ZNF280B (zinc finger protein 280B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ZNF280B
locus group:
protein-coding gene
location:
22q11.22
gene_family:
alias symbol:
5'OY11.1|ZNF632
alias name:
None
entrez id:
140883
ensembl gene id:
ENSG00000275004
ucsc gene id:
uc062cby.1
refseq accession:
NM_080764
hgnc_id:
HGNC:23022
approved reserved:
2003-08-19

基因染色体位置

基因染色体位置

22q11.22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene is a transcription factor that upregulates expression of MDM2, which negatively regulates p53 expression. This gene is highly expressed in prostate cancer cells, which leads to a reduction in p53 levels and an increase in growth of the cancer cells. Several transcript variants have been found for this gene, but only one of them is protein-coding. [provided by RefSeq, Jan 2015]

由该基因编码的蛋白是上调MDM2，其中p53表达负调节的表达的转录因子。该基因在前列腺癌细胞中高度表达，这导致在p53水平的降低，并增加了癌细胞的生长。几个转录变异体已经发现这种基因，但其中只有一个是蛋白质编码。 [由RefSeq的，2015年1月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ZNF280B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs361651       rs361651       rs361676       rs361676       rs361901       rs361901       rs361907       rs361907       rs362139       rs362139       rs362184       rs362184       rs2330097       rs2330097       rs4820450       rs4820450       rs4820452      

基因表达

基因表达

ZNF280B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAAGAGGAAGCAAGGTGG
58
CTCTTCCTCACATGATTGTTCC
59
TTGAAAGAGAAGCTGCTGC
58
CAGAATACTGTGAAACAGCCC
59
ATTGAAAGAGAAGCTGCTGC
59
AGAATACTGTGAAACAGCCC
57
GAAAGAGGAAGCAAGGTGG
58
TCTTCCTCACATGATTGTTCC
58
GAAAGAGGAAGCAAGGTGG
58
CTTCCTCACATGATTGTTCCA
58
TTGAAAGAGAAGCTGCTGC
58
AGAATACTGTGAAACAGCCC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ZNF280B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZNF280B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0046872
A0A0D9SEJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
Q86YH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0001227
Q86YH2 (UniProtKB)
IBA
GO:0003677
Q86YH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q86YH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q86YH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
Q86YH2 (UniProtKB)
IBA
GO:0045892
Q86YH2 (UniProtKB)
IBA
GO:0046872
Q86YH2 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ZNF280B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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