ZSCAN4 (zinc finger and SCAN domain containing 4)

symbol:
ZSCAN4
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.43
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type
alias symbol:
FLJ35105
alias name:
None
entrez id:
201516
ensembl gene id:
ENSG00000180532
ucsc gene id:
uc002qpu.3
refseq accession:
NM_152677
hgnc_id:
HGNC:23709
approved reserved:
2003-12-03
19q13.43
基因染色体位置图

ZSCAN4(Zinc Finger and SCAN Domain Containing 4)属于ZSCAN基因家族,该家族成员均含有SCAN结构域和锌指结构域,主要参与转录调控和胚胎发育。ZSCAN4在胚胎干细胞中高表达,对维持干细胞多能性和基因组稳定性至关重要。其表达产物通过调控端粒延长和DNA损伤修复机制来防止细胞衰老,尤其在体细胞重编程为诱导多能干细胞(iPSCs)过程中发挥关键作用。ZSCAN4的主要作用位点是端粒区域,通过激活端粒酶活性或促进端粒同源重组来延长端粒。突变或缺失ZSCAN4会导致端粒缩短加速、基因组不稳定,并可能引发细胞早衰或凋亡。研究发现ZSCAN4表达异常与某些癌症(如睾丸癌)和早衰综合征相关。当ZSCAN4过表达时,可显著增强干细胞的自我更新能力并延缓衰老,但持续高表达可能增加癌变风险;而降低表达则会导致干细胞分化异常、端粒功能障碍及增殖能力下降。ZSCAN基因家族的共性包括:均含有保守的SCAN结构域(介导蛋白质相互作用)和C2H2型锌指结构域(负责DNA结合),多数成员在早期胚胎发育和干细胞调控中起作用,部分成员(如ZSCAN4、ZSCAN10)还参与免疫反应或肿瘤发生。ZSCAN4的独特之处在于其瞬时爆发性表达模式(仅在2%的干细胞中短暂激活)以及对端粒维持的特殊调控机制。

The ZSCAN4 gene encodes a protein involved in telomere maintenance and with a key role in the critical feature of mouse embryonic stem (ES) cells, namely, defying cellular senescence and maintaining normal karyotype for many cell divisions in culture (Zalzman et al., 2010 [PubMed 20336070]).[supplied by OMIM, May 2010]

的ZSCAN4基因编码(参与端粒维持与在小鼠胚胎干的临界特征的关键作用(ES细胞),即,违抗细胞衰老和维持正常的核型为在培养许多细胞分裂的蛋白质Zalzman等人,2010 [考研20336070])。[由OMIM,2010年5月供应]

ZSCAN4基因的碱基序列:[NCBI]
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ZSCAN4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1988740       rs2011144       rs2106823       rs2106945       rs2360526       rs2360529       rs2360530       rs2360532       rs2360533       rs2360535       rs2360539       rs3054083       rs4239480       rs4426452       rs4433918       rs4447534       rs4464189      

ZSCAN4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACAAGAGAAGCAAACATGGG
59
GTTCATCTTCATATCCTTGTCCTG
59
ACAAGAGAAGCAAACATGGG
59
GTTCATCTTCATATCCTTGTCCTG
59
TAAATCCACCTGCCTTAGTCC
60
TGACATCTCTTAAGGGCATATCC
60
TAAATCCACCTGCCTTAGTCC
60
TGACATCTCTTAAGGGCATATCC
60
CACAAGAGAAGCAAACATGG
58
TCATCTTCATATCCTTGTCCTG
58
CACAAGAGAAGCAAACATGG
58
TCATCTTCATATCCTTGTCCTG
58
      尚未收录相关数据

ZSCAN4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZSCAN4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000784
Q8NAM6 (UniProtKB)
ISS
GO:0003700
Q8NAM6 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q8NAM6 (UniProtKB)
IBA
GO:0006351
Q8NAM6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q8NAM6 (UniProtKB)
IEA
GO:0010833
Q8NAM6 (UniProtKB)
ISS
GO:0043565
Q8NAM6 (UniProtKB)
IBA
GO:0046872
Q8NAM6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ZSCAN4基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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