XKR4 (XK related 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
XKR4
locus group:
protein-coding gene
location:
8q12.1
gene_family:
alias symbol:
KIAA1889
alias name:
None
entrez id:
114786
ensembl gene id:
ENSG00000206579
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uc003xsf.4
refseq accession:
NM_052898
hgnc_id:
HGNC:29394
approved reserved:
2005-07-28

基因染色体位置

基因染色体位置

8q12.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

XKR4（XK相关蛋白4）是XKR基因家族的一员，该家族包括XKR3、XKR4、XKR6、XKR7、XKR8和XKR9等成员，主要参与细胞膜磷脂不对称分布和细胞凋亡过程。XKR家族蛋白的共同特点是含有跨膜结构域，并在细胞表面发挥功能，尤其是与磷脂酰丝氨酸（PS）的外翻相关，这是细胞凋亡的重要标志之一。XKR4的具体功能尚未完全明确，但研究表明它可能在细胞信号传导、免疫调节或细胞死亡过程中发挥作用。XKR4的表达产物是一种膜蛋白，可能在特定组织如大脑、睾丸和免疫系统中具有重要作用。XKR4的突变可能影响其正常功能，导致细胞凋亡异常或信号传导紊乱，但目前与特定疾病的直接关联研究较少。如果XKR4过表达，可能干扰细胞正常的凋亡过程，导致细胞存活异常或自身免疫反应失调；而降低表达则可能削弱细胞对外部凋亡信号的响应，影响组织稳态。XKR家族的其他成员如XKR8已被证明与红细胞成熟和免疫逃逸有关，因此XKR4可能也具有类似功能。由于XKR4的研究相对较少，其详细机制和病理关联仍需进一步探索，但它作为XKR家族的一员，可能在细胞膜动态调节和程序性死亡中扮演关键角色。

None

无

OMIM数据库中对XKR4基因的介绍     Wikipedia数据库中对XKR4基因的介绍

基因序列

基因序列

XKR4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

XKR4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2658931       rs2929012       rs2929017       rs2929027       rs4422754       rs5891575       rs7004527       rs7818386       rs7822948       rs7839596       rs7840759       rs10098674       rs10106362       rs11326924       rs28592712       rs33913054       rs33984126      

基因表达

基因表达

XKR4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGCAAATCTGGAGATATTTCCAC
60
ACATCCGCATACTCATATACCA
59
AATCAACACAAACCCAACAG
57
TAAAGCTTGACAAGCTCCA
57
GGCAAATCTGGAGATATTTCCAC
60
ACATCCGCATACTCATATACCA
59
CATAAACATCTTGGAGCTTGTC
57
ATTAATGTTCCCTTGCAGGAG
58
GCAAATCTGGAGATATTTCCAC
58
ACATCCGCATACTCATATACC
57
TCAACACAAACCCAACAGG
59
GTAAAGCTTGACAAGCTCCA
59
CATAAACATCTTGGAGCTTGTC
57
TTAATGTTCCCTTGCAGGAG
57
GCAAATCTGGAGATATTTCCAC
58
ACATCCGCATACTCATATACC
57
GCAAATCTGGAGATATTTCCAC
58
CATCCGCATACTCATATACCA
57
GCAAATCTGGAGATATTTCCAC
58
CATCCGCATACTCATATACCA
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

XKR4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XKR4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016020
Q5GH76 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
Q5GH76 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 XKR4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Substance-Related Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Schizophrenia 0.002367032 1 0 GAD
Blood pressure finding 0.002367032 1 4 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 4 GAD
Papillary thyroid carcinoma 0.000271442 1 2 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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