ZNF816-ZNF321P (ZNF816-ZNF321P readthrough)

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ZNF816-ZNF321P
locus group:
other
location:
19q13.41
gene_family:
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None
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100529240
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ENSG00000221874
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uc010eqj.4
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NM_001202473
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HGNC:38879
approved reserved:
2010-09-15
19q13.41
基因染色体位置图

ZNF816-ZNF321P是一个锌指蛋白基因假基因对,属于人类基因组中最大的转录因子家族——C2H2型锌指蛋白(ZNF)基因家族。锌指蛋白家族的特征是含有保守的C2H2锌指结构域,该结构域由两个半胱氨酸和两个组氨酸残基与锌离子结合形成"指状"结构,能够特异性识别并结合DNA序列,从而调控基因表达。ZNF基因家族成员广泛参与细胞分化、发育、增殖及凋亡等关键生物学过程。ZNF816-ZNF321P位于人类染色体19q13.43区域,其中ZNF816为功能基因,而ZNF321P是其对应的假基因(已丧失功能的基因组拷贝)。假基因通常不编码功能蛋白,但可能通过竞争性结合miRNA或转录因子来调节其同源功能基因的表达。目前对ZNF816的具体功能研究较少,但基于锌指蛋白家族的共性,推测它可能作为转录因子参与基因表达调控网络。该基因的突变或表达异常可能影响其靶基因的调控,进而干扰正常细胞功能。由于锌指蛋白在肿瘤发生中具有双重作用(抑癌或促癌),ZNF816的异常表达可能与某些癌症相关,但具体机制尚需验证。若ZNF816过表达,可能增强其对下游靶基因的调控强度,导致细胞周期或分化异常;而表达降低则可能减弱相关通路活性。假基因ZNF321P虽不编码蛋白,但其序列相似性可能使其参与ZNF816表达的转录后调控。这个基因对的进化形成反映了灵长类基因组中常见的基因复制事件,为研究锌指蛋白家族的功能分化提供了线索。需要注意的是,目前关于这对基因的详细功能研究仍有限,更多结论需要后续实验验证。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the zinc finger protein 816 (ZNF816) gene and the zinc finger protein 321 (ZNF321) pseudogene on chromosome 19. The read-through transcript encodes a KRAB domain-containing protein that shares sequence identity with the upstream gene product, but it contains a distinct C-terminus encoded by exon structure from the downstream pseudogene. [provided by RefSeq, Jan 2011]

此轨迹表示天然产生的通读转录锌指蛋白816(ZNF816)基因和锌指蛋白染色体19上的321(ZNF321)假基因之间的通读转录物编码KRAB结构域的蛋白,其与上游基因产物股序列同一性,但它包含一个独特的C-末端从下游假由外显子结构进行编码。 [由RefSeq的,2011年1月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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ZNF816-ZNF321P基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4803024       rs6509706       rs6509707       rs6509708       rs7246209       rs7247664       rs7248280       rs7249105       rs7250641       rs7250706       rs7252212       rs7256151       rs8100481       rs8100597       rs8104050       rs8104237       rs8104434      

ZNF816-ZNF321P基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTTCAGTGGCAAGAAGAGG
59
CTCTTTGATTTCTGTCATGGGT
59
GAGCAGATTCGCACAAACC
60
CATGCATTTGGAAGAGATATCCC
60
TTTCAGTGGCAAGAAGAGGA
59
ACTCTTTGATTTCTGTCATGGG
59
GAGCAGATTCGCACAAACC
60
ATGCATTTGGAAGAGATATCCC
58
GAGCAGATTCGCACAAACC
60
TGCATTTGGAAGAGATATCCC
58
TTTCAGTGGCAAGAAGAGG
58
ACTCTTTGATTTCTGTCATGGG
59
      尚未收录相关数据

ZNF816-ZNF321P基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZNF816-ZNF321P基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
A0A0X1KG74 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
A0A0X1KG74 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A0X1KG74 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ZNF816-ZNF321P基因的相关microRNA:     

MINT

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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