HIST2H2AC(histone cluster 2, H2ac) 转至新版数据库

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

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基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
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ena
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cosmic
snornabase
bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
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中间纤维数据库

收起

基因染色体位置

基因染色体位置

1q21.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

Histones are basic nuclear proteins that are responsible for the nucleosome structure of the chromosomal fiber in eukaryotes. Two molecules of each of the four core histones (H2A, H2B, H3, and H4) form an octamer, around which approximately 146 bp of DNA is wrapped in repeating units, called nucleosomes. The linker histone, H1, interacts with linker DNA between nucleosomes and functions in the compaction of chromatin into higher order structures. This gene is intronless and encodes a member of the histone H2A family. [provided by RefSeq, Jul 2008]

[中文简述(自动翻译):]  组蛋白是负责在真核生物染色体纤维的核小体结构基本核蛋白质。每四个核心组蛋白中的两个分子（H2A，H2B，H3和H4）形成八聚体，其周围约146的DNA的碱基被包裹在重复单元，称为核小体。接头组蛋白，H1与染色质成高阶结构的压实核小体和功能之间的接头DNA相互作用。这种基因是无内含子并且编码所述组蛋白H2A家族的一个成员。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对HIST2H2AC基因的介绍     Wikipedia数据库中对HIST2H2AC基因的介绍

