UBE2D3 (ubiquitin conjugating enzyme E2 D3)

symbol:
UBE2D3
locus group:
protein-coding gene
location:
4q24
gene_family:
Ubiquitin-conjugating enzymes E2
alias symbol:
UbcH5C
alias name:
None
entrez id:
7323
ensembl gene id:
ENSG00000109332
ucsc gene id:
uc003hwi.5
refseq accession:
NM_181893
hgnc_id:
HGNC:12476
approved reserved:
1997-03-21
4q24

UBE2D3(Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2 D3)是一种泛素结合酶,属于UBE2D基因家族(也称为UBC4/5家族),该家族成员在泛素-蛋白酶体系统中负责将泛素分子转移到靶蛋白上,介导蛋白质的降解或功能调控。UBE2D3的核心功能是作为E2泛素结合酶,与E1激活酶和E3泛素连接酶协作,通过泛素化修饰(即给靶蛋白添加泛素标签)调控细胞周期、DNA修复、信号转导等关键过程。其作用位点主要在细胞质和细胞核内,参与多种蛋白的泛素化反应,如p53、IκBα等。UBE2D3突变可能导致泛素化功能异常,影响靶蛋白的稳定性或活性,例如突变可能削弱抑癌蛋白p53的泛素化降解,导致其积累并引发细胞凋亡或肿瘤抑制功能紊乱。该基因与癌症(如乳腺癌、结直肠癌)、神经退行性疾病(如帕金森病)相关,因其泛素化失调可能促进异常蛋白聚集或致癌信号通路激活。UBE2D3过表达可能加速某些促癌蛋白(如cyclin D1)的降解,抑制肿瘤生长,但也可能过度降解抑癌蛋白(如PTEN),反而促进肿瘤;而表达降低会导致错误蛋白堆积,引发神经退行性病变或基因组不稳定性。UBE2D家族共性包括保守的催化结构域(UBC domain)和高度相似的泛素转移机制,但成员间靶标特异性不同。专业术语解释:泛素化(ubiquitination)是一种蛋白质翻译后修饰,通过添加泛素分子标记目标蛋白以供降解或功能调节;蛋白酶体(proteasome)是细胞内降解泛素化蛋白的复合体。若中文术语不准确,可参考英文注释(如:泛素结合酶E2D3原为UBE2D3)。

The modification of proteins with ubiquitin is an important cellular mechanism for targeting abnormal or short-lived proteins for degradation. Ubiquitination involves at least three classes of enzymes: ubiquitin-activating enzymes, or E1s, ubiquitin-conjugating enzymes, or E2s, and ubiquitin-protein ligases, or E3s. This gene encodes a member of the E2 ubiquitin-conjugating enzyme family. This enzyme functions in the ubiquitination of the tumor-suppressor protein p53, which is induced by an E3 ubiquitin-protein ligase. Multiple spliced transcript variants have been found for this gene, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

与泛素蛋白的修饰是降解目标异常或短命的蛋白质一种重要的细胞机制。泛素化涉及至少三类酶:泛素激活酶,或个E1,泛素结合酶,或E2S,和泛素 - 蛋白质连接酶,或E3酶。这个基因编码的E2泛素结合酶家族的一个成员。在肿瘤抑制蛋白p53,其由E3泛素 - 蛋白连接酶诱导的泛素化这种酶的功能。多种剪接转录变体已被发现对于此基因,但一些变体的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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UBE2D3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs223332       rs223333       rs223334       rs2198199       rs11418599       rs34403962       rs62327285       rs72933535       rs75083634       rs76126481       rs76372697       rs77950594       rs79799774       rs111997806       rs112525907       rs112995765       rs113368206      

UBE2D3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGCTGAAACGGATTAATAAGGA
59
TGCCAATGAAACATATCATCCC
59
GGGATGATATGTTTCATTGGC
58
TATCGAGACAAATGCTGCC
58
GGGATGATATGTTTCATTGGCA
59
GCCTTAGGTGGTTTGAAGG
59
TTCAAACCACCTAAGGTTGC
59
GAATATCGAGACAAATGCTGC
58
AGCCACAATTATGGGACCT
59
GTAAATGCAACCTTAGGTGGT
59
GGGATGATATGTTTCATTGGCA
59
AGACAAATGCTGCCATTACTG
59
TTCAAACCACCTAAGGTTGC
59
AATATCGAGACAAATGCTGCC
59
CGCTGAAACGGATTAATAAGG
58
GCCAATGAAACATATCATCCC
58
GGGATGATATGTTTCATTGGC
58
GCCTTAGGTGGTTTGAAGG
59
AAGCCACAATTATGGGACC
58
TAAATGCAACCTTAGGTGGT
57
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
SNAI2
UBE2D3
Repression

UBE2D3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

UBE2D3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
P61077 (UniProtKB)
TAS
GO:0000209
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0000209
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0006281
P61077 (UniProtKB)
IEA
GO:0006464
P61077 (UniProtKB)
TAS
GO:0006511
P61077 (UniProtKB)
TAS
GO:0006513
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0006915
P61077 (UniProtKB)
IEA
GO:0016567
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0016567
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0030509
P61077 (UniProtKB)
TAS
GO:0035666
P61077 (UniProtKB)
TAS
GO:0043161
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0051865
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0061418
P61077 (UniProtKB)
TAS
GO:0070936
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:0070979
P61077 (UniProtKB)
IDA
GO:1903955
P61077 (UniProtKB)
IMP

可能调控 UBE2D3基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Thyroid Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma breast stage IV 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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