VSTM2A (V-set and transmembrane domain containing 2A)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
VSTM2A
locus group:
protein-coding gene
location:
7p11.2
gene_family:
V-set domain containing
alias symbol:
MGC33530
alias name:
None
entrez id:
222008
ensembl gene id:
ENSG00000170419
ucsc gene id:
uc010kzf.4
refseq accession:
NM_182546
hgnc_id:
HGNC:28499
approved reserved:
2006-09-12

基因染色体位置

基因染色体位置

7p11.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

VSTM2A（V-set and transmembrane domain containing 2A）是一种编码跨膜蛋白的基因，属于免疫球蛋白超家族（IgSF）的V-set基因家族。该家族成员通常含有免疫球蛋白样结构域（V-set结构域）和跨膜区，参与细胞间识别、信号传导和免疫调节等过程。VSTM2A蛋白在细胞膜上表达，其V-set结构域可能介导蛋白质相互作用，但具体生物学功能尚未完全阐明。研究表明VSTM2A可能在神经发育和免疫系统中发挥作用，例如在小鼠模型中，它与神经元分化和突触形成相关。VSTM2A的突变或表达异常可能影响这些生理过程，但目前与特定疾病的直接关联证据有限。过表达VSTM2A可能干扰正常细胞信号传导，导致发育异常或免疫功能紊乱；而表达降低则可能影响神经元网络建立或免疫细胞通讯。值得注意的是，VSTM2A与同家族成员（如VSTM1、VSTM2B等）具有相似的结构特征，但功能可能存在分化。该基因在多种组织中表达，包括大脑、免疫器官和内分泌组织，提示其多功能性。近期研究还发现VSTM2A可能与某些癌症（如胶质瘤）的进展相关，可能通过调节肿瘤微环境发挥作用，但具体机制仍需进一步探索。由于研究尚处早期阶段，其精确分子机制和病理学意义仍需更多实验验证。

None

无

OMIM数据库中对VSTM2A基因的介绍     Wikipedia数据库中对VSTM2A基因的介绍

基因序列

基因序列

VSTM2A基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

VSTM2A基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs587529       rs939966       rs939967       rs950654       rs950655       rs950656       rs1403237       rs2687258       rs2692098       rs2870646       rs2877216       rs3173668       rs3893317       rs4425711       rs4947471       rs4947472       rs4947914      

基因表达

基因表达

VSTM2A基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGATCAGCACAGTGAAAGTC
58
CCCTGCACTCATATAAGCC
58
AAAGTCCACAATCAGGTGC
58
AAAGCAAAGCACCCTTCAC
59
AGATCAGCACAGTGAAAGTC
58
CCCTGCACTCATATAAGCC
58
AAAGTCCACAATCAGGTGC
58
AAAGCAAAGCACCCTTCAC
59
AGAGAAGGAAGTGGAGCTC
58
TCATTGCCTTGGACTTTCAC
59
ACAACAAGGGCTTTCTTCTC
58
GACATCTCCACATTCTGCC
58
CAAAGTCCACAATCAGTGTCTC
60
GAAGAAAGGAAGGACTAGTAGAGG
60
AAAGTCCACAATCAGCAAAGAG
60
GGTGCTTGGAGTTTAGGGT
60
ACAATCAGGCCAATTTAGAAGC
60
CATTGGCTGAATGACTGCA
59
AAGGGCTTTCTTCTCAAGC
58
ACATCTCCACATTCTGCCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

VSTM2A基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VSTM2A基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q8TAG5 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 VSTM2A基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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