YBX3 (Y-box binding protein 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
YBX3
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.2
gene_family:
Y box binding proteins
alias symbol:
dbpA|ZONAB|CSDA1
alias name:
cold-shock domain containing A1
entrez id:
8531
ensembl gene id:
ENSG00000060138
ucsc gene id:
uc001qyt.4
refseq accession:
NM_003651
hgnc_id:
HGNC:2428
approved reserved:
1998-10-23

基因染色体位置

基因染色体位置

12p13.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

YBX3（Y-box binding protein 3）属于Y-box蛋白家族，该家族成员均含有高度保守的冷休克结构域（CSD），能够结合DNA或RNA以调控基因表达。YBX3在多种组织中表达，尤其在睾丸中表达较高，参与转录调控、mRNA稳定性和翻译控制等过程。其表达产物通过与特定DNA或RNA序列结合，影响细胞增殖、分化及应激反应。YBX3的主要作用位点包括细胞核和细胞质，在核内调控基因转录，在胞质中参与mRNA的翻译调控。突变可能导致其DNA/RNA结合能力丧失，影响相关信号通路，进而干扰细胞周期或应激反应，甚至与肿瘤发生相关。研究表明，YBX3与某些癌症（如前列腺癌、乳腺癌）的发展有关，可能通过调控癌基因或抑癌基因的表达促进肿瘤进展。YBX3过表达可能增强细胞增殖和抗凋亡能力，而低表达可能导致细胞分化异常或应激反应缺陷。Y-box蛋白家族的共性包括依赖CSD结构域与核酸相互作用，参与发育、肿瘤发生及细胞对环境压力的应答。家族其他成员如YBX1和YBX2也在基因调控中发挥关键作用，但各自具有组织特异性或功能偏好性。YBX3的功能细节仍在研究中，但其在生殖系统和癌症中的突出作用使其成为潜在的治疗靶点或生物标志物。

None

无

OMIM数据库中对YBX3基因的介绍     Wikipedia数据库中对YBX3基因的介绍

基因序列

基因序列

YBX3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

YBX3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs33017       rs33018       rs1042085       rs1126501       rs1673681       rs2607903       rs11053915       rs11832011       rs12317203       rs28384465       rs73044678       rs74063018       rs74063019       rs76738165       rs77100210       rs77209393       rs78830391      

基因表达

基因表达

YBX3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTATGACTGTATATGAAGTGGG
58
CCGCAAATACTTCTCCAAGG
59
GGGTCAAATATTACGCTGGG
59
AGAACTGCCTATCAGTGGC
60
ATGGAGTTCCTGTGGAAGG
59
CATACATCAGAGATATTCCGGG
58
GAGTTCCTGTGGAAGGGAG
59
CCAATCTCACCAGCATTCC
59
ATTTGTACATCAGACTGCCA
57
AACTCTACAGTTTCTCCATCTC
57
CTTCACAAGATGGCAAAGAGG
59
TTCTTTAGGTCACCTGCCG
59
CTGTCAAATGGTTCAACGTC
57
CATCTTCTTTGGTGTCATTTCG
58
CATCCTGTTCTCCTGATGTG
58
TCTTCTTGATGGCAGTCCA
59
CAACAGAATACAGGCTGGTG
59
GATTTCGATGAACCGGTCC
59
GAGTTCCTGTGGAAGGGAG
59
CCAATCTCACCAGCATTCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

YBX3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

YBX3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A0A0D9SEI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A0D9SEI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0000977
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0001227
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0001701
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0003690
P16989 (UniProtKB)
TAS
GO:0003697
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
P16989 (UniProtKB)
NAS
GO:0003714
P16989 (UniProtKB)
TAS
GO:0003730
P16989 (UniProtKB)
ISS
GO:0005634
P16989 (UniProtKB)
ISS
GO:0005737
P16989 (UniProtKB)
IDA
GO:0005844
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0005923
P16989 (UniProtKB)
ISS
GO:0006351
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0008584
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0009409
P16989 (UniProtKB)
TAS
GO:0009566
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0017048
P16989 (UniProtKB)
ISS
GO:0044822
P16989 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
P16989 (UniProtKB)
IDA
GO:0046622
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
P16989 (UniProtKB)
ISS
GO:0048642
P16989 (UniProtKB)
IEA
GO:0060546
P16989 (UniProtKB)
IMP
GO:0070935
P16989 (UniProtKB)
IC
GO:0071356
P16989 (UniProtKB)
IMP
GO:0071474
P16989 (UniProtKB)
IMP
GO:1902219
P16989 (UniProtKB)
IMP
GO:2000767
P16989 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 YBX3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Conventional (Clear Cell) Renal Cell Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Lyme Disease 0.000542884 2 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Hereditary persistence of fetal hemoglobin thalassemia 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Peripheral Arterial Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Ischemia 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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