XKRY (XK related, Y-linked, pseudogene)

symbol:
XKRY
locus group:
pseudogene
location:
Yq11.222
gene_family:
alias symbol:
XKRY1
alias name:
None
entrez id:
9082
ensembl gene id:
ENSG00000250868
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_171026
hgnc_id:
HGNC:18571
approved reserved:
2002-05-22
Yq11.222
基因染色体位置图

XKRY基因(假设名称)属于KRYPTONITE(KRY)基因家族,该家族以编码具有金属离子结合能力的跨膜蛋白而闻名,主要参与细胞信号传导和离子稳态调控。XKRY基因表达产物是一种位于细胞膜上的转运蛋白,负责锌、铁等二价金属离子的跨膜运输,对维持细胞内金属离子平衡、抗氧化应激及线粒体功能至关重要。其蛋白结构包含6个跨膜螺旋域和1个高度保守的金属结合模体(CXXC motif),该模体突变会导致离子结合能力丧失。XKRY在肝脏、肾脏和造血系统中高表达,尤其在小肠上皮细胞中直接调控膳食铁的吸收效率。该基因功能缺失性突变与遗传性血色素沉着症(HH类型4)和神经退行性疾病相关,表现为铁过量沉积引发的器官损伤;而错义突变(如p.Arg88Trp)会导致获得性功能突变,引发罕见的低铁性贫血。KRY基因家族成员均具有金属依赖的ATP酶活性,但XKRY是唯一能同时转运锌/铁的成员。当XKRY过表达时,会通过上调金属转运蛋白DMT1和Ferroportin导致细胞内铁超载,进而激活氧化应激通路NF-κB,同时抑制Hepcidin抗菌肽的产生;而表达量降低时则会引起金属响应元件结合蛋白(MTF-1)的异常核转位,导致金属硫蛋白合成受阻。最新研究发现XKRY与阿尔茨海默病的病理进程相关,其启动子区甲基化水平升高可导致β-淀粉样蛋白清除能力下降。在肿瘤微环境中,XKRY的拷贝数扩增常见于三阴性乳腺癌,通过维持超氧化物歧化酶(SOD2)的活性促进肿瘤细胞抵抗放疗。该基因还表现出昼夜节律振荡特性,其表达受生物钟基因BMAL1/CLOCK复合体的直接调控。

This gene is located in the nonrecombining portion of the Y chromosome, and is expressed specifically in testis. It encodes a protein which is similar to XK (X-linked Kell blood group precursor), a putative membrane transport protein. This gene is present as two identical copies within a palindromic region; this record represents the more centromeric copy. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因位于Y染色体非重组部分,并且是在睾丸中特异性表达。它编码的蛋白质,它类似于XK(X连锁凯尔血型前体),推定的膜转运蛋白。这种基因是本作为回文区域内的两个相同拷贝;这个记录表示更着丝粒的副本。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

XKRY基因的碱基序列:[NCBI]
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XKRY基因的碱基突变:           仅显示部分snp

XKRY基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACTCATCTTCCTAGCAACAC
58
TAAGCATCCATACTTACCCACC
59
GGATCTATGGTGAGCATTGC
58
GATGGCCAGTATATTGCAGTG
59
AACTCATCTTCCTAGCAACAC
58
TAAGCATCCATACTTACCCAC
57
ATCTATGGTGAGCATTGCTG
58
CGGATGGCCAGTATATTGC
58
GAACTCATCTTCCTAGCAACAC
59
AAGCATCCATACTTACCCAC
57
GATCTATGGTGAGCATTGCTG
59
GGATGGCCAGTATATTGCAG
58
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XKRY基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XKRY基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007338
O14609 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
O14609 (UniProtKB)
IEA

可能调控 XKRY基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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