ZNF625-ZNF20 (ZNF625-ZNF20 readthrough (NMD candidate))

symbol:
ZNF625-ZNF20
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other
location:
19p13.2
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None
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NR_037802
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HGNC:48368
approved reserved:
2013-05-14
19p13.2
基因染色体位置图

ZNF625-ZNF20属于锌指蛋白(ZFP)基因家族,该家族是一类广泛存在于真核生物中的转录调控因子,其共同特点是含有锌指结构域,能够特异性地结合DNA、RNA或蛋白质,从而参与基因表达的调控。锌指蛋白家族成员通常具有多个串联的锌指结构,每个锌指由约30个氨基酸组成,中心包含锌离子以稳定结构。ZNF625-ZNF20的具体功能尚未完全阐明,但基于锌指蛋白家族的共性,它可能参与细胞分化、发育、凋亡以及免疫应答等生物学过程。锌指蛋白通过结合特定DNA序列调控下游靶基因的表达,其表达产物可能在细胞核中发挥作用。若ZNF625-ZNF20发生突变,可能导致其DNA结合能力或转录调控功能异常,进而影响相关信号通路,可能与某些癌症或发育性疾病相关。当该基因过表达时,可能过度激活或抑制其靶基因,扰乱正常细胞功能;而表达降低则可能导致其调控的生物学过程失衡。锌指蛋白家族成员间存在功能冗余和协同作用,因此ZNF625-ZNF20的功能可能与其他家族成员相互影响。目前关于该基因的详细机制和疾病关联仍需进一步研究,但它在基因调控网络中的潜在重要性使其成为可能的治疗靶点或生物标志物。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring zinc finger protein 625 (ZNF625) and zinc finger protein 20 (ZNF20) genes on chromosome 19. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is thus unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Feb 2011]

这一位点代表自然发生的通读转录邻近的锌指蛋白6??25(ZNF625)和锌指蛋白之间的19号染色体20(ZNF20)基因的通读成绩单是无义介导的mRNA降解候选人(NMD),并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

ZNF625-ZNF20基因的碱基序列:[NCBI]
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ZNF625-ZNF20基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs155955       rs155956       rs175242       rs187948       rs271193       rs1036593       rs2673303       rs3760779       rs6511767       rs7245976       rs7247857       rs7248860       rs7258368       rs8107587       rs10404022       rs10408384       rs10414949      

ZNF625-ZNF20基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGGAAATGGATTCAGTGGT
57
TTCTTCTGGGAAGGATCCA
58
GGATTCAGTGGTCTTTGAGGA
60
CACTTTCTAAGACTTAGGTTTCTCC
59
GGGAAATGGATTCAGTGGTC
59
TCTTCTGGGAAGGATCCAG
58
GGATTCAGTGGTCTTTGAGGA
60
CTTTCTAAGACTTAGGTTTCTCCTG
59
GGATTCAGTGGTCTTTGAGG
58
CTTTCTAAGACTTAGGTTTCTCCTG
59
GGGAAATGGATTCAGTGGT
57
TCTTCTGGGAAGGATCCAG
58
      尚未收录相关数据

ZNF625-ZNF20基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZNF625-ZNF20基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
F8WDT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
F8WDT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
F8WDT6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ZNF625-ZNF20基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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