XKR8 (XK related 8)

symbol:
XKR8
locus group:
protein-coding gene
location:
1p35.3
gene_family:
alias symbol:
FLJ10307
alias name:
None
entrez id:
55113
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ENSG00000158156
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uc001bph.2
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NM_018053
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HGNC:25508
approved reserved:
2005-07-28
1p35.3
基因染色体位置图

XKR8属于XKR基因家族,该家族成员编码的蛋白质主要参与细胞凋亡和磷脂酰丝氨酸(PS)的外翻过程,这是细胞凋亡的重要标志之一。XKR8在细胞膜上表达,其功能与细胞凋亡信号传导密切相关,特别是在促进磷脂酰丝氨酸从细胞膜内侧翻转到外侧的过程中起关键作用。这一过程对于巨噬细胞识别和清除凋亡细胞至关重要,从而维持组织稳态。XKR8的功能异常可能导致凋亡细胞清除障碍,进而引发炎症或自身免疫性疾病。XKR8的突变可能影响其介导的磷脂酰丝氨酸外翻功能,导致凋亡细胞不能被有效清除,增加自身免疫疾病或慢性炎症的风险。XKR8过表达可能加速细胞凋亡或异常磷脂酰丝氨酸暴露,可能引发过度炎症反应或自身免疫异常;而降低表达则可能导致凋亡细胞清除效率下降,同样可能诱发炎症或自身免疫问题。XKR基因家族的共性在于其成员均含有多个跨膜结构域,并参与细胞凋亡相关的膜转运过程,尤其是磷脂酰丝氨酸的外翻。XKR8与其他家族成员(如XKR4、XKR9)在功能上有一定冗余性,但各自可能在不同组织或发育阶段发挥特异性作用。研究表明,XKR8可能与某些神经退行性疾病或自身免疫疾病(如系统性红斑狼疮)相关,但其具体机制仍需进一步研究。

None

XKR8基因的碱基序列:[NCBI]
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XKR8基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4908383       rs12402686       rs12402958       rs12406280       rs12406359       rs34560878       rs41284296       rs61789699       rs76938686       rs113568867       rs114671194       rs140164251       rs142022819       rs142942451       rs143078230       rs143604457       rs147828340      

XKR8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTACTACCAGTGGGTTGG
58
AAGTAGATCACGGAGGAGC
59
CTACCAGTAGACGAGGTCC
58
GGAAGTAGATCACGGAGGA
58
GTTACCTGTACAGGTGCGT
60
TAGGCCAAGTCAAACTCAGAG
60
CTACCAGTAGACGAGGTCC
58
GGAAGTAGATCACGGAGGAG
59
TTACCTGTACAGGTGCGTG
60
TAGGCCAAGTCAAACTCAGAG
60
CTACCAGTAGACGAGGTCC
58
AAGTAGATCACGGAGGAGC
59
      尚未收录相关数据

XKR8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XKR8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q9H6D3 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9H6D3 (UniProtKB)
IEA
GO:0043652
Q9H6D3 (UniProtKB)
IDA
GO:0070782
Q9H6D3 (UniProtKB)
IDA

可能调控 XKR8基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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