ZEB2-AS1 (ZEB2 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ZEB2-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
2q22.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
ZEB2NAT
alias name:
ZEB2 natural antisense transcript
entrez id:
100303491
ensembl gene id:
ENSG00000238057
ucsc gene id:
uc061ohe.1
refseq accession:
NR_040248
hgnc_id:
HGNC:37149
approved reserved:
2009-08-30

基因染色体位置

基因染色体位置

2q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ZEB2-AS1是一种长链非编码RNA（lncRNA），位于人类染色体2q22.3上，与ZEB2基因的反义链重叠。ZEB2-AS1的主要功能是通过表观遗传调控影响ZEB2基因的表达，而ZEB2是一种重要的转录因子，参与上皮-间质转化（EMT）过程，在胚胎发育、细胞分化和肿瘤转移中起关键作用。ZEB2-AS1通过结合染色质修饰复合物或作为分子支架调节ZEB2的表达水平，从而影响下游信号通路。ZEB2-AS1的突变或异常表达可能导致ZEB2功能失调，进而影响EMT过程，与多种癌症的侵袭和转移相关，如胃癌、肝癌和乳腺癌。当ZEB2-AS1过表达时，可能通过上调ZEB2促进肿瘤细胞的迁移和侵袭能力；而降低其表达则可能抑制肿瘤进展。ZEB2-AS1属于长链非编码RNA家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但可通过调控基因表达、染色质重塑或作为竞争性内源RNA（ceRNA）参与多种生物学过程。研究表明，ZEB2-AS1还可能通过与其他miRNA或蛋白质相互作用，影响细胞周期、凋亡和免疫应答等过程。此外，ZEB2-AS1的表达异常还与神经发育障碍如Mowat-Wilson综合征有关，该综合征由ZEB2基因突变引起。因此，ZEB2-AS1在疾病诊断和治疗中具有潜在的应用价值。

None

无

OMIM数据库中对ZEB2-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对ZEB2-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

ZEB2-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ZEB2-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3755092       rs77027441       rs78108623       rs112253692       rs140861711       rs145608104       rs146048066       rs146518085       rs188799288       rs527511209       rs528947628       rs537358252       rs540066305       rs541531050       rs549747601       rs555195093       rs565286412      

基因表达

基因表达

ZEB2-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCCTCAATCCAGATAGTCTC
57
CTCTGGTACACAATTTGATGTG
58
CTGTGCTAGAAGCTTTGCAG
60
CAAGACTTCGCAGGTAGGT
59
TATTCCTGCAGAGCAGGAG
59
GCGCTTCAATTATCCCTCC
59
AAACCTGGAAAGGGAAATCC
58
ATGAATATAGACAGGCCAGCT
59
TTATTCCTGCAGAGCAGGAG
60
CGCTTCAATTATCCCTCCC
58
TGTGCTAGAAGCTTTGCAG
59
ACAAGACTTCGCAGGTAGG
59
GATGCACATCAAATTGTGTACC
59
CACCCTAATACACATGCCCT
60
AAACCTGGAAAGGGAAATCC
58
ATGAATATAGACAGGCCAGC
57
GATGCACATCAAATTGTGTACC
59
CACCCTAATACACATGCCC
58
TGTGCTAGAAGCTTTGCAG
59
CAAGACTTCGCAGGTAGGT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ZEB2-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZEB2-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ZEB2-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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