VAMP1 (vesicle associated membrane protein 1)

symbol:
VAMP1
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.31
gene_family:
Vesicle-associated membrane proteins
alias symbol:
VAMP-1
alias name:
None
entrez id:
6843
ensembl gene id:
ENSG00000139190
ucsc gene id:
uc001qok.4
refseq accession:
NM_001297438
hgnc_id:
HGNC:12642
approved reserved:
1990-03-14
12p13.31
基因染色体位置图

VAMP1(囊泡相关膜蛋白1,英文全称Vesicle-Associated Membrane Protein 1)属于SNARE蛋白家族中的VAMP/synaptobrevin亚家族,主要参与神经递质释放过程中的囊泡融合。该基因编码的蛋白质是一种跨膜蛋白,位于突触小泡膜上,通过与突触前膜的Syntaxin和SNAP-25等SNARE蛋白结合形成复合体,介导突触小泡与细胞膜的融合,从而释放神经递质。VAMP1在中枢神经系统和外周神经系统中高表达,尤其在胆碱能神经元中发挥关键作用。若VAMP1发生突变(如错义突变或缺失突变),可能导致其无法正常参与SNARE复合体形成,进而引发突触传递功能障碍,与多种神经系统疾病相关,如先天性肌无力综合征(CMS)和某些类型的癫痫。VAMP1过表达可能扰乱神经递质释放的精确调控,导致神经元过度兴奋或抑制失衡;而表达降低则可能减弱突触传递效率,影响运动协调和认知功能。VAMP1所属的VAMP/synaptobrevin基因家族成员均含有保守的SNARE结构域,共性是通过形成SNARE复合体驱动膜融合事件。该家族其他成员如VAMP2和VAMP3分别调控不同细胞器的膜融合过程,而VAMP1特异性参与神经递质释放。目前研究还发现VAMP1可能与阿尔茨海默病中突触功能障碍有关,但其机制尚待进一步阐明。

Synapotobrevins, syntaxins, and the synaptosomal-associated protein SNAP25 are the main components of a protein complex involved in the docking and/or fusion of synaptic vesicles with the presynaptic membrane. The protein encoded by this gene is a member of the vesicle-associated membrane protein (VAMP)/synaptobrevin family. Mutations in this gene are associated with autosomal dominant spastic ataxia 1. Multiple alternative splice variants have been described, but the full-length nature of some variants has not been defined. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Synapotobrevins,syntaxins和突触相关蛋白SNAP25涉及在对接和/或突触小泡融合的突触前膜蛋白复合物的主要成分。由该基因编码的蛋白质是囊泡相关膜蛋白(VAMP)/突触家族的一个成员。在这种基因突变与常染色体显性遗传性痉挛性共济失调1.多个备选剪接变体已被描述相关联,但某些变体的全长性质尚未定义。 [由RefSeq的,2014年7月提供]

VAMP1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
VAMP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7390       rs1045548       rs34434676       rs71584826       rs71584828       rs112343707       rs115526614       rs117358859       rs117836679       rs138172426       rs139235612       rs139613151       rs139938131       rs141838188       rs142636658       rs142707363       rs145531892      

VAMP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATGTGGTGGACATCATACG
58
CTCTGACAGCTTCTGGTCC
59
GAGGAACAGACCCTCACTC
59
ACGTTCACACGTATGATGTC
58
GGTAGTTATTGTAAGGCGGG
58
GAGAGTGGAGACCTTCGAG
59
ACCAGTAACAGACGACTACAG
59
GTATGATGTCCACCACCTC
57
AGGAGCATCACAATTTGAGAG
58
TCAATCTGAGAAAGCTTGCAG
59
CCAAGCTAAAGAGGAAGTATTGG
59
CAGCCTCTTCTTACAATAACTACC
59
ACCAGTAACAGACGACTACAG
59
GTATGATGTCCACCACCTC
57
ACCAGTAACAGACGACTACAG
59
GTATGATGTCCACCACCTC
57
ACCAGTAACAGACGACTACAG
59
GTATGATGTCCACCACCTC
57
CAAGCTAAAGAGGAAGTATTGGTG
60
CAGCCTCTTCTTACAATAACTACC
59
      尚未收录相关数据

VAMP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VAMP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
F5GZV7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016192
F5GZV7 (UniProtKB)
IEA
GO:0000149
P23763 (UniProtKB)
IBA
GO:0005484
P23763 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
P23763 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P23763 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P23763 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P23763 (UniProtKB)
IPI
GO:0005741
P23763 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
P23763 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P23763 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P23763 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P23763 (UniProtKB)
TAS
GO:0006887
P23763 (UniProtKB)
IBA
GO:0006906
P23763 (UniProtKB)
IBA
GO:0009986
P23763 (UniProtKB)
IEA
GO:0030054
P23763 (UniProtKB)
IEA
GO:0030672
P23763 (UniProtKB)
TAS
GO:0030672
P23763 (UniProtKB)
TAS
GO:0030672
P23763 (UniProtKB)
TAS
GO:0031201
P23763 (UniProtKB)
IBA
GO:0035493
P23763 (UniProtKB)
IEA
GO:0035579
P23763 (UniProtKB)
IDA
GO:0043195
P23763 (UniProtKB)
IEA
GO:0070821
P23763 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
P23763 (UniProtKB)
IDA
GO:0035577
P23763 (UniProtKB)
IDA

可能调控 VAMP1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
ATAXIA, SPASTIC, 1, AUTOSOMAL DOMINANT 0.24 0 0 CLINVAR_ORPHANET
Parathyroid Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Adenoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Ataxia 0.000271442 1 0 BeFree
Spastic Paraplegia 0.000271442 1 0 BeFree
Alzheimer's Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Spastic Ataxia 0.000271442 1 0 BeFree
Cocaine Dependence 0.000271442 1 0 BeFree
Schizophrenia 0.000271442 1 0 BeFree
nervous system disorder 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。