TTC4 (tetratricopeptide repeat domain 4)

symbol:
TTC4
locus group:
protein-coding gene
location:
1p32.3
gene_family:
Tetratricopeptide repeat domain containing
alias symbol:
MGC5097|FLJ41930|CNS1
alias name:
None
entrez id:
7268
ensembl gene id:
ENSG00000243725
ucsc gene id:
uc001cxx.5
refseq accession:
NM_004623
hgnc_id:
HGNC:12394
approved reserved:
1998-08-26
1p32.3
基因染色体位置图

TTC4(Tetratricopeptide Repeat Domain 4)是一个编码含有四肽重复序列(TPR)结构域蛋白的基因,属于TPR基因家族。TPR家族蛋白的共同特点是含有34个氨基酸的重复序列,这些重复序列形成螺旋结构,介导蛋白质-蛋白质相互作用,参与多种细胞过程如信号转导、细胞周期调控和分子伴侣功能。TTC4蛋白通过其TPR结构域与其他蛋白结合,可能在蛋白质折叠、转运或复合体组装中发挥作用,但具体生物学功能尚未完全明确。该基因的主要作用位点可能在细胞质或细胞核内,参与维持细胞稳态。目前关于TTC4突变的研究较少,但TPR家族基因的突变通常会影响蛋白相互作用,可能导致功能丧失或异常,进而干扰相关通路。有研究提示TTC4可能与乳腺癌等疾病相关,其表达异常可能影响细胞增殖或凋亡通路。若TTC4过表达,可能通过异常蛋白互作干扰正常细胞功能;而表达降低可能导致依赖其功能的通路失调。TPR家族成员(如CDC23、PEX5等)多参与细胞周期、过氧化物酶体代谢等保守过程,TTC4可能具有类似功能但需进一步验证。需要注意的是,现有关于TTC4的研究有限,部分机制仍属推测,其临床关联性及分子机制需更多实验支持。术语解释:四肽重复序列(TPR)是一种蛋白相互作用模体;分子伴侣(chaperone)指协助蛋白质正确折叠的辅助蛋白。

This gene encodes a protein that contains tetratricopeptide (TPR) repeats, which often mediate protein-protein interactions and chaperone activity. The encoded protein interacts with heat shock proteins 70 and 90. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Naturally-occuring readthrough transcription occurs from upstream gene MROH (maestro heat-like repeat family member 7) to this gene. [provided by RefSeq, Apr 2014]

这个基因编码包含三十四肽(TPR)重复序列,这往往介导蛋白质 - 蛋白质相互作用和分子伴侣活性的蛋白质。所编码的蛋白质与热休克蛋白70,并在多个转录变异体90.选择性剪接的结果相互作用。天然产生的转录通读从上游基因MROH(大师热样重复家族成员7)该基因发生。 [由RefSeq的,2014年4月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TTC4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs945       rs946       rs947       rs948       rs949       rs950       rs951       rs13046       rs1062700       rs1134128       rs1147989       rs1147990       rs1180932       rs1180937       rs1180973       rs1180974       rs1911229      

TTC4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGATGTTTGGTGAAACACCC
59
CCTCATCCTCAAAGTAGACCTC
60
CTTTGAGGATGAGGACAGGG
60
TACAAAGTACCTCTGGTGCTG
60
TGATCCCAGGGAGAATCCT
59
CTTGGCCTGTTCTTCTGGA
60
CTTTCATGAGGACCAGTGG
58
TCAAATTCCTAGAAACCAGCG
59
CAGCTATGGAACAACCTGG
58
TTCAAATTCCTTCTCCCACTG
58
GATCCCAGGGAGAATCCTG
59
CTTGGCCTGTTCTTCTGGA
60
TTTGAGGATGAGGACAGGG
59
TACAAAGTACCTCTGGTGCT
58
ATTTGGAGGTCTACTTTGAGG
57
GTAGAACCTGTAGCAAGGTG
58
TTTCATGAGGACCAGTGGG
59
TTCAAATTCCTAGAAACCAGCG
59
CTATGGAACAACCTGGGCA
60
TTTCAAATTCCTTCTCCCACTG
59
      尚未收录相关数据

TTC4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TTC4基因的本体(GO)信息:

可能调控 TTC4基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Sporadic Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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