WNT5B (Wnt family member 5B)

基因基本信息

基因基本信息

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WNT5B
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protein-coding gene
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12p13.33
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Wingless-type MMTV integration site family
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HGNC:16265
approved reserved:
2001-07-18

基因染色体位置

基因染色体位置

12p13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

WNT5B是WNT基因家族的重要成员之一，该家族编码一组分泌型糖蛋白，在胚胎发育、细胞增殖、分化及组织稳态中发挥关键作用。WNT5B属于非经典WNT信号通路（WNT/β-catenin非依赖通路），主要通过激活平面细胞极性（PCP）通路和WNT/Ca²⁺通路调控细胞迁移、极性建立和细胞命运决定。其表达产物WNT5B蛋白通过结合卷曲受体（Frizzled）和共受体（如ROR2/RYK）传递信号，在骨骼发育、脂肪代谢和血管形成等过程中具有特异性功能。WNT5B突变可能导致信号传导异常，与多种疾病相关，例如功能丧失性突变可能引起骨骼发育障碍（如Robinow综合征），而过度激活则与癌症（如结直肠癌、乳腺癌）和代谢性疾病（如肥胖、2型糖尿病）的发生发展密切相关。当WNT5B过表达时，会异常激活下游JNK和NF-κB等促炎通路，促进肿瘤细胞侵袭转移；同时抑制脂肪细胞分化，导致胰岛素抵抗。反之，低表达可能破坏组织再生能力，如影响骨修复或血管网络形成。WNT基因家族的共性在于均依赖脂质修饰（棕榈酰化）实现分泌，并通过保守的半胱氨酸残基与受体相互作用。目前"非经典WNT通路"（non-canonical Wnt pathway）的中文译法存在争议，部分文献直译为"非规范通路"。该家族成员功能高度分化，如WNT5A与WNT5B虽同属非经典亚型，但时空表达模式和具体生物学效应存在差异。

The WNT gene family consists of structurally related genes which encode secreted signaling proteins. These proteins have been implicated in oncogenesis and in several developmental processes, including regulation of cell fate and patterning during embryogenesis. This gene is a member of the WNT gene family. It encodes a protein which shows 94% and 80% amino acid identity to the mouse Wnt5b protein and the human WNT5A protein, respectively. Alternative splicing of this gene generates 2 transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Wnt信号基因家族由结构相关基因，其编码分泌信号蛋白。这些蛋白质有牵连肿瘤发生并在几个发育过程，包括胚胎发育过程中细胞命运和图案化的调节。此基因是WNT基因家族的一个成员。它编码表示94％和80％的氨基酸同一性分别鼠标WNT5B蛋白和人WNT5A蛋白质，蛋白质。该基因的可变剪接产生2转录变异体。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对WNT5B基因的介绍     Wikipedia数据库中对WNT5B基因的介绍

基因序列

基因序列

WNT5B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

WNT5B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2107524       rs2107525       rs2107526       rs2240506       rs2286295       rs2302029       rs2887602       rs3741975       rs3825385       rs3842302       rs4766391       rs4766392       rs4766393       rs7297671       rs7306137       rs7314710       rs7316601      

基因表达

基因表达

WNT5B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTTCCAAATGGAAACTGCT
58
AGTAGGGTTCCCTGATTCC
58
GGTCTTGCTCACAAATGGA
58
TCTTATACACAGCCATGTAGTC
58
AACTCCTGGTGGTCATTAGC
60
CAATTGGCACAGCTTCCTC
60
TCTTCCAAATGGAAACTGCT
58
GTAGGGTTCCCTGATTCCA
58
ACTCCTGGTGGTCATTAGC
59
CAATTGGCACAGCTTCCTC
60
TGGTCTTGCTCACAAATGG
58
CTTATACACAGCCATGTAGTCAC
59
TCTTCCAAATGGAAACTGCT
58
TAGGGTTCCCTGATTCCAG
58
TCTTGCTCACAAATGGATGG
59
CATCTTATACACAGCCATGTAGTC
59
CTCCTGGTGGTCATTAGCT
59
CAATTGGCACAGCTTCCTC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

WNT5B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

WNT5B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005102
F5GYM2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
F5GYM2 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
F5GYM2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
F5GYM2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005102
F5H034 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
F5H034 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
F5H034 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
F5H034 (UniProtKB)
IEA
GO:0005102
F5H364 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
F5H364 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
F5H364 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
F5H364 (UniProtKB)
IEA
GO:0005102
F5H7Q6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
F5H7Q6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
F5H7Q6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
F5H7Q6 (UniProtKB)
IEA
GO:0002062
Q9H1J7 (UniProtKB)
IEP
GO:0005102
Q9H1J7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005109
Q9H1J7 (UniProtKB)
IBA
GO:0005576
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
Q9H1J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
Q9H1J7 (UniProtKB)
IBA
GO:0005615
Q9H1J7 (UniProtKB)
NAS
GO:0005788
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0009986
Q9H1J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
Q9H1J7 (UniProtKB)
IMP
GO:0016055
Q9H1J7 (UniProtKB)
IDA
GO:0016055
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030182
Q9H1J7 (UniProtKB)
ISS
GO:0030182
Q9H1J7 (UniProtKB)
IBA
GO:0030335
Q9H1J7 (UniProtKB)
IDA
GO:0030666
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030666
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0042060
Q9H1J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0045165
Q9H1J7 (UniProtKB)
IBA
GO:0045444
Q9H1J7 (UniProtKB)
NAS
GO:0045600
Q9H1J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q9H1J7 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9H1J7 (UniProtKB)
TAS
GO:0070307
Q9H1J7 (UniProtKB)
ISS
GO:0071300
Q9H1J7 (UniProtKB)
ISS
GO:0090090
Q9H1J7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 WNT5B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Fibroid Tumor 0.122995792 1 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Adenoid Cystic Carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Salivary Gland Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.003181358 3 0 BeFree_GAD
Squamous cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Osteosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Benign Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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