MFAP5(microfibrillar associated protein 5)

基因基本信息

基因基本信息

基因简称(symbol)
    [HGNC]     [GeneCards]     [NCBI]
基因种类(locus group)
同源简称(alias symbol)
基因家族代码(gene_family_id)
    [HGNC]     [GenScript]
omim代码
entrez码
    [Vega]
vega基因码
ensembl基因码
    [Ensembl]
基因家族(gene family)
refseq数据库代号

更多...

基因种类(locus_type)
基因名称状态(status)
location_sortable
同源基因名称(alias name)
基因名称批准使用时间(date_approved_reserved)
基因简称更名时间(date_symbol_changed)
基因名称更名时间(date_name_changed)
更新时间(date_modified)
ucsc码
ena
ccds数据码
uniprot数据码
pubmed代码
mgd码
rgd码
生命科学数据库(lsdb)
更新时间(date modified)
cosmic
mirbase
基因曾用简称(prev symbol)
基因曾用名称(prev name)
homeodb
cosmic
snornabase
bioparadigms slc
orphanet
假基因信息(pseudogeneorg)
horde id
merops
imgt
iuphar
kznf基因类别
mamit-trnadb
cd
LncRNA数据库
酶代码
中间纤维数据库

收起

基因染色体位置

基因染色体位置

12p13.1-p12.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a 25-kD microfibril-associated glycoprotein which is a component of microfibrils of the extracellular matrix. The encoded protein promotes attachment of cells to microfibrils via alpha-V-beta-3 integrin. Deficiency of this gene in mice results in neutropenia. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2014]

[中文简述(自动翻译):]  该基因编码一个25 kD的微纤维相关的糖蛋白是细胞外基质的微纤维的组分。所编码的蛋白质促进经由字母V-β-3整联细胞附着到微纤维。该基因在小鼠缺乏导致中性粒细胞减少。在多个备选的转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的，2014年7月提供]

OMIM数据库中对MFAP5基因的介绍     Wikipedia数据库中对MFAP5基因的介绍

基因序列

基因序列

MFAP5基因的碱基序列：[NCBI]

