LINC01475(long intergenic non-protein coding RNA 1475) 转至新版数据库

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
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vega基因码
ensembl基因码
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基因家族(gene family)
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基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
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cosmic
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merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
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cd
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酶代码
中间纤维数据库

收起

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

基因序列

基因序列

LINC01475基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

LINC01475基因的碱基突变：           显示全部snp
rs1548962       rs1548963       rs1548964       rs6584281       rs6584282       rs6584283       rs7085798       rs7899176       rs7916751       rs7917446       rs9919490       rs10748783       rs10786558       rs10883362       rs10883363       rs10883364       rs10883365       rs10883366       rs10883367       rs10883368       rs10883369       rs10883370       rs10883371       rs10883372       rs10883373       rs11190135       rs11190136       rs11190137       rs11190138       rs11190139       rs11190140       rs11190141       rs11596008       rs11815803       rs12259109       rs12360459       rs12412391      
rs34330955       rs58031424       rs60386053       rs60547850       rs74707072       rs75030992       rs75208765       rs76908010       rs76934209       rs77114732       rs77127982       rs77486609       rs78606180       rs111358122       rs111367973       rs111722150       rs111999795       rs112082268       rs112149771       rs112272152       rs112389530       rs112508067       rs112630333       rs112776588       rs112831030       rs113226849       rs113461780       rs113508065       rs113727501       rs113902900       rs114270725       rs114516189       rs115195440       rs115608311       rs115883928       rs115885876       rs116166559       rs116259350       rs117464390       rs117563730       rs117737046       rs117903554       rs138218750       rs138742271       rs139220444       rs139485787       rs140414433       rs140569732       rs141759978       rs141825036       rs142653103       rs142723285       rs143896884       rs144168277       rs144206000       rs144642762       rs144912651       rs147735527       rs147777444       rs148452416       rs149900228       rs150428133       rs151294691       rs180742229       rs181239945       rs182105542       rs182686185       rs183320795       rs183354448       rs183642886       rs185072369       rs185249539       rs185401163       rs186308386       rs186647900       rs186727197       rs186852925       rs187020605       rs188719223       rs188771427       rs190004775       rs190240335       rs190372876       rs191105014       rs191738640       rs191894388       rs192084797       rs192665678       rs193272477       rs200742712       rs201021558       rs368583740       rs369518738       rs370818353       rs373409717       rs374412966       rs375272008       rs375600503       rs527307544       rs527490619       rs528428004       rs528655082       rs528666968       rs528887456       rs528900229       rs529000986       rs531134909       rs531405632       rs532475076       rs532534287       rs534172095       rs535405488       rs535972876       rs536009531       rs537060855       rs538070779       rs538081685       rs538617651       rs539811431       rs539972554       rs540399062       rs541622720       rs541705799       rs541765445       rs542171691       rs542387268       rs543206740       rs543285587       rs544159309       rs544537735       rs544742237       rs545002144       rs545919722       rs545968269       rs546151217       rs546688600       rs546848891       rs547879512       rs547889438       rs548119079       rs549464258       rs549769501       rs550408144       rs550719202       rs550730710       rs551854774       rs552092396       rs553167190       rs553652912       rs553772982       rs554440699       rs554864795       rs556891763       rs557760763       rs557974283       rs558163548       rs558444875       rs559417804       rs559481068       rs560030437       rs560498096       rs561179358       rs561209176       rs561715292       rs561788914       rs562392639       rs562959096       rs563454971       rs563786131       rs563980759       rs564071561       rs565049326       rs565367810       rs566331912       rs566960989       rs568743822       rs569201373       rs569222093       rs570336723       rs572169668       rs572213301       rs572476096       rs572484749       rs573735069       rs573857516       rs576091513       rs576196162       rs576358294       rs576366717       rs576395581       rs576452586       rs577573810       rs577634346       rs752134333       rs753095948       rs758800734       rs760605961       rs765619312       rs771892947       rs773205247       rs776189540       rs778070729      

基因表达

基因表达

LINC01475基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
GACTAGGGAGACTTGGTTGG
60
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
TAAGTAACGTCTTATGCGGC
58
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
AGGACTAGGGAGACTTGGT
59
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
ACTAGGGAGACTTGGTTGG
58
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
TTAAGTAACGTCTTATGCGGC
59
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
AAGTAACGTCTTATGCGGC
58
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC01475基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

LINC01475基因的本体（GO）信息：

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控LINC01475基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ulcerative Colitis 0.12 3 2 GWASCAT
Crohn Disease 0.12 4 3 GWASCAT
Colorectal Cancer 0.12 1 1 GWASCAT

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