ATOH1(atonal homolog 1 (Drosophila))

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

更多...

基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
更新时间(date_modified)
ucsc码
ena
ccds数据码
uniprot数据码
pubmed代码
mgd码
rgd码
生命科学数据库(lsdb)
更新时间(date modified)
cosmic
mirbase
基因曾用简称(prev symbol)
基因曾用名称(prev name)
homeodb
cosmic
snornabase
bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
酶代码
中间纤维数据库

收起

基因染色体位置

基因染色体位置

4q22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This protein belongs to the basic helix-loop-helix (BHLH) family of transcription factors. It activates E-box dependent transcription along with E47. [provided by RefSeq, Jul 2008]

[中文简述(自动翻译):]  这种蛋白质属于碱性螺旋 - 环 - 螺旋（BHLH）家族的转录因子。它激活E-盒依赖的转录与E47一起。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对ATOH1基因的介绍     Wikipedia数据库中对ATOH1基因的介绍

基因序列

基因序列

ATOH1基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

ATOH1基因的碱基突变：           显示全部snp
rs10009502       rs10015253       rs11312657       rs34543561       rs35182771       rs35227734       rs56679908       rs56905352       rs63317861       rs71599294       rs71599295       rs72877869       rs72877870       rs74481660       rs77450992       rs79024012       rs79231081       rs112960971       rs113356228       rs115448994       rs115524348       rs116680649       rs138388359       rs139664764       rs139853318       rs140137565       rs140329582       rs141309756       rs142131282       rs142148189       rs142207012       rs142870406       rs143419348       rs144338372       rs145270864       rs145666261       rs145839632      
rs149240097       rs149770942       rs151169302       rs151192289       rs182403394       rs183932095       rs184814816       rs186405303       rs187105554       rs187892243       rs188485171       rs191202352       rs192928955       rs199769164       rs199789935       rs200054812       rs200577041       rs200758862       rs200824879       rs201089265       rs201443762       rs201509026       rs201671383       rs202025292       rs368093381       rs368475681       rs369636991       rs369720969       rs369884611       rs370454058       rs371160490       rs371446004       rs373671734       rs373713422       rs373777032       rs373848308       rs374062652       rs375159413       rs375846661       rs376429461       rs376812790       rs377287614       rs377695460       rs527373023       rs528569052       rs529589968       rs531025926       rs531140425       rs531219492       rs532384977       rs533693311       rs533752955       rs535401753       rs536528718       rs537422021       rs537533457       rs539441425       rs540125901       rs540701286       rs540814845       rs542168597       rs542772533       rs543328241       rs543968482       rs544693691       rs545389394       rs547000265       rs547129931       rs547309428       rs547998659       rs548738966       rs548916062       rs550918682       rs551150298       rs551234575       rs552110550       rs552999493       rs553793713       rs555564794       rs555824120       rs556510158       rs557522675       rs557559439       rs557705687       rs558178668       rs558292896       rs559472578       rs560367276       rs562102963       rs562808631       rs562848117       rs564652722       rs566213307       rs566320580       rs567118942       rs567430435       rs568169468       rs571058320       rs571120608       rs571206225       rs573835433       rs573894468       rs574192375       rs575370580       rs575840330       rs577437178       rs578065567       rs745410157       rs745424790       rs745854214       rs746440208       rs746512569       rs746708814       rs747125484       rs747363887       rs747853211       rs748168203       rs748213328       rs748258469       rs748409858       rs748643346       rs748860929       rs749304452       rs749547808       rs749567383       rs749684990       rs750068829       rs750143677       rs750448934       rs750699452       rs750940636       rs751008859       rs751291709       rs751381751       rs751879356       rs752452091       rs752679675       rs752995405       rs753229261       rs753590807       rs753993575       rs754224658       rs754425733       rs754504277       rs754926613       rs755154222       rs755267235       rs755620274       rs756274872       rs756514006       rs756527546       rs756563436       rs756866699       rs757248475       rs757448327       rs757670696       rs758178289       rs758188041       rs759213179       rs759242809       rs759383481       rs759405519       rs759699829       rs760041029       rs760109556       rs760381446       rs760657587       rs760930701       rs761088395       rs761125136       rs761216588       rs761593903       rs761788317       rs762223368       rs762550204       rs762870776       rs763102271       rs763307747       rs763702912       rs763789767       rs764053065       rs764478508       rs764742976       rs764885802       rs765205948       rs765269254       rs765932446       rs766059965       rs766737827       rs767094967       rs767341255       rs767465667       rs767661587       rs767718503       rs767899405       rs768355954       rs768629371       rs768701507       rs768718867       rs769137416       rs769323804       rs769357921       rs769516625       rs769686707       rs769812244       rs770072676       rs770498732       rs770709819       rs770793566       rs771104707       rs771217805       rs771487306       rs771645916       rs772119264       rs772384185       rs772739464       rs772754916       rs772815944       rs773229402       rs773259389       rs773536945       rs773671771       rs773761668       rs773870667       rs774159886       rs774333038       rs774637706       rs774732105       rs775248036       rs775373267       rs775797343       rs776038071       rs776122789       rs776252021       rs776442303       rs777474577       rs777481278       rs777540023       rs777576567       rs778722533       rs778916265       rs779104212       rs779299219       rs779471383       rs780137669       rs780142317       rs780656881       rs780811958       rs780830478       rs780982977       rs781377479       rs781645737       rs781726770       rs781760374      

基因表达

基因表达

ATOH1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
CAACGACAAGAAGCTGTCC
59
GGCGTTGATGTAGATTTGGG
59
GTTCAACAACGACAAGAAGC
58
GATGTAGATTTGGGCCATCTG
59
AACGACAAGAAGCTGTCCA
60
AGGCGTTGATGTAGATTTGG
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响类型
PubMed链接
HES6
Activation
17826772
MUC2
Activation
17000673

基因本体信息

ATOH1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

ATOH1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000978
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0001077
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0001764
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q92858(UniProtKB)
TAS
GO:0005634
Q92858(UniProtKB)
ISS
GO:0006366
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0007219
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0007411
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0007417
Q92858(UniProtKB)
TAS
GO:0021987
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0031490
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0042472
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0042667
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0042668
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0043066
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0045609
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0045666
Q92858(UniProtKB)
ISS
GO:0045944
Q92858(UniProtKB)
IEA
GO:0046983
Q92858(UniProtKB)
IEA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控ATOH1基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Medulloblastoma 0.122171535 8 0 BeFree_CTD_human
Colonic Neoplasms 0.005720142 3 0 BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Merkel cell carcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Stomach Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant tumor of colon 0.001628651 6 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Carcinogenesis 0.001085767 4 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Adenoma 0.000271442 1 0 BeFree
Arteriosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Atherosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoid Tumor 0.000271442 1 0 BeFree
Ulcerative Colitis 0.000271442 1 0 BeFree
Myocardial Infarction 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoid, Goblet Cell 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoid tumor no ICD-O subtype 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Respiratory Failure 0.000271442 1 0 BeFree
Cerebellar Liponeurocytoma 0.000271442 1 0 BeFree

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