XRCC6P3 (X-ray repair cross complementing 6 pseudogene 3)

symbol:
XRCC6P3
locus group:
pseudogene
location:
1q41
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
127086
ensembl gene id:
ENSG00000230318
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refseq accession:
NG_022752
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HGNC:45185
approved reserved:
2013-03-04
1q41
基因染色体位置图

XRCC6P3是X射线修复交叉互补基因6假基因3(X-ray repair cross-complementing 6 pseudogene 3)的简称,属于XRCC基因家族中的假基因成员。XRCC基因家族主要参与DNA损伤修复和维持基因组稳定性,其成员在碱基切除修复和双链断裂修复中发挥重要作用。XRCC6P3作为假基因,通常不编码功能性蛋白,而是由功能基因XRCC6(也称为Ku70)在进化过程中通过复制或逆转录转座形成。假基因可能通过调控功能基因的表达或作为竞争性内源RNA(ceRNA)影响相关通路。XRCC6(Ku70)与XRCC5(Ku80)形成异源二聚体Ku复合物,在非同源末端连接(NHEJ)修复途径中识别并结合DNA双链断裂末端,对维持基因组完整性至关重要。XRCC6P3由于缺乏完整编码序列或关键功能域,通常不直接影响Ku70蛋白功能,但可能通过调控XRCC6的表达或竞争性结合miRNA间接影响DNA修复过程。目前关于XRCC6P3突变的研究较少,但XRCC6的功能性突变可能导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,与癌症易感性、衰老和神经退行性疾病相关。XRCC6P3的表达变化可能通过调控网络影响XRCC6的表达水平,进而影响DNA修复能力。过表达XRCC6P3可能竞争性结合调控XRCC6的miRNA,导致XRCC6表达上调,增强DNA修复能力;而低表达可能减弱这种调控作用。XRCC基因家族的共性在于它们都参与DNA损伤应答,特别是电离辐射和氧化应激引起的损伤修复。家族成员通常具有保守的功能域,如Ku70/Ku80的DNA结合域。XRCC6P3作为假基因保留了部分序列同源性,但缺乏完整功能。研究XRCC6P3有助于理解假基因在基因组稳定性和疾病中的潜在调控作用,尽管其直接影响较小,但可能作为生物标志物或治疗靶点的调控元件。

None

XRCC6P3基因的碱基序列:[NCBI]
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XRCC6P3基因的碱基突变:           仅显示部分snp

XRCC6P3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATACAGGCATCTTCCTTGAC
57
AAAGGTATATCAAAGCCCTCAG
58
GATACAGGCATCTTCCTTGAC
58
AAGGTATATCAAAGCCCTCAG
57
GGAGAAAGAGGAAACAGAAGAG
58
ACCCATGAGAATCAAACCTG
57
      尚未收录相关数据

XRCC6P3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XRCC6P3基因的本体(GO)信息:

可能调控 XRCC6P3基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
leukemia 0.00272435 1 0 LHGDN

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