NKX2-3(NK2 homeobox 3) 转至新版数据库

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

更多...

基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
更新时间(date_modified)
ucsc码
ena
ccds数据码
uniprot数据码
pubmed代码
mgd码
rgd码
生命科学数据库(lsdb)
更新时间(date modified)
cosmic
mirbase
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基因曾用名称(prev name)
homeodb
cosmic
snornabase
bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
酶代码
中间纤维数据库

收起

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a homeodomain-containing transcription factor. The encoded protein is a member of the NKX family of homeodomain transcription factors. Studies of similar proteins in mouse and rat have indicated a potential role in cellular differentiation.[provided by RefSeq, Mar 2010]

[中文简述(自动翻译):]  该基因编码一个包含同源结构域的转录因子。所编码的蛋白质是NKX家族的同源结构域转录因子的成员。已在小鼠和大鼠类似蛋白的研究表明在细胞分化中的潜在作用。[由RefSeq的，2010年3月提供]

OMIM数据库中对NKX2-3基因的介绍     Wikipedia数据库中对NKX2-3基因的介绍

基因序列

基因序列

NKX2-3基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

NKX2-3基因的碱基突变：           显示全部snp
rs9919490       rs10883369       rs10883370       rs10883371       rs10883372       rs10883373       rs11190140       rs11190141       rs34330955       rs58031424       rs75208765       rs113226849       rs113727501       rs113902900       rs114270725       rs115195440       rs115885876       rs116166559       rs117563730       rs139485787       rs140414433       rs141759978       rs144168277       rs144912651       rs147777444       rs180742229       rs182105542       rs185401163       rs186727197       rs186852925       rs188719223       rs191738640       rs191894388       rs192084797       rs200742712       rs368583740       rs375600503      
rs532475076       rs535405488       rs536009531       rs537060855       rs539972554       rs541622720       rs541705799       rs544159309       rs544537735       rs545919722       rs545968269       rs546151217       rs547889438       rs549769501       rs550730710       rs551854774       rs553772982       rs554440699       rs556891763       rs558163548       rs560030437       rs561715292       rs562392639       rs563980759       rs564071561       rs565049326       rs568743822       rs570336723       rs572169668       rs572213301       rs572476096       rs576091513       rs576358294       rs576395581       rs752134333       rs753095948       rs758800734       rs760605961       rs765619312       rs771892947       rs773205247       rs776189540       rs778070729       rs884144       rs888208       rs5787350       rs7893840       rs7906496       rs7908704       rs7911680       rs12247368       rs41290504       rs77927889       rs78122843       rs78482497       rs78952335       rs79254832       rs79873574       rs80097148       rs113005317       rs113154688       rs113459553       rs114104062       rs114693671       rs114975224       rs115703056       rs116913647       rs138803080       rs141309484       rs141988959       rs145068124       rs145887258       rs151053941       rs181369263       rs182103937       rs184260740       rs184601313       rs187207271       rs188570312       rs189630690       rs191959975       rs199963044       rs200446284       rs200965740       rs201429667       rs368108882       rs368978920       rs369827413       rs369954020       rs370885897       rs372618389       rs372919519       rs373486169       rs373715351       rs374176845       rs374289879       rs374871429       rs376439342       rs530852957       rs531000247       rs531226281       rs531515158       rs534464400       rs536589302       rs537197999       rs537256669       rs538341331       rs541103116       rs543586772       rs545418165       rs546714052       rs547068432       rs549293155       rs549773276       rs551646131       rs552719082       rs553022624       rs554057824       rs555693088       rs558026554       rs560009402       rs560810054       rs562853489       rs563597346       rs563776022       rs565177972       rs565336308       rs565804015       rs567361749       rs567374127       rs567506495       rs568144220       rs571594526       rs573684783       rs573741663       rs575568344       rs576303363       rs577561583       rs577574687       rs745817982       rs745873047       rs746333686       rs746598095       rs746759518       rs746943439       rs747305522       rs747597283       rs747830420       rs747881733       rs748839062       rs749398566       rs750287150       rs750699538       rs750935219       rs751126380       rs751674367       rs751923067       rs752660285       rs752715420       rs753335295       rs753716273       rs754498950       rs755039175       rs755988006       rs756121467       rs756508384       rs758034960       rs758064188       rs758420651       rs758475838       rs759212017       rs759387669       rs759745747       rs760224143       rs761085077       rs761138360       rs761471222       rs761522086       rs762144815       rs762172308       rs762381956       rs763183769       rs763531769       rs763733375       rs764133324       rs764267338       rs765015563       rs765275806       rs766096722       rs766938472       rs767349644       rs767956783       rs768042683       rs769597903       rs769898066       rs770020968       rs770192462       rs770369049       rs770813790       rs770886001       rs771228690       rs771367473       rs771742879       rs771906008       rs772330186       rs772458422       rs772952098       rs773006927       rs773560961       rs773661045       rs773733656       rs774453161       rs774776737       rs775802186       rs775857325       rs776158145       rs776286787       rs776348704       rs776720958       rs776844475       rs777007213       rs777145069       rs777346568       rs777388553       rs777591962       rs777930638       rs777981956       rs778837014       rs779157693       rs779916074       rs780254468       rs780669703       rs781232429       rs781538743      

基因表达

基因表达

NKX2-3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
AGGAACATGAAGAGGAGCC
59
AGACTTCTTCAGCTGGCAG
60
AAGGAACATGAAGAGGAGCC
60
AGACTTCTTCAGCTGGCAG
60
AGGAACATGAAGAGGAGCC
59
GAGACTTCTTCAGCTGGCA
60
AGGAACATGAAGAGGAGCC
59
GAGACTTCTTCAGCTGGCA
60
AGGAACATGAAGAGGAGCC
59
AGACTTCTTCAGCTGGCAG
60
AAGGAACATGAAGAGGAGCC
60
AGACTTCTTCAGCTGGCAG
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响类型
PubMed链接
EGR1
Unknown
21968973

基因本体信息

NKX2-3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

NKX2-3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
A0A087WVU3(UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A087WVU3(UniProtKB)
IEA
GO:0043565
A0A087WVU3(UniProtKB)
IEA
GO:0001776
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0002317
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0003674
Q8TAU0(UniProtKB)
ND
GO:0005575
Q8TAU0(UniProtKB)
ND
GO:0005634
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0006641
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0008150
Q8TAU0(UniProtKB)
ND
GO:0022612
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0030225
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0042127
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0042475
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0043367
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0043565
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0048535
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0048536
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0048541
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0048621
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA
GO:0050900
Q8TAU0(UniProtKB)
IEA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控NKX2-3基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Crohn Disease 0.274386036 21 11 BeFree_CTD_human_GAD_GWASCAT_LHGDN
Ulcerative Colitis 0.257816813 16 2 BeFree_CTD_human_GAD_GWASCAT_LHGDN
Inflammatory Bowel Diseases 0.006905599 9 1 BeFree_GAD
Colonic Diseases 0.002367032 1 0 GAD
Ileal Diseases 0.002367032 1 0 GAD
Rectal Fistula 0.002367032 1 0 GAD
Irritable Bowel Syndrome 0.000542884 2 1 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma, Neuroendocrine 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of liver 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

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