ZZEF1 (zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1)

symbol:
ZZEF1
locus group:
protein-coding gene
location:
17p13.2
gene_family:
Zinc fingers, ZZ-type|EF-hand domain containing
alias symbol:
KIAA0399|ZZZ4|FLJ10821
alias name:
None
entrez id:
23140
ensembl gene id:
ENSG00000074755
ucsc gene id:
uc002fxe.4
refseq accession:
NM_015113
hgnc_id:
HGNC:29027
approved reserved:
2004-02-27
17p13.2
基因染色体位置图

ZZEF1(锌指ZZ型含EF-hand结构域1)是一种编码含有锌指和EF-hand结构域的蛋白质的基因,属于ZZEF基因家族。该家族成员通常具有锌指结构域(参与DNA或蛋白质结合)和EF-hand结构域(与钙离子结合相关),暗示其在基因调控和信号转导中发挥作用。ZZEF1的生物学功能尚未完全明确,但研究表明它可能在细胞增殖、分化及肿瘤发生中起调控作用。其表达产物可能通过与其他蛋白质或DNA相互作用参与转录调控或细胞周期进程。ZZEF1的主要作用位点可能集中在细胞核内,因其结构特征暗示其参与基因表达调控。突变或异常表达可能影响其功能,导致细胞周期紊乱或增殖异常,与某些癌症(如结直肠癌、肝癌)的发生发展相关。ZZEF1过表达可能促进细胞增殖或抑制凋亡,从而参与肿瘤进展;而降低表达可能抑制细胞生长或诱导分化,具体机制仍需进一步研究。该基因与家族其他成员(如ZZEF2)共享保守结构域,但功能可能存在分化。ZZEF基因家族的共性包括参与转录调控、信号转导及细胞命运决定,部分成员与癌症或发育疾病相关。目前对ZZEF1的研究仍在深入,其在疾病诊断或治疗中的潜在价值有待探索。

None

ZZEF1基因的碱基序列:[NCBI]
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ZZEF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1377807       rs1454121       rs1454122       rs1454123       rs2054040       rs4239043       rs5818934       rs8064653       rs8066337       rs8079619       rs8080327       rs11295221       rs11355820       rs11554616       rs12452046       rs12453863       rs28372950      

ZZEF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAGAAGAGGTTTGATGGTG
57
TCAGACTCTTACTGGGCTG
58
CATGCCAGTTCATGGAGGA
59
GAACTTTATCCTCGAAGTTGGTG
59
CAGATTTCTCAACTTTCCTCTCC
59
TAGAACAGCAGCTAGTTATCCT
58
GAAGCAGGCAATGGAAAGAG
59
CACCTTTATCTGCCTTATTTCTCTG
60
AATTTACCGACGCTAGAGG
57
TGAAGGTCACTTTCTTGGG
57
CGAATATGGATGTTAGAGATGAAGC
59
CAGGGTTCACCTCAGTAGC
59
TATGGATAATGCCAATGAACCC
58
AGCTGGTAGTCCTTCACTG
58
ATTCTCCGGGCCATATACG
59
GCTCATCACCATCAAACCTC
59
CCAAGATGAACATCAGTGAAGTC
59
GCATTAACAGCTCGCACTC
59
ATGCCAGTTCATGGAGGAG
59
GAACTTTATCCTCGAAGTTGGTG
59
      尚未收录相关数据

ZZEF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZZEF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
I3L141 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
O43149 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
O43149 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ZZEF1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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