XAGE5 (X antigen family member 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
XAGE5
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.22
gene_family:
alias symbol:
XAGE-5|CT12.5
alias name:
cancer/testis antigen family 12, m…
entrez id:
170627
ensembl gene id:
ENSG00000171405
ucsc gene id:
uc064zio.1
refseq accession:
NM_130775
hgnc_id:
HGNC:30930
approved reserved:
2004-08-16

基因染色体位置

基因染色体位置

Xp11.22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene is a member of the XAGE subfamily, which belongs to the GAGE family. The GAGE genes are expressed in a variety of tumors and in some fetal and reproductive tissues. The protein encoded by this gene shares a sequence similarity with other GAGE/PAGE proteins. Because of the expression pattern and the sequence similarity, this protein also belongs to a family of CT (cancer-testis) antigens. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因是XAGE亚科，属于GAGE家族的一员。的GAGE基因在多种肿瘤，并在一些胎儿和生殖组织中表达。由该基因编码的蛋白质共享与其他GAGE / PAGE的蛋白质的序列相似性。因为表达模式和序列相似性，这种蛋白也属于一个家族的CT（癌 - 睾丸）抗原。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

XAGE5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2807036       rs2807037       rs4543711       rs7057686       rs12840637       rs35769869       rs56238660       rs56249545       rs59731051       rs62597250       rs73206445       rs112445966       rs113222458       rs113286477       rs138253902       rs138313288       rs139024407      

基因表达

基因表达

XAGE5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACCAACTGAAAGTCAGGA
57
AGGTTAGGCACTTGAATCTC
57
GATAGTCCTGATGTCCAGGG
59
TTTAAAGCTGTGGTTTCCCT
58
CACCAACTGAAAGTCAGGA
57
ATCGAAGTACCTTGAATCTCAG
58
CACCAACTGAAAGTCAGGA
57
AGGTTAGGCACTTGAATCTC
57
AGCTGAGATTCAAGTGCCT
59
ACTATCTCCGCATTCATCCC
60
CTGAAAGTCAGGATCATACACC
59
CCAATATCGAAGTACCTTGAATCTC
60
ATAGTCCTGATGTCCAGGG
58
GTTTAAAGCTGTGGTTTCCC
58
AGCTGAGATTCAAGTGCCT
59
ACTATCTCCGCATTCATCCC
60
CTGAGATTCAAGTGCCTAACC
59
GACTATCTCCGCATTCATCC
58
ATAGTCCTGATGTCCAGGG
58
TTTAAAGCTGTGGTTTCCCT
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

XAGE5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XAGE5基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 XAGE5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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