基因突变

基因突变

MFAP5基因的碱基突变：           显示全部snp
rs14541       rs1966728       rs2043942       rs2043943       rs2289382       rs2289383       rs2289384       rs2289385       rs4132450       rs6487313       rs6487315       rs6487316       rs7953624       rs7979018       rs10505737       rs10743446       rs11046589       rs11359613       rs11544165       rs11611870       rs12298998       rs12301158       rs12302099       rs12303273       rs12321016       rs12322866       rs12322918       rs12809190       rs12811017       rs12811351       rs12812133       rs12812305       rs12812856       rs12813004       rs12815106       rs12817900       rs12827904      
rs12833793       rs13378100       rs16917731       rs17802192       rs28372697       rs34022782       rs34033038       rs34470474       rs34716337       rs34720246       rs34817631       rs34976145       rs34978963       rs35230480       rs35253464       rs35327409       rs35337965       rs35362262       rs35365089       rs35379247       rs35532123       rs35565662       rs35701636       rs35742897       rs35818804       rs35836611       rs35866343       rs35896395       rs56176308       rs56776129       rs56941823       rs57047982       rs58777503       rs60637259       rs61012844       rs61055144       rs61354288       rs61374494       rs61919236       rs61919237       rs71042401       rs71045203       rs71447524       rs71447525       rs71447526       rs71447527       rs71451973       rs71451975       rs71451976       rs73244411       rs73244416       rs73244431       rs73245451       rs73245460       rs74499709       rs74879163       rs75125758       rs75520414       rs76089570       rs76219391       rs77861348       rs78107407       rs78113649       rs78684818       rs78721182       rs79153086       rs79156549       rs79158507       rs79194562       rs79814267       rs79874025       rs111386353       rs111610144       rs111702709       rs111723774       rs111800134       rs112013053       rs112238607       rs112255235       rs112311404       rs112568704       rs113302897       rs113348545       rs113432162       rs113956502       rs114325777       rs115092457       rs115280610       rs115318642       rs115433066       rs115508526       rs115809803       rs116141853       rs116223903       rs116772204       rs116938649       rs117119485       rs117248967       rs117523212       rs117642030       rs117729584       rs117750228       rs139121743       rs139330366       rs141186777       rs141521570       rs142380998       rs143508503       rs144272282       rs144375450       rs145592970       rs146558268       rs146657877       rs147238554       rs148770543       rs148879406       rs150351081       rs150874917       rs151240610       rs189767998       rs191520619       rs192822432       rs199578843       rs200123536       rs200873288       rs200901660       rs201084452       rs201269065       rs201597525       rs201631388       rs202210095       rs367689533       rs368365640       rs369182642       rs370396141       rs370511429       rs370536847       rs370658614       rs371092984       rs371340321       rs371748121       rs372223418       rs372458974       rs372917052       rs373117460       rs373540219       rs373632449       rs374268670       rs374890052       rs375006835       rs375116825       rs375462666       rs375533192       rs376156013       rs376232287       rs376251723       rs376563315       rs376830567       rs377107030       rs397767188       rs576618912       rs724159961       rs727502791       rs745427333       rs745489758       rs745889232       rs746192110       rs746269438       rs746349917       rs746855190       rs747344832       rs747401403       rs747670357       rs747879550       rs747968043       rs748219915       rs748303783       rs748390790       rs748768721       rs748795143       rs748846088       rs748966979       rs748980355       rs749178519       rs749233010       rs749509446       rs749565352       rs749623760       rs749703503       rs749745813       rs750294101       rs750646954       rs750913134       rs751323740       rs751413606       rs751525471       rs751902968       rs752036635       rs752124786       rs752193471       rs752465187       rs752617323       rs752720635       rs752770204       rs753225796       rs753275305       rs753315025       rs753493759       rs754032531       rs754191345       rs755009325       rs755147270       rs755549851       rs755616488       rs755710103       rs755761395       rs755970123       rs756057687       rs756318802       rs756471420       rs756494536       rs756582294       rs756712055       rs757129390       rs757481739       rs757570071       rs757660053       rs757670083       rs758073813       rs758140657       rs758260422       rs758477431       rs758826282       rs758835981       rs758922669       rs759334210       rs759662203       rs760158365       rs760474089       rs760702942       rs760790461       rs760884841       rs761251019       rs761322383       rs761664563       rs761990899       rs762321212       rs762409024       rs762418896       rs762474996       rs762891434       rs762907633       rs763031215       rs763237974       rs764239157       rs764640506       rs764711127       rs764801456       rs764941480       rs765205871       rs765680211       rs765899845       rs766176657       rs766827859       rs767148092       rs767319138       rs767358373       rs767408914       rs767668033       rs767940141       rs768399987       rs768600507       rs768861127       rs768885285       rs768930257       rs769322085       rs769346183       rs769457817       rs769567717       rs769648040       rs769921511       rs769973987       rs769980641       rs770361229       rs770425375       rs770449017       rs770596025       rs770637878       rs770640929       rs771401299       rs771689915       rs771757694       rs771929813       rs771981445       rs772309783       rs772400948       rs772494615       rs772721310       rs772779437       rs772906785       rs773254554       rs773321613       rs773553899       rs773928263       rs774309537       rs774406233       rs774489509       rs774591271       rs774701202       rs775163759       rs775567704       rs775655768       rs775698731       rs775928730       rs776038725       rs776320796       rs776413783       rs776693072       rs776701699       rs777242064       rs777330893       rs777981165       rs778001824       rs778394071       rs778672181       rs778887600       rs779140863       rs779274678       rs779350260       rs779443535       rs779463853       rs779524438       rs779718660       rs779901395       rs780048039       rs780174097       rs780397352       rs780493386       rs780553829       rs780571949       rs780574974       rs781057442       rs781107676       rs781319291       rs781404692       rs781438753       rs781522532       rs781681464      

基因表达

基因表达

MFAP5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向引物Tm值
反向引物序列
反向引物Tm值
rank
ATGCTTCACCAGTTTACGA
57
ATAGCTTCGTGTTCCTTACAG
58
TATGCTTCACCAGTTTACGA
57
TAGCTTCGTGTTCCTTACAG
57
ATGCTTCACCAGTTTACGAC
59
ATAGCTTCGTGTTCCTTACAG
58
GGTCAATAGTCAACGAGGAG
58
GGATCATTCACCAGATTAGGA
57
TCACAGAAGATCCTAATCTGGT
59
TGGAAGGTGCAATATCAGC
58
GGGTCAATAGTCAACGAGG
58
GGATCATTCACCAGATTAGGA
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

MFAP5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 溶酶体
  • 内涵体
  • 细胞核
  • 细胞质
  • 液泡
  • 细胞膜
  • 细胞外基质
  • 内质网
  • 线粒体
  • 高尔基体
  • 细胞骨架

MFAP5基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001527
B3KW70(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
F5GYX4(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
F5H1C0(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
F5H2W4(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
F5H413(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
F5H7Z2(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
H0YG03(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
H0YGS3(UniProtKB)
IEA
GO:0001527
Q13361(UniProtKB)
IEA
GO:0005201
Q13361(UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q13361(UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q13361(UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q13361(UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q13361(UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q13361(UniProtKB)
TAS
GO:0030198
Q13361(UniProtKB)
TAS
GO:0043206
Q13361(UniProtKB)
IEA
GO:0060216
Q13361(UniProtKB)
ISS

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控MFAP5基因的相关microRNA：     

基因通路图

基因通路图

基因的通路属性图
通路基因列表

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
AORTIC ANEURYSM, FAMILIAL THORACIC 9 0.12 1 0 UNIPROT
Obesity 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Cholangiocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital aneurysm of ascending aorta 0.000271442 1 0 BeFree
SIMPSON-GOLABI-BEHMEL SYNDROME, TYPE 1 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree

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