VCAM1 (vascular cell adhesion molecule 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
VCAM1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p21.2
gene_family:
CD molecules|Endogenous ligands|C2-set domain containing|I-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
CD106
alias name:
None
entrez id:
7412
ensembl gene id:
ENSG00000162692
ucsc gene id:
uc001dti.5
refseq accession:
NM_001078
hgnc_id:
HGNC:12663
approved reserved:
1991-07-10

基因染色体位置

基因染色体位置

1p21.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

VCAM1（血管细胞粘附分子1，英文全称Vascular Cell Adhesion Molecule-1）是一种位于细胞表面的免疫球蛋白超家族成员，主要表达于活化的内皮细胞、巨噬细胞和某些上皮细胞。它的生物学功能是通过与免疫细胞表面的整合素受体（如VLA-4，即α4β1整合素）结合，介导白细胞与血管内皮的粘附，从而促进炎症反应中白细胞的迁移和浸润。VCAM1在慢性炎症、动脉粥样硬化、自身免疫性疾病和肿瘤转移等病理过程中起关键作用。VCAM1的作用位点集中在炎症或损伤部位的血管内皮，通过信号转导调控免疫细胞的募集。若VCAM1发生突变（如启动子区多态性），可能导致其表达异常，进而影响炎症反应的强度，例如某些突变与类风湿性关节炎或哮喘的易感性相关。VCAM1过表达会加剧炎症性疾病或促进肿瘤细胞转移，而降低表达（如通过抗体阻断或基因沉默）可减轻炎症损伤或抑制癌细胞扩散。VCAM1属于免疫球蛋白超家族（IgSF），该家族共性为含有免疫球蛋白样结构域，参与细胞间识别和信号传递。目前VCAM1的中文译名较统一，但需注意其别名CD106（分化簇106）在免疫学中的使用。

This gene is a member of the Ig superfamily and encodes a cell surface sialoglycoprotein expressed by cytokine-activated endothelium. This type I membrane protein mediates leukocyte-endothelial cell adhesion and signal transduction, and may play a role in the development of artherosclerosis and rheumatoid arthritis. Three alternatively spliced transcripts encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

此基因是免疫球蛋白超家族的成员，并且编码唾液酸糖蛋白通过细胞因子激活的内皮表达的细胞表面。本的I型膜蛋白介导白细胞 - 内皮细胞粘附和信号转导，并可能在动脉粥样硬化和类风湿关节炎的发展中的作用。三个编码不同同种型的可变剪接转录物已经为这种基因说明。 [由RefSeq的，2010年12月提供]

OMIM数据库中对VCAM1基因的介绍     Wikipedia数据库中对VCAM1基因的介绍

基因序列

基因序列

VCAM1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

VCAM1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1041163       rs1409419       rs1476408       rs2209627       rs2392221       rs3170794       rs3176859       rs3176860       rs3176861       rs3176862       rs3176863       rs3176864       rs3176865       rs3176867       rs3176868       rs3176869       rs3176870      

基因表达

基因表达

VCAM1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGACAAACATGCATCTTGG
58
AAAGAGAAGGGAATCAAAGCAG
59
GTTTGCAGCTTCTCAAGCT
59
TCAATGAGACGGAGTCACC
59
TTGTTCAAGCATTCCCTAGAG
58
TTGCAGCTTACAGTGACAG
58
GGTGGAGCTCTACTCATTCC
60
CTTACAGTGACAGAGCTCCC
60
GGTGGAGCTCTACTCATTCC
60
CTTACAGTGACAGAGCTCCC
60
GTTTGCAGCTTCTCAAGCT
59
TCAATGAGACGGAGTCACC
59
TCTTATCTGTGCACAGTGAC
58
ATCTCTAGGGAATGAGTAGAGC
58
TGTTCAAGCATTCCCTAGAG
57
TTGCAGCTTACAGTGACAG
58
TCAGACAAACATGCATCTTGG
59
AAGAGAAGGGAATCAAAGCAG
58
TGTTTGCAGCTTCTCAAGC
59
CAATGAGACGGAGTCACCA
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
EP300
VCAM1
Activation
19281832
HDAC4
VCAM1
Activation
19281832
HOXA9
VCAM1
Unknown
22269951
IKBKB
VCAM1
Repression
18600306
IRF1
VCAM1
Unknown
15265939; 22182512
JUN
VCAM1
Activation
16271621
NFKB1
VCAM1
Activation
10329958; 10946302; 11359843; 16271621; 16317091; 16385502; 19281832; 19422386; 22708120
NFKB1
VCAM1
Unknown
10553096; 10833420; 16453001
POU2F1
VCAM1
Repression
9694713
RELA
VCAM1
Activation
10329958; 10946302; 11359843; 16317091; 16385502; 19281832; 19422386; 22708120

基因本体信息

VCAM1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VCAM1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
E9PDD2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016337
E9PDD2 (UniProtKB)
IEA
GO:0001666
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0002102
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0002526
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0002544
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0005178
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0005178
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0005178
P19320 (UniProtKB)
IMP
GO:0005178
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0005769
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P19320 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P19320 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P19320 (UniProtKB)
TAS
GO:0005902
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0007155
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0007157
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0007159
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0007159
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0007159
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0007160
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0007568
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0007584
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0008131
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0009308
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0009897
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0010043
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0010212
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0016032
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0022614
P19320 (UniProtKB)
IEP
GO:0030175
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0030183
P19320 (UniProtKB)
IC
GO:0030198
P19320 (UniProtKB)
TAS
GO:0032496
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0035094
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0035584
P19320 (UniProtKB)
IGI
GO:0035924
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0042102
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0042383
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0045177
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0045471
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0050776
P19320 (UniProtKB)
TAS
GO:0050839
P19320 (UniProtKB)
IPI
GO:0050839
P19320 (UniProtKB)
IPI
GO:0050839
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0050901
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0050901
P19320 (UniProtKB)
IEP
GO:0055114
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0060326
P19320 (UniProtKB)
IEA
GO:0060333
P19320 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0071065
P19320 (UniProtKB)
IDA
GO:0071356
P19320 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 VCAM1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypertensive disease 0.200542884 5 0 BeFree_CTD_human_RGD
Atherosclerosis 0.14151731 28 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Cardiovascular Diseases 0.129172942 8 2 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Anemia, Sickle Cell 0.126634157 10 0 BeFree_CTD_human_GAD
Multiple Sclerosis 0.125005506 4 1 BeFree_CTD_human_GAD
Hypercholesterolemia 0.121085767 5 0 BeFree_CTD_human
Cholestasis 0.12 1 0 CTD_human
Liver carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Myocardial Ischemia 0.12 1 0 CTD_human
Urticaria 0.12 1 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

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