XKR6 (XK related 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
XKR6
locus group:
protein-coding gene
location:
8p23.1
gene_family:
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None
alias name:
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286046
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ENSG00000171044
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uc003wtk.3
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NM_173683
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HGNC:27806
approved reserved:
2004-06-11

基因染色体位置

基因染色体位置

8p23.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

XKR6属于XKR基因家族，该家族成员编码的蛋白质通常与细胞凋亡和磷脂酰丝氨酸（PS）外翻相关，在程序性细胞死亡过程中发挥重要作用。XKR6基因位于人类8号染色体上，其编码的蛋白质是一种跨膜蛋白，参与细胞膜上磷脂酰丝氨酸的暴露，这是凋亡细胞被吞噬细胞识别和清除的关键信号。XKR家族蛋白的共同特点是含有多个跨膜结构域，并在细胞凋亡时被半胱天冬酶（caspase）激活，从而介导磷脂酰丝氨酸的转运。XKR6的功能尚未完全阐明，但研究表明它可能在精子发生和神经系统发育中起作用。XKR6的突变或表达异常可能导致细胞凋亡过程紊乱，与某些生殖系统疾病或神经退行性疾病可能相关。XKR6过表达可能加速细胞凋亡，导致组织损伤或发育异常；而表达降低则可能阻碍凋亡细胞的清除，引发炎症或自身免疫反应。XKR6与其他XKR家族成员（如XKR4、XKR8）功能相似但可能存在组织特异性差异。目前关于XKR6的研究相对较少，需要更多实验验证其具体机制和病理学意义。

None

无

OMIM数据库中对XKR6基因的介绍     Wikipedia数据库中对XKR6基因的介绍

基因序列

基因序列

XKR6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

XKR6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2409687       rs2409688       rs2898255       rs4407841       rs4840532       rs5889358       rs6601555       rs6601556       rs6993779       rs7814341       rs7820875       rs7841353       rs10093125       rs11776637       rs11778825       rs11780798       rs12681505      

基因表达

基因表达

XKR6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCCTTTGGTACCATCAAGGA
59
AAGGGAAGAAACCAGGTGAG
60
AATATGCAGACGTCAACATGC
59
GTCACAGAGGAGACACAGG
59
GGAGCTCTAAGCGAAAGAC
58
AGTCAGAAATCAGATGACCTC
57
TGAAGAGAACTGCAAACACTG
59
CATGGTGCGGATATACCCA
59
GTGTGGAGGTATATCCGCA
59
CATAGCCCAGTAGAAGCGT
59
ATGAAGAGAACTGCAAACACTG
60
ATGGTGCGGATATACCCAG
59
GCTCTAAGCGAAAGACATGAG
59
CTAGTCAGAAATCAGATGACCTC
58
CCCTTTGGTACCATCAAGG
58
AGGGAAGAAACCAGGTGAG
59
ATATGCAGACGTCAACATGC
59
GTCACAGAGGAGACACAGG
59
GGTGTGGAGGTATATCCGC
60
ATAGCCCAGTAGAAGCGTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

XKR6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XKR6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H0YEU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7BYF9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q5GH73 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
Q5GH73 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 XKR6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Asthma 0.12 1 1 GWASCAT
Hay fever 0.12 1 1 GWASCAT
Eosinophilic esophagitis 0.12 1 1 GWASCAT
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Autoimmune Diseases 0.002367032 1 0 GAD
Hypertriglyceridemia 0.002367032 1 0 GAD
Dyslipidemias 0.002367032 1 0 GAD
Hypertriglyceridemia result 0.002367032 1 0 GAD
Lupus Nephritis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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