ZNF180 (zinc finger protein 180)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ZNF180
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.31
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type
alias symbol:
HHZ168
alias name:
None
entrez id:
7733
ensembl gene id:
ENSG00000167384
ucsc gene id:
uc002ozf.6
refseq accession:
NM_013256
hgnc_id:
HGNC:12970
approved reserved:
1995-11-22

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.31

基因简述

基因简述

ZNF180（锌指蛋白180）属于C2H2型锌指蛋白家族（Zinc Finger Protein Family），这是一类广泛存在于真核生物中的转录调控因子，其共同特点是含有保守的“锌指结构域”——由半胱氨酸和组氨酸残基通过锌离子结合形成的指状蛋白质结构，能够特异性识别并结合DNA序列，从而调控下游基因表达。ZNF180作为该家族成员，其编码产物含有多个串联的C2H2锌指结构，主要定位于细胞核内，通过与特定DNA序列相互作用参与基因转录调控，可能在胚胎发育、细胞分化及肿瘤发生中发挥作用。目前研究表明，ZNF180在多种癌症（如胃癌、结直肠癌）中呈现异常表达模式，其低表达可能与肿瘤侵袭转移相关，而过表达可能影响细胞周期进程。该基因突变可能导致其DNA结合能力改变，进而破坏其调控的基因网络，但具体致病机制尚不明确。锌指蛋白家族成员普遍具有多态性和功能冗余性，部分成员还可参与RNA代谢或蛋白互作。ZNF180的表达水平变化可能通过干扰其靶基因（如抑癌基因或原癌基因）的表达影响细胞增殖或凋亡通路，例如在胃癌中其低表达可能促进EMT（上皮-间质转化，一种与癌症转移相关的细胞表型转变）。由于锌指蛋白家族功能复杂且成员众多（人类基因组中超过700个），ZNF180的具体调控机制和生理功能仍需进一步研究，现有数据多来自生物信息学分析和有限的组织表达检测。注：C2H2指该锌指结构中包含2个半胱氨酸（C）和2个组氨酸（H）残基；EMT（Epithelial-Mesenchymal Transition）。

Zinc finger proteins have been shown to interact with nucleic acids and to have diverse functions. The zinc finger domain is a conserved amino acid sequence motif containing 2 specifically positioned cysteines and 2 histidines that are involved in coordinating zinc. Kruppel-related proteins form 1 family of zinc finger proteins. See MIM 604749 for additional information on zinc finger proteins.[supplied by OMIM, Jul 2002]

锌指蛋白已显示出与核酸相互作用，并具有多种功??能。锌指结构域是含有2特异性定位半胱氨酸和2组氨酸所涉及协调锌的保守氨基酸序列基序。 Kruppel相关蛋白形成1家锌指蛋白。见MIM 604749对锌指蛋白的其它信息。[由OMIM，2002年7月提供]

OMIM数据库中对ZNF180基因的介绍     Wikipedia数据库中对ZNF180基因的介绍

基因序列

基因序列

ZNF180基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ZNF180基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs9389       rs517503       rs589512       rs892596       rs926020       rs954313       rs954314       rs1865385       rs1865387       rs1897820       rs1996823       rs2020083       rs2117383       rs2117384       rs2253210       rs2253563       rs2254344      

基因表达

基因表达

ZNF180基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTAGTCTCTTGGGACTTGGC
60
ATCTTCACTCCATTAGCTGGT
59
AAGAGCAGGATGAGAAGCC
60
GACAGAGCAAGACTCTGTG
58
CCCATCTCAGGAAGGAGTG
59
ATCACATCTCTGTCCAGGG
59
TGTGCACAGGATTCTTTCC
58
CAGTGTCTTCTCCCTCGAC
60
TCTGTGCACAGACAGAGTC
59
GTAGTCCCACCTATTCAGGC
60
TAGTCTCTTGGGACTTGGC
59
ATCTTCACTCCATTAGCTGGT
59
AAGAGCAGGATGAGAAGCC
60
GGAAGGAAAGAATCCTGTGC
59
TCTGTGCACAGACAGAGTC
59
CTTGAGCCCAGAAGTTTGAG
59
AAGGTCTGTGCACAGAGTC
60
CTTGAGCCCAGAAGTTTGAG
59
CCAAGTAGCTGGGACTACAG
60
CACTCCTTCCTGAGATGGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ZNF180基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZNF180基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006355
A0A0A0MP75 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
G5E9B8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
K7EQP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q9UJW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q9UJW8 (UniProtKB)
IEA
 
名称：
nucleic acid binding
 
本体信息：
molecular_function
 
基因本体信息
详细说明：
"Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid." [GOC:jl]
 
上级：
GO:0097159 ! organic cyclic compound binding GO:1901363 ! heterocyclic compound binding

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ZNF180基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
1
psi-mi:MI:0018(two hybrid)
NA
KIFC3
ZNF180
2
psi-mi:MI:0018(two hybrid)
NA
ZNF180
NDEL1
3
psi-mi:MI:0018(two hybrid)
NA
ZNF180
KRTAP10-7

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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