029160       rs140581823       rs140859182       rs143490418       rs143740148       rs145268311       rs145387968       rs145390684       rs145428615       rs145472694       rs147254812       rs147402072       rs147638822       rs148722106       rs148987410       rs149569641       rs149847629       rs150594727       rs180819388       rs181813477       rs182129789       rs183494607       rs185089116       rs185693461       rs186418998       rs186842353       rs187902641       rs188251627       rs188795184       rs190013026       rs190464062       rs191526991       rs192843635       rs192855009       rs193224962       rs199733107       rs200335007       rs200362514       rs200917701       rs200949325       rs201462317       rs202231885       rs367699495       rs367841406       rs367939550       rs368833177       rs368886405       rs369280812       rs369822909       rs370988261       rs371037782       rs372191384       rs372501762       rs373059867       rs375465686       rs375497713       rs376062141       rs376326476       rs376447034       rs376509414       rs376669706       rs527800882       rs528209948       rs528274101       rs529173030       rs529235767       rs530217849       rs531777524       rs532064515       rs533013369       rs533075658       rs533581997       rs535399578       rs535504614       rs535565199       rs536030241       rs538096822       rs538413037       rs540011039       rs540135400       rs540439793       rs541493381       rs541941781       rs542967045       rs543976511       rs544364117       rs544759966       rs545445766       rs545781094       rs546551667       rs546614873       rs547973618       rs548362814       rs548426218       rs549137040       rs549448210       rs549661432       rs550200216       rs550379961       rs550840228       rs550984191       rs551573503       rs551903832       rs552298999       rs552629542       rs553497363       rs555086580       rs555557877       rs556160229       rs557416846       rs559427383       rs561474643       rs561670235       rs562462952       rs562742355       rs562840522       rs563800714       rs564138710       rs564381343       rs565821877       rs566532763       rs567381085       rs567920925       rs567985512       rs568230183       rs573031862       rs573744490       rs573833324       rs575260934       rs575263144       rs576341801       rs577406925       rs578239595       rs745358216       rs746229064       rs746530931       rs747098495       rs747591546       rs747865245       rs749117344       rs749378901       rs750365626       rs750531949       rs750575616       rs750899436       rs750937743       rs751790535       rs751875581       rs752133760       rs752324414       rs753090966       rs753283254       rs753674205       rs753734434       rs754216816       rs754304484       rs755320601       rs755449524       rs756489204       rs756613514       rs757430934       rs757494185       rs758456605       rs758629856       rs758641251       rs759317636       rs760017667       rs760059311       rs760580888       rs760668851       rs760834966       rs761346857       rs762093972       rs763343529       rs763406280       rs763581703       rs764244705       rs764415712       rs765076268       rs765588877       rs765615382       rs766879446       rs767859474       rs769179183       rs769524052       rs770256037       rs770306920       rs770346197       rs770978588       rs771700664       rs771919827       rs772153126       rs775022732       rs775321014       rs775793719       rs776087176       rs776089641       rs776650212       rs777047506       rs777172068       rs777348095       rs777771261       rs777855484       rs778560462       rs778648546       rs779037206       rs779141290       rs779166398       rs779515723       rs779801198       rs780076218       rs780368764       rs780458628       rs780916740       rs781305486       rs781395086       rs781552083       rs781662961      

基因表达

基因表达

MRPL55基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
GAGAAGTCCAAGGGTTGCT
60
CCATTCCTCCTTACAGCCC
60
CTGTACTGACCACCTCCAC
59
GACAATAGCAAGGACCAAGC
59
CTTATGCACGACTCTACCC
57
GTGTCCAGATCTATGGGCA
59
TTCTGAGAAGTCCAAGGGT
58
GTGGAGGTGGTCAGTACAG
59
CTTATGCACGACTCTACCC
57
GTGTCCAGATCTATGGGCA
59
TAGCAGGAAAGGAGAGGGA
59
GTGGAGGTGGTCAGTACAG
59
CTGTACTGACCACCTCCAC
59
CAATAGCAAGGACCAAGCAG
59
GATGCCCATAGATCTGGAC
57
TACTCCTTCCTCGACTGGA
59
CTTATGCACGACTCTACCC
57
GTGTCCAGATCTATGGGCA
59
GCTTATGCACGACTCTACC
58
GTGTCCAGATCTATGGGCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

MRPL55基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

MRPL55基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003735
Q7Z7F7(UniProtKB)
ISS
GO:0005743
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0005762
Q7Z7F7(UniProtKB)
ISS
GO:0006412
Q7Z7F7(UniProtKB)
ISS
GO:0070125
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0070126
Q7Z7F7(UniProtKB)
TAS
GO:0005840
X6R631(UniProtKB)
IEA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控MRPL55基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关文献

基因相关文献

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基因相关服务

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