TVP23C-CDRT4 (TVP23C-CDRT4 readthrough)

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TVP23C-CDRT4
locus group:
other
location:
17p12
gene_family:
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None
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None
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100533496
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ENSG00000259024
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uc032eus.2
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NM_001204478
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HGNC:42961
approved reserved:
2011-09-28
17p12
基因染色体位置图

TVP23C-CDRT4基因属于TVP23基因家族,该家族成员主要编码跨膜蛋白,参与囊泡运输和高尔基体的结构维持。TVP23C-CDRT4基因的产物是一种跨膜蛋白,可能在蛋白质分选和细胞内运输过程中发挥作用,特别是在高尔基体到内质网的逆向运输中。该基因的表达产物与其他TVP23家族成员类似,具有保守的跨膜结构域,能够与其他运输相关蛋白相互作用,共同维持细胞内物质运输的平衡。TVP23C-CDRT4基因的突变可能导致其功能异常,进而影响高尔基体的正常结构和功能,导致细胞内蛋白质运输紊乱,可能引发某些代谢性疾病或神经退行性疾病。研究表明,该基因的过表达可能导致高尔基体过度活跃,影响蛋白质的正确分选和运输,进而干扰细胞的正常生理功能。而降低表达则可能导致高尔基体功能不足,同样影响蛋白质运输和细胞稳态。TVP23基因家族的共性在于它们都编码与囊泡运输和高尔基体功能相关的跨膜蛋白,这些蛋白在维持细胞内物质运输和细胞器结构方面发挥重要作用。TVP23C-CDRT4基因与其他家族成员在序列和功能上具有相似性,但也可能存在一些独特的调控机制或功能特点。目前关于该基因与特定疾病的关系研究仍在进行中,但已有证据表明它可能与某些遗传性疾病或癌症的发生发展有关。进一步的研究将有助于揭示TVP23C-CDRT4基因的详细功能及其在疾病中的作用机制。

This locus represents naturally occurring readthrough transcription between the neighboring TVP23C (trans-golgi network vesicle protein 23 homolog) and CDRT4 (CMT1A duplicated region transcript 4) genes on chromosome 17. Alternative splicing results in multiple transcript variants, one of which encodes a protein that shares sequence identity with the upstream gene product, but its C-terminus is distinct due to frameshifts relative to the downstream gene. [provided by RefSeq, Apr 2014]

此轨迹表示天然存在的相邻TVP23C(反高尔基网泡蛋白23同源物)和CDRT4之间通读转录(CMT1A重复区域转录物4)的基因在染色体17选择性剪接的结果在多个转录变异体,其中一个编码共享与上游基因产物的序列同一性的蛋白,但它的C-末端是不同由于相对于下游基因移码。 [由RefSeq的,2014年4月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TVP23C-CDRT4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs236814       rs236815       rs62070361       rs74501266       rs75371975       rs77011017       rs77138417       rs79358718       rs79810081       rs116383377       rs185787172       rs374657038       rs528103825       rs530509943       rs532655187       rs541802887       rs543642838      

TVP23C-CDRT4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCAGCTTTATTACCTGTATGGT
59
GTCTACCTGTGACATTCTTCAC
59
GATGACACTGAAGATGTTTCAC
58
CGATGCTACTGGATGTCTG
58
AGCAGGATAGTAATGATGACAC
58
TTAGTCTACCTGTGACATTCTG
57
AGCAGGATAGTAATGATGACAC
58
TTAGTCTACCTGTGACATTCTG
57
TGACACTGAAGATGTTTCACTG
59
ACGATGCTACTGGATGTCTG
60
GATGACACTGAAGATGTTTCAC
58
TTAGTCTACCTGTGACATTCTG
57
GATGACACTGAAGATGTTTCAC
58
TTAGTCTACCTGTGACATTCTG
57
AGCAGCTTTATTACCTGTATGG
58
TCTACCTGTGACATTCTTCAC
58
CAGCAGCTTTATTACCTGTATGG
60
CTACCTGTGACATTCTTCACTG
59
GACACTGAAGATGTTTCACTG
57
CGATGCTACTGGATGTCTG
58
      尚未收录相关数据

TVP23C-CDRT4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TVP23C-CDRT4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A0A6YYB9 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TVP23C-CDRT4基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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