UCA1 (urothelial cancer associated 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
UCA1
locus group:
non-coding RNA
location:
19p13.12
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
LINC00178|CUDR|UCAT1|onco-lncRNA-36
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
652995
ensembl gene id:
ENSG00000214049
ucsc gene id:
uc002nbr.5
refseq accession:
NR_015379
hgnc_id:
HGNC:37126
approved reserved:
2009-07-15

基因染色体位置

基因染色体位置

19p13.12
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

UCA1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs13896       rs14366       rs916957       rs1319147       rs1859300       rs4808389       rs7247124       rs7255437       rs7257698       rs7257792       rs7258210       rs7258861       rs7259139       rs7259448       rs11085994       rs11085995       rs11085996      

基因表达

基因表达

UCA1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTTCAAATCGGATCTCCTCG
58
ATCTGTGATGGTCCAAGGG
59
GACAACAGTACACGCATATGG
60
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59
GACAACAGTACACGCATATGG
60
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59
TTCAAATCGGATCTCCTCG
57
CATCTGTGATGGTCCAAGG
58
GACAACAGTACACGCATATGG
60
ATTGCAGATCTTTGTGTTGTCC
60
GACAACAGTACACGCATATGG
60
ATTGCAGATCTTTGTGTTGTCC
60
TTCAAATCGGATCTCCTCGG
60
ATCTGTGATGGTCCAAGGG
59
ACAACAGTACACGCATATGG
58
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59
ACAACAGTACACGCATATGG
58
GATTGCAGATCTTTGTGTTGTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

UCA1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

UCA1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 UCA1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.003528744 13 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.003528744 13 0 BeFree
Bladder Neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Carcinoma, Transitional Cell 0.001900093 7 0 BeFree
Urothelial Carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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