VOPP1 (VOPP1 WW domain binding protein)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
VOPP1
locus group:
protein-coding gene
location:
7p11.2
gene_family:
alias symbol:
ECop|GASP|FLJ20532|DKFZp564K0822|WBP1L2
alias name:
Glioblastoma-amplified secreted pr…
entrez id:
81552
ensembl gene id:
ENSG00000154978
ucsc gene id:
uc003tqs.5
refseq accession:
NM_030796
hgnc_id:
HGNC:34518
approved reserved:
2009-07-30

基因染色体位置

基因染色体位置

7p11.2
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

VOPP1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs113847247       rs190883796       rs540177571       rs550198807       rs559746720       rs565210545       rs1404564       rs1880528       rs2030734       rs2222589       rs4439077       rs5884422       rs7790820       rs7794340       rs7807334       rs7807352       rs7807357      

基因表达

基因表达

VOPP1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGAAGGACTCTATCCAACCT
59
AGAAGGAACCAGAAGTACCAC
60
CATCTTGCAGACTGCACAG
59
CCACAGCCTCTGTATGGAG
60
CGAAGGACTCTATCCAACCT
58
AGAAGGAACCAGAAGTACCAC
59
GGTACTTCTGGTTCCTTCTG
58
GTAGGACACATTGAAGGCT
57
GTTGAGAGTGCACAGAAGC
59
CCCATCATCAGAAGGAACCA
60
CCTAGGAAGAGGTGCACAG
60
TGTAGGACACATTGAAGGCT
59
CGAAGGACTCTATCCAACCT
59
AGAAGGAACCAGAAGTACCAC
60
CTTCTGTGCTCTTGCAGTG
59
TCAGAAGGAACCAGAAGTACC
59
GGTACTTCTGGTTCCTTCTG
58
GTAGGACACATTGAAGGCT
57
TTCCTTCTGATGATGGGCG
60
GAGTATATGGTCTGGGCCG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

VOPP1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VOPP1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C9JVH1 (UniProtKB)
IEA
GO:0030659
C9JVH1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004871
Q96AW1 (UniProtKB)
IMP
GO:0005768
Q96AW1 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q96AW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q96AW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
Q96AW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0030659
Q96AW1 (UniProtKB)
IDA
GO:0031301
Q96AW1 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 VOPP1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.12 1 0 CTD_human
Squamous cell carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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