XYLB (xylulokinase)

symbol:
XYLB
locus group:
protein-coding gene
location:
3p22.2
gene_family:
alias symbol:
FLJ10343|FLJ12539
alias name:
D-xylulokinase|xylulose kinase
entrez id:
9942
ensembl gene id:
ENSG00000093217
ucsc gene id:
uc003cic.3
refseq accession:
NM_005108
hgnc_id:
HGNC:12839
approved reserved:
1998-12-02
3p22.2
基因染色体位置图

XYLB基因编码木酮糖激酶(xylulokinase),是碳水化合物代谢中戊糖磷酸途径(pentose phosphate pathway)的关键酶,负责催化D-木酮糖(D-xylulose)磷酸化为D-木酮糖-5-磷酸(D-xylulose-5-phosphate),后者可进入糖酵解或核苷酸合成途径。该基因主要在肝脏、肾脏和肠道中高表达,其功能与果糖代谢密切相关,尤其在果糖不耐受(fructose intolerance)相关疾病中起重要作用。XYLB属于GHMP激酶家族(GHMP kinase family),该家族成员通常参与小分子代谢,具有保守的ATP结合结构域和底物特异性。若XYLB发生功能丧失突变(如错义突变或缺失),可能导致木酮糖代谢障碍,引发果糖代谢异常,与遗传性果糖不耐受(hereditary fructose intolerance, HFI)相关,患者摄入果糖后会出现低血糖、肝损伤等症状。过表达XYLB可能加速果糖代谢,但具体病理影响尚不明确,而表达降低则可能加剧果糖堆积,导致代谢压力。此外,XYLB与糖尿病和肥胖的研究也有关联,因其代谢产物可能影响胰岛素信号通路。该基因的调控异常还可能间接影响其他糖代谢基因(如ALDOB、TKTL1)的表达或活性。

The protein encoded by this gene shares 22% sequence identity with Hemophilus influenzae xylulokinase, and even higher identity to other gene products in C.elegans (45%) and yeast (31-35%), which are thought to belong to a family of enzymes that include fucokinase, gluconokinase, glycerokinase and xylulokinase. These proteins play important roles in energy metabolism. [provided by RefSeq, Aug 2009]

通过用流感嗜血杆菌木酮糖激酶,甚至更高的同一性的其它基因产物的线虫(45%)和酵母(31-35%)将该基因股22%的序列同一性编码的蛋白质,这被认为是属于一个家庭的酶,包括fucokinase,gluconokinase,甘油激酶和木酮糖激酶。这些蛋白在能量代谢的重要作用。 [由RefSeq的,2009年08月提供]

XYLB基因的碱基序列:[NCBI]
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XYLB基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs528052       rs1468077       rs1870914       rs1870915       rs2366123       rs3762788       rs3792527       rs3792528       rs7630207       rs9871059       rs62239933       rs71635870       rs71726315       rs75213006       rs75221584       rs76680708       rs78791748      

XYLB基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTTGCTGTTGATGCAGAG
58
AAGGTTGCTCCAAATTCTGG
58
TGTTGCTGTTGATGCAGAG
59
TTCCGTGTTGCCAAATTCTG
60
TTCGAGCACTAATTGAAGGA
57
TTGTCTTGGACATGACTCG
58
TTCTTTGGTCAGTAGCTTTGC
59
ATTCATTCCAGAACCATCACTG
59
GATCTTCCAGAATTTGGGACTC
59
CCACATTAGTACTGGAGAAGTG
58
GTTGTTGCTGTTGATGCAG
58
AAGGTTGCTCCAAATTCTGG
59
TTCGAGCACTAATTGAAGGA
57
TTGTCTTGGACATGACTCG
57
TCGAGCACTAATTGAAGGAC
57
TTTGTCTTGGACATGACTCG
58
TCCAGAATTTGGGACTCAGG
60
TGGACCCACATTAGTACTGG
59
TCTTTGGTCAGTAGCTTTGC
59
ATTCATTCCAGAACCATCACTG
59
      尚未收录相关数据

XYLB基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XYLB基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004856
O75191 (UniProtKB)
EXP
GO:0004856
O75191 (UniProtKB)
IDA
GO:0005524
O75191 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
O75191 (UniProtKB)
IBA
GO:0005829
O75191 (UniProtKB)
TAS
GO:0005975
O75191 (UniProtKB)
TAS
GO:0005997
O75191 (UniProtKB)
IDA
GO:0005998
O75191 (UniProtKB)
TAS
GO:0006091
O75191 (UniProtKB)
TAS
GO:0019640
O75191 (UniProtKB)
TAS
GO:0042732
O75191 (UniProtKB)
IEA
GO:0046835
O75191 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O75191 (UniProtKB)
IDA

可能调控 XYLB基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Ischemic stroke 0.000271442 1 2 BeFree
Ischemic Cerebrovascular Accident 0.000271442 1 2 BeFree

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