ZNF511-PRAP1 (ZNF511-PRAP1 readthrough)

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ZNF511-PRAP1
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other
location:
10q26.3
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NM_001396060
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HGNC:38088
approved reserved:
2012-06-27
10q26.3
基因染色体位置图

ZNF511-PRAP1是一个嵌合基因,由锌指蛋白511(ZNF511)基因和前PRAP1(Proline-rich acidic protein 1)基因通过基因组重排融合而成。ZNF511属于锌指蛋白家族,该家族成员通常含有C2H2型锌指结构域,能够结合DNA或RNA,参与转录调控、染色质重塑和细胞分化等过程。PRAP1原本编码一种富含脯氨酸和酸性氨基酸的分泌蛋白,可能在细胞外基质中发挥作用。融合后的ZNF511-PRAP1基因保留了ZNF511的锌指结构域,可能保留了DNA结合能力,同时获得了PRAP1的部分序列,可能改变了其调控特性或功能。目前关于ZNF511-PRAP1的具体功能研究较少,但类似的嵌合基因往往会导致基因功能的异常,可能影响细胞的正常调控网络。如果ZNF511-PRAP1过表达,可能会干扰ZNF511或PRAP1的正常功能,例如异常激活或抑制下游靶基因,导致细胞增殖或分化异常。降低表达可能减轻这种干扰,但具体影响取决于细胞类型和生理环境。由于锌指蛋白家族成员广泛参与发育和疾病过程,ZNF511-PRAP1的异常可能与某些癌症或发育障碍相关,但需要更多研究确认。锌指蛋白家族的共性是能够通过锌指结构域特异性地识别和结合核酸序列,从而在基因表达调控中发挥核心作用。家族成员通常参与胚胎发育、细胞命运决定和应激反应等重要生物学过程。PRAP1相关的研究较少,其家族特性尚不明确。对ZNF511-PRAP1的深入研究可能有助于理解嵌合基因在疾病中的作用机制。

This locus represents naturally occurring readthrough transcription between the neighboring ZNF511 (zinc finger protein 511) and PRAP1 (proline-rich acidic protein 1) genes on chromosome 10. The readthrough transcript encodes a fusion protein that shares sequence identity with each individual gene product. This fusion protein may be involved in the regulation of gene promoters, particularly those found on transfected plasmids. [provided by RefSeq, Oct 2014]

这一位点代表自然染色体上发生10邻近ZNF511(锌指蛋白511)和PRAP1(富含脯氨酸的酸性蛋白1)基因之间通读转录的通读转录物编码共享序列与每一个人的融合蛋白基因产物。这种融合蛋白可能参与基因启动子,特别是那些在转染的质粒中发现的调节。 [由RefSeq的,2014年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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ZNF511-PRAP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

ZNF511-PRAP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

ZNF511-PRAP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZNF511-PRAP1基因的本体(GO)信息:

可能调控 ZNF511-PRAP1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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