TSPAN7 (tetraspanin 7)

symbol:
TSPAN7
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.4
gene_family:
X-linked mental retardation|CD molecules|Tetraspanins
alias symbol:
DXS1692E|TALLA-1|A15|CD231
alias name:
None
entrez id:
7102
ensembl gene id:
ENSG00000156298
ucsc gene id:
uc004deg.5
refseq accession:
NM_004615
hgnc_id:
HGNC:11854
approved reserved:
1993-12-08
Xp11.4
基因染色体位置图

TSPAN7(Tetraspanin 7)属于四跨膜蛋白超家族(Tetraspanin family),这是一类在细胞膜上广泛表达的蛋白质,其共同特点是含有四个跨膜结构域,形成特定的空间结构以介导细胞间相互作用和信号传导。TSPAN7主要在中枢神经系统(如海马和大脑皮层)高表达,其生物学功能包括调控神经元发育、突触可塑性(指突触强度可调节的特性,与学习记忆相关)以及细胞黏附与迁移。它通过与其他膜蛋白(如整合素、生长因子受体)形成复合物(称为“四跨膜蛋白网络”),参与细胞信号转导和维持神经元的形态稳定性。TSPAN7的突变或表达异常与X连锁智力障碍(XLID)密切相关,患者表现为认知功能缺陷和发育迟缓。突变可能导致其无法正常参与蛋白相互作用,破坏神经元网络的形成。若TSPAN7过表达,可能增强神经元突触的稳定性,但过度激活可能干扰信号平衡;而表达降低则会导致突触功能受损,影响学习记忆能力。此外,TSPAN7在癌症中也有研究,其表达变化可能通过调节细胞迁移影响肿瘤转移。四跨膜蛋白家族的共性包括:参与细胞膜组织、介导细胞间通讯、调节免疫应答和肿瘤进展等。该家族成员(如CD81、CD9)通常通过形成功能复合物发挥作用,但各自具有组织特异性。专业术语解释:突触可塑性(synaptic plasticity)指突触根据活动强度调整传递效率的能力;整合素(integrin)是一类介导细胞与细胞外基质黏附的受体蛋白。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is a cell surface glycoprotein and may have a role in the control of neurite outgrowth. It is known to complex with integrins. This gene is associated with X-linked mental retardation and neuropsychiatric diseases such as Huntington's chorea, fragile X syndrome and myotonic dystrophy. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员,也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育,活化,生长和运动的调节作用的信号转导事件。这个编码的蛋白是细胞表面的糖蛋白,并且可以具有在神经突向外生长的控制的作用。已知的是复杂的与整。此基因与X连锁精神发育迟滞和神经精神性疾病,如亨廷顿舞蹈病,脆性X综合征和肌强直性营养不良相关联。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

TSPAN7基因的碱基序列:[NCBI]
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TSPAN7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3269       rs10333       rs15765       rs754341       rs963481       rs980892       rs1022452       rs1040350       rs1040351       rs1051144       rs1534857       rs1804492       rs1980423       rs1997609       rs2142434       rs2205511       rs2205513      

TSPAN7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTCAAGGAAGAAGCAGAG
57
CCTCTTCTATAGACCTTCCCT
57
ATGGATGCTGAAACTGTATGC
59
AACACAAACCCTGAAATGCC
59
CACTATTGTTGTCTTTGGCCT
58
AACATGGCATACAGTTTCAGC
59
ATGGTCAAGGAAGAAGCAG
57
TCTTCTATAGACCTTCCCTGAC
58
GGATGCTGAAACTGTATGCC
59
GAAACACAAACCCTGAAATGC
59
GGTCAAGGAAGAAGCAGAG
57
TCTTCTATAGACCTTCCCTGAC
58
      尚未收录相关数据

TSPAN7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TSPAN7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
B4DDG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WC96 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WF47 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WF53 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
P41732 (UniProtKB)
TAS
GO:0007166
P41732 (UniProtKB)
IBA
GO:0016032
P41732 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TSPAN7基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mental Retardation, X-Linked 58 0.36 1 2 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Intellectual Disability 0.00272435 1 0 LHGDN
Autistic Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Schizophrenia 0.002367032 1 0 GAD
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Mental Retardation 0.000542884 2 0 BeFree
Tumor Progression 0.000542884 2 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Desmoplastic Small Round Cell Tumor 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree

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