基因序列

基因序列

HIST2H2AC基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

HIST2H2AC基因的碱基突变：           显示全部snp
rs12118591       rs111633198       rs138080437       rs140091148       rs140229597       rs142055068       rs144294903       rs144823175       rs146960466       rs148089352       rs149336231       rs150148333       rs185605054       rs190206062       rs190281620       rs193136269       rs200013197       rs200774928       rs201477575       rs201558423       rs201958494       rs367544209       rs368577226       rs369063265       rs369206070       rs369357105       rs369503644       rs369845741       rs370085338       rs370401891       rs370508121       rs370650141       rs371300753       rs371801534       rs372821056       rs373049405       rs374564671      
rs374804352       rs375077126       rs375616398       rs375758565       rs376357983       rs376897558       rs377603650       rs587610486       rs587621321       rs587626534       rs587637940       rs587640985       rs587683414       rs587686528       rs587700980       rs587706583       rs587707477       rs587741991       rs587763676       rs747386525       rs781788931       rs781790628       rs781792194       rs781796868       rs781811346       rs781821532       rs781823212       rs781824753       rs781827180       rs781833742       rs781865504       rs781870400       rs781873375       rs781885699       rs781890352       rs781892338       rs781898437       rs781900619       rs781902280       rs781906151       rs781907745       rs781909102       rs781925694       rs781934299       rs781935199       rs781940300       rs781946038       rs781948997       rs781971582       rs781979013       rs781984344       rs781987685       rs781989889       rs781993619       rs782006737       rs782009982       rs782010822       rs782027953       rs782031575       rs782050874       rs782068627       rs782081433       rs782087768       rs782092016       rs782095453       rs782106053       rs782125224       rs782127110       rs782127378       rs782134041       rs782142940       rs782145762       rs782147072       rs782147659       rs782155312       rs782156323       rs782157518       rs782162698       rs782165200       rs782168015       rs782185819       rs782190582       rs782192607       rs782198256       rs782198898       rs782204405       rs782207998       rs782217796       rs782219439       rs782225948       rs782227220       rs782232831       rs782243784       rs782251477       rs782263517       rs782280928       rs782291122       rs782305330       rs782307778       rs782312972       rs782327716       rs782343953       rs782348465       rs782351248       rs782381196       rs782387102       rs782388939       rs782394429       rs782403243       rs782404305       rs782423198       rs782425540       rs782428337       rs782459770       rs782459847       rs782460769       rs782460968       rs782476128       rs782491669       rs782493808       rs782496981       rs782500633       rs782501986       rs782502396       rs782503721       rs782517095       rs782524480       rs782539059       rs782543953       rs782545100       rs782555003       rs782576881       rs782580161       rs782582886       rs782588788       rs782611766       rs782623393       rs782646084       rs782651965       rs782654118       rs782671298       rs782677835       rs782678114       rs782680378       rs782687284       rs782688416       rs782694721       rs782695523       rs782715473       rs782716127       rs782724104       rs782726201       rs782744770       rs782745115       rs782746050       rs782746255       rs782749776       rs782751689       rs782753556       rs782756090       rs782760624       rs782769754       rs782778462       rs782779419       rs782783751       rs782784144       rs782788423       rs782793004       rs782794882       rs782795286       rs782800981       rs1042632       rs3182091       rs55885412       rs74124040       rs75424586       rs111368656       rs112910663       rs114230738       rs115305326       rs116276552       rs116782118       rs138433553       rs139304638       rs140727892       rs141403958       rs142503632       rs143692382       rs146619988       rs149251471       rs150539122       rs150921672       rs184008606       rs184503966       rs187071457       rs187708644       rs191515367       rs192110294       rs199512043       rs199780007       rs200684835       rs200765893       rs201379362       rs201449104       rs201453344       rs201559232       rs201793370       rs202141121       rs369469320       rs370228830       rs372480757       rs372630930       rs373393592       rs373633210       rs373716356       rs373742230       rs375088715       rs375883729       rs376419949       rs376623528       rs377083472       rs587596648       rs587603477       rs587603929       rs587616289       rs587617486       rs587620236       rs587621407       rs587628021       rs587634244       rs587639035       rs587639881       rs587645168       rs587647436       rs587652523       rs587658020       rs587661322       rs587664229       rs587668492       rs587674008       rs587678791       rs587684290       rs587687341       rs587690397       rs587699307       rs587704981       rs587708927       rs587720293       rs587725986       rs587731296       rs587737729       rs587738039       rs587740911       rs587743437       rs587748591       rs587759679       rs587763808       rs587764962       rs781785808       rs781787279       rs781788245       rs781802233       rs781815953       rs781842928       rs781856672       rs781863545       rs781868981       rs781897604       rs781925795       rs781982772       rs781994580       rs781997601       rs782002719       rs782004502       rs782011765       rs782032496       rs782036956       rs782048791       rs782061334       rs782072369       rs782074278       rs782080888       rs782081628       rs782085895       rs782089065       rs782111935       rs782113427       rs782138507       rs782168280       rs782189207       rs782220549       rs782225184       rs782231633       rs782257155       rs782261058       rs782276340       rs782281757       rs782320887       rs782324993       rs782338350       rs782346008       rs782346666       rs782370386       rs782371009       rs782377950       rs782404356       rs782424086       rs782438714       rs782445733       rs782453890       rs782483324       rs782494302       rs782520240       rs782523925       rs782528970       rs782554715       rs782557792       rs782584395       rs782590086       rs782597873       rs782600740       rs782606845       rs782607403       rs782633896       rs782666605       rs782690576       rs782703004       rs782703582       rs782705248       rs782745236       rs782747595       rs782750337       rs782770398       rs782772669       rs782796989      

基因表达

基因表达

HIST2H2AC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
CTCGGGACAACAAGAAGAC
58
CTTGTTCAGTTCCTCGTCG
59
CATCATCCCTCGTCACCTC
60
CAGCAGCTTGTTCAGTTCC
60
CTCGGGACAACAAGAAGAC
58
TTGTTCAGTTCCTCGTCGT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

HIST2H2AC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

HIST2H2AC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000786
Q16777(UniProtKB)
IEA
GO:0000790
Q16777(UniProtKB)
IBA
GO:0003674
Q16777(UniProtKB)
ND
GO:0003677
Q16777(UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q16777(UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q16777(UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q16777(UniProtKB)
IDA
GO:0006342
Q16777(UniProtKB)
IBA
GO:0008150
Q16777(UniProtKB)
ND
GO:0046982
Q16777(UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q16777(UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q16777(UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q16777(UniProtKB)
IDA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控HIST2H2AC基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glioma 0.000271442 1 0 BeFree
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Thyroiditis 0.000271442 1 0 BeFree
Arthritis, Collagen-Induced 0.000271442 1 0 BeFree

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