ZFX (zinc finger protein X-linked)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ZFX
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp22.11
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type
alias symbol:
ZNF926
alias name:
None
entrez id:
7543
ensembl gene id:
ENSG00000005889
ucsc gene id:
uc004dbd.3
refseq accession:
NM_003410
hgnc_id:
HGNC:12869
approved reserved:
1988-07-06

基因染色体位置

基因染色体位置

Xp22.11
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ZFX（锌指X连锁蛋白，Zinc Finger X-linked protein）是一种位于X染色体上的锌指蛋白编码基因，属于锌指蛋白家族（Zinc Finger Protein Family）。锌指蛋白是一类通过锌离子稳定结构的DNA结合蛋白，其典型特征是含有重复的“锌指”结构域（由半胱氨酸和组氨酸残基与锌离子结合形成的指状三维结构），能够特异性识别并结合DNA序列，从而调控靶基因的转录。ZFX在进化上高度保守，与Y染色体上的同源基因ZFY（Zinc Finger Y-linked）具有相似功能。ZFX的主要生物学功能包括参与胚胎发育、干细胞自我更新及细胞增殖调控。其表达产物作为转录因子，通过结合特定DNA区域激活或抑制下游基因（如多能性相关基因OCT4、NANOG）的表达，尤其在维持胚胎干细胞（ES细胞）和多能性中起关键作用。ZFX的作用位点主要集中在细胞核内，通过调控细胞周期相关基因（如CCND1）影响细胞增殖。若ZFX发生功能丧失性突变（如无义突变或移码突变），可能导致胚胎发育异常或干细胞分化障碍；而某些错义突变可能改变其DNA结合能力，引发转录调控紊乱。研究发现ZFX与多种癌症（如白血病、肝癌）相关，其过表达可通过激活Wnt/β-catenin等促增殖信号通路加速肿瘤发生，还可能通过抑制凋亡基因（如BAX）促进细胞存活。相反，ZFX表达降低会导致干细胞多能性丧失和增殖减缓。在基因家族层面，锌指蛋白家族的共性是通过锌指结构域实现核酸结合或蛋白质互作，广泛参与转录调控、染色质重塑等过程。ZFX过表达会上调下游靶基因（如MYC）并增强干细胞特性，而敲低其表达则可能引发分化相关基因（如GATA4）的异常激活。需要注意的是，ZFX的X染色体定位使其在性别相关疾病中可能具有差异化影响，例如在X染色体失活逃逸（X-inactivation escape）情况下，女性细胞中可能出现双等位基因表达异常。

This gene on the X chromosome is structurally similar to a related gene on the Y chromosome. It encodes a member of the krueppel C2H2-type zinc-finger protein family. The full-length protein contains an acidic transcriptional activation domain (AD), a nuclear localization sequence (NLS) and a DNA binding domain (DBD) consisting of 13 C2H2-type zinc fingers. Studies in mouse embryonic and adult hematopoietic stem cells showed that this gene was required as a transcriptional regulator for self-renewal of both stem cell types, but it was dispensable for growth and differentiation of their progeny. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, May 2010]

该基因在X染色体上的结构相似于Y染色体上的相关基因。它编码krueppel C2H2型锌指蛋白家族的一个成员。全长蛋白含有酸性转录激活结构域（AD），核定位序列（NLS）和由13个C2H2型锌指DNA结合结构域（DBD）。在小鼠胚胎和成年造血干细胞的研究表明，该基因被要求作为两种干细胞类型的自我更新的转录调节器，但它是可有可无的后代的生长和分化。编码不同同种型的多个可变剪接转录物变体已被确定，但是一些变体的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的，2010年5月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ZFX基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3761639       rs3761640       rs3838208       rs6526373       rs11795835       rs34848343       rs73474140       rs78155031       rs112380861       rs113207918       rs139447985       rs140372953       rs142707879       rs181789028       rs182414125       rs184087956       rs184894370      

基因表达

基因表达

ZFX基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTGATGCAACAGGAGCTG
59
GCACAGTTATGTCTGAATCCA
59
ACAGTCCTGTGAGATTCAGAG
59
TTCTGGTGCAATATACCACCA
60
CTACCTTATGATTTCCTGTGGA
57
TGATCAAGCAGTTCAACTCC
58
TGATTTCCTTGGATGATGCTG
59
GATCAATTTCCGACTCTGTGTC
60
CATAGATGAGTCTGCTGGC
58
CAGGGCCAATAATTATTGCTG
58
ATGCAACAGACAGGGTCTC
60
AGCAGATCACTTGAGCCTG
60
TGACTTAGGTGGAACTGTAGAC
59
CTGCTGTTCTGATCAAGCAG
59
TGGGCTTGAATTACAACAAGAG
59
TGTGTACCATCAGCTCCTG
59
TCAGTAAACACTGGGAAAGAC
58
TGAACATCCACTGTTGCTG
58
TAAGGTGCTTTCGATGCAG
58
CTTCCTTTATTCAGATACTCGGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ZFX基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZFX基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
C9J682 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
C9J682 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
C9J682 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
C9J682 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
E9PEP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
E9PEP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
E9PEP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
E9PEP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0000977
P17010 (UniProtKB)
IBA
GO:0003677
P17010 (UniProtKB)
TAS
GO:0003700
P17010 (UniProtKB)
IBA
GO:0003713
P17010 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
P17010 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
P17010 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
P17010 (UniProtKB)
IBA
GO:0007275
P17010 (UniProtKB)
IBA
GO:0046872
P17010 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ZFX基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinogenesis 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000814326 3 0 BeFree
Glioma 0.000814326 3 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000542884 2 0 BeFree
Laryngeal Squamous Cell Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of gallbladder 0.000542884 2 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of tongue 0.000542884 2 0 BeFree
Gallbladder Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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