ZGPAT (zinc finger CCCH-type and G-patch domain containing)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ZGPAT
locus group:
protein-coding gene
location:
20q13.33
gene_family:
Zinc fingers, CCCH-type|G patch domain containing
alias symbol:
dJ583P15.3|MGC44880|FLJ14972|ZC3HDC9|ZC3H9|GPATC6|GPATCH6|ZIP
alias name:
None
entrez id:
84619
ensembl gene id:
ENSG00000197114
ucsc gene id:
uc002ygi.3
refseq accession:
NM_181484
hgnc_id:
HGNC:15948
approved reserved:
2003-11-21

基因染色体位置

基因染色体位置

20q13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ZGPAT（锌指蛋白和G补丁结构域蛋白）属于G补丁结构域蛋白家族，其特点是含有保守的G补丁结构域（G-patch domain，一种参与RNA结合的蛋白质模体）和锌指结构域（zinc finger domain，介导蛋白质与核酸或蛋白质的相互作用）。该基因编码的蛋白可能参与RNA代谢过程，如剪接（splicing，将前体mRNA加工为成熟mRNA的步骤）或转录调控。目前研究显示，ZGPAT在维持细胞正常功能中可能发挥作用，但其具体生物学功能尚未完全阐明。若该基因发生突变，可能干扰RNA加工或基因表达调控，进而影响细胞稳态，但具体致病机制尚不明确。与疾病的关系仍在探索中，暂未明确关联特定疾病。过表达ZGPAT可能扰乱RNA代谢平衡，导致异常剪接或转录失调；而低表达可能影响依赖其功能的RNA处理过程。G补丁结构域蛋白家族的成员通常参与RNA相关活动，如剪接、编辑或翻译调控。由于研究有限，ZGPAT的详细机制、相互作用网络及临床意义仍需进一步研究。专业术语解释：G补丁结构域是约50个氨基酸的序列，常见于RNA结合蛋白；锌指结构域是通过锌离子稳定结构的蛋白模体，多用于分子识别。

None

无

OMIM数据库中对ZGPAT基因的介绍     Wikipedia数据库中对ZGPAT基因的介绍

基因序列

基因序列

ZGPAT基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

ZGPAT基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1291211       rs1291212       rs4809325       rs6011040       rs6011042       rs6011043       rs6062498       rs6089764       rs11547196       rs34843664       rs41309375       rs73139727       rs73319723       rs74509631       rs75186556       rs80322094       rs111259883      

基因表达

基因表达

ZGPAT基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59
TCCATCTCTTGCAGTGGTG
60
CCAAACCCTTGCCAAACTC
60
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59
GTGTCTGTCAGGAAGAGCA
59
TACTCAGCATCTTCCTGGC
59
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59
AGGAGAACTGCAGGTTCTC
59
GTGTAGTAGCCGTTGTCCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ZGPAT基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZGPAT基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0000978
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0001078
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0003700
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N5A5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q8N5A5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007175
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0043565
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0045892
Q8N5A5 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q8N5A5 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ZGPAT基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Crohn Disease 0.127101096 3 1 GAD_GWASCAT
Inflammatory Bowel Diseases 0.122367032 2 2 GAD_GWASCAT
Malignant neoplasm of prostate 0.120271442 2 1 BeFree_GWASCAT
Hypertensive disease 0.002367032 1 0 GAD
Rheumatoid Arthritis 0.002367032 1 0 GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 0 GAD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.002367032 1 0 GAD
Coronary Artery Disease 0.002367032 1 0 GAD
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2