TTR (transthyretin)

symbol:
TTR
locus group:
protein-coding gene
location:
18q12.1
gene_family:
alias symbol:
HsT2651|CTS
alias name:
None
entrez id:
7276
ensembl gene id:
ENSG00000118271
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uc002kwx.5
refseq accession:
NM_000371
hgnc_id:
HGNC:12405
approved reserved:
1986-01-01
18q12.1
基因染色体位置图

TTR(转甲状腺素蛋白,英文全称Transthyretin)是一种主要由肝脏和脉络丛合成的四聚体蛋白,属于载脂蛋白家族(lipocalin family)成员。其核心生物学功能是运输甲状腺激素(T4)和视黄醇(通过与视黄醇结合蛋白RBP结合),在维持甲状腺激素分布和维生素A代谢中起关键作用。TTR主要在血液、脑脊液和眼中表达,其中血浆中的TTR还可作为营养状态标志物(低水平提示营养不良)。TTR基因位于18号染色体(18q12.1),其突变会导致蛋白质结构不稳定,形成错误折叠的淀粉样纤维沉积,引发遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性(ATTR),分为神经型(周围神经病变)和心脏型(心肌肥厚)两类,常见突变如Val30Met。野生型TTR(非突变型)在老年人中也可能因年龄相关错误折叠导致获得性系统性淀粉样变(wtATTR)。TTR过表达可能加剧淀粉样沉积风险,而表达降低通常与营养不良或炎症相关,但不会直接致病。TTR基因家族(lipocalins)的共性是具有β-桶状结构(β-barrel)的保守折叠模式,可结合疏水小分子。目前针对TTR淀粉样变性的治疗包括基因沉默药物(如Patisiran)和稳定四聚体的药物(如Tafamidis)。需要注意的是,"转甲状腺素蛋白"这一中文译名可能引起误解(原英文名Transthyretin反映其运输甲状腺素和视黄醇的双重功能),部分文献也使用"运甲状腺素蛋白"。

This gene encodes transthyretin, one of the three prealbumins including alpha-1-antitrypsin, transthyretin and orosomucoid. Transthyretin is a carrier protein; it transports thyroid hormones in the plasma and cerebrospinal fluid, and also transports retinol (vitamin A) in the plasma. The protein consists of a tetramer of identical subunits. More than 80 different mutations in this gene have been reported; most mutations are related to amyloid deposition, affecting predominantly peripheral nerve and/or the heart, and a small portion of the gene mutations is non-amyloidogenic. The diseases caused by mutations include amyloidotic polyneuropathy, euthyroid hyperthyroxinaemia, amyloidotic vitreous opacities, cardiomyopathy, oculoleptomeningeal amyloidosis, meningocerebrovascular amyloidosis, carpal tunnel syndrome, etc. [provided by RefSeq, Jan 2009]

该基因编码运甲状腺素,三prealbumins包括α-1-抗胰蛋白酶,运甲状腺素和血清类粘蛋白中的一个。甲状腺素运载蛋白是载体蛋白;它输送的血浆和脑脊液甲状腺激素,并且还传送视黄醇(维生素A)的等离子体英寸该蛋白由相同亚基的四聚体的。这种基因有超过80个不同的突变被报道;大多数突变都与淀粉样蛋白沉积,主要影响外周神经和/或心脏,和基因突变的一小部分是非淀粉样。突变引起的疾病包括淀粉样多神经病,甲状腺机能正常血症,淀粉样变性的玻璃体混浊,心肌病,oculoleptomeningeal淀粉样变性,淀粉样变性病meningocerebrovascular,腕管综合症,等等。通过的RefSeq,2009年1月提供]

TTR基因的碱基序列:[NCBI]
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TTR基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs12226       rs723744       rs1061978       rs1080093       rs1080094       rs1551005       rs1667246       rs1667250       rs1667251       rs1791227       rs1791228       rs1800458       rs1803084       rs2276382       rs3764476       rs3764477       rs3764478      

TTR基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTTACTGGAAGGCACTTGG
60
GAATAGGAGTAGTAGCGGCG
60
TGCTGGACTGGTATTTGTG
58
AGGACACTTGGATTCACCG
60
AACAGATGGCTGTCATGGA
59
ACATTCTGATGGAACCCTGAG
60
CATGCAGAGGTGGTATTCAC
59
CGTGGTGGAATAGGAGTAGG
59
TGCTGGACTGGTATTTGTG
58
AGGACACTTGGATTCACCG
60
ATGCAGAGGTGGTATTCAC
57
TCATTCCTTGGGATTGGTG
57
CATGCAGAGGTGGTATTCAC
58
CATTCCTTGGGATTGGTGAC
59
CATGCAGAGGTGGTATTCAC
59
GTGGTGGAATAGGAGTAGGG
59
GGACTGGTATTTGTGTCTGAG
59
TCAGAGGACACTTGGATTCAC
60
GGACTGGTATTTGTGTCTGAG
59
TCAGAGGACACTTGGATTCAC
60
      尚未收录相关数据

TTR基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TTR基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
A0A087WT59 (UniProtKB)
IEA
GO:0042572
A0A087WT59 (UniProtKB)
IEA
GO:0070324
A0A087WT59 (UniProtKB)
IEA
GO:0070327
A0A087WT59 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
A0A087WV45 (UniProtKB)
IEA
GO:0042572
A0A087WV45 (UniProtKB)
IEA
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A0A087WV45 (UniProtKB)
IEA
GO:0070327
A0A087WV45 (UniProtKB)
IEA
GO:0001523
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0001523
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005179
P02766 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
NAS
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P02766 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
P02766 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
P02766 (UniProtKB)
IEA
GO:0030198
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0042562
P02766 (UniProtKB)
IEA
GO:0042572
P02766 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0042802
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0042802
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0042802
P02766 (UniProtKB)
IPI
GO:0043234
P02766 (UniProtKB)
IEA
GO:0044267
P02766 (UniProtKB)
TAS
GO:0046982
P02766 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P02766 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P02766 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TTR基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
AMYLOIDOSIS, HEREDITARY, TRANSTHYRETIN-RELATED 0.487600372 67 39 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
Dystransthyretinemic Euthyroidal Hyperthyroxinemia 0.36 1 1 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Carpal Tunnel Syndrome 0.246795978 16 1 BeFree_CTD_human_LHGDN_UNIPROT
Amyloidosis 0.206845043 257 1 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Amyloid Neuropathies, Familial 0.20616759 160 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Amyloidosis, Familial 0.12868614 34 1 BeFree_CTD_human
Lung Neoplasms 0.1254487 4 0 CTD_human_LHGDN
Drug Eruptions 0.12 1 0 CTD_human
Drug-Induced Liver Injury 0.12 1 0 CTD_human
AMYLOIDOSIS, LEPTOMENINGEAL, TRANSTHYRETIN-RELATED 0.12 0 5 CLINVAR

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