TSPAN1 (tetraspanin 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TSPAN1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p34.1
gene_family:
Tetraspanins
alias symbol:
TSPAN-1|NET-1
alias name:
None
entrez id:
10103
ensembl gene id:
ENSG00000117472
ucsc gene id:
uc001cpd.4
refseq accession:
NM_005727
hgnc_id:
HGNC:20657
approved reserved:
2005-01-06

基因染色体位置

基因染色体位置

1p34.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TSPAN1（Tetraspanin 1）是四跨膜蛋白超家族（Tetraspanin家族）的成员之一，该家族以其四个跨膜结构域为特征，广泛参与细胞膜上的信号传导、细胞黏附、迁移和增殖等生物学过程。TSPAN1编码的蛋白质与其他四跨膜蛋白类似，通过与其他膜蛋白（如整合素、生长因子受体等）形成复合物来调节细胞功能。它在多种组织中表达，尤其在神经系统和生殖系统中发挥重要作用。TSPAN1的主要作用位点是细胞膜，通过与伴侣蛋白相互作用参与细胞间通讯和细胞微环境调控。突变或异常表达可能影响其功能，导致细胞行为紊乱，例如促进肿瘤细胞的侵袭和转移。研究表明，TSPAN1在某些癌症（如肝癌、胃癌和乳腺癌）中过表达，可能与肿瘤进展和不良预后相关。过表达可能增强细胞迁移和侵袭能力，而降低表达则可能抑制这些表型。此外，TSPAN1还参与免疫调节，影响T细胞活化和炎症反应。四跨膜蛋白家族的共性包括参与膜蛋白组织、细胞信号转导和膜动力学调控，许多成员在癌症和免疫疾病中发挥关键作用。TSPAN1作为该家族的一员，其功能研究仍在深入，未来可能成为疾病治疗的潜在靶点。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员，也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育，活化，生长和运动的调节作用的信号转导事件。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对TSPAN1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TSPAN1基因的介绍

基因序列

基因序列

TSPAN1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TSPAN1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs11211261       rs11582906       rs12030928       rs12752892       rs17102061       rs34612537       rs34832129       rs35018988       rs55884940       rs67017475       rs68179532       rs71062742       rs78713820       rs80285163       rs112922877       rs114892916       rs115994203      

基因表达

基因表达

TSPAN1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGTACACCACAATGGCTG
59
GAAGTCTTCCTGGGAACCA
59
CTGACCTTGTCCTGTCCTC
59
ATGGAGGATGGATTGGAGG
59
TTTATATCTGCCCAGCTGTG
58
GATCTTCAGAAAGGATGCCC
59
GTACACCACAATGGCTGAG
59
TGAAGTCTTCCTGGGAACC
59
TGAAGCCTTTCCCTGTGAG
60
TCTGAAAGAGGGAACTGCTG
60
AATGACAACGTCACCAACAC
59
GCTGATTGAAGCAACCCTC
59
GTACACCACAATGGCTGAG
59
TGAAGTCTTCCTGGGAACC
59
AAACTATGATCCCTGCTGC
58
TAATGAAGCTGAAGCACTGC
59
CTGACCTTGTCCTGTCCTC
59
TCAGGGAAAGGCTTCAGTG
59
GTACACCACAATGGCTGAG
59
TGAAGTCTTCCTGGGAACC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TSPAN1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TSPAN1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
O60635 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0005765
O60635 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
O60635 (UniProtKB)
IBA
GO:0007166
O60635 (UniProtKB)
IBA
GO:0008283
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0016477
O60635 (UniProtKB)
IMP
GO:0031982
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0031982
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0045807
O60635 (UniProtKB)
IMP
GO:0048471
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0050821
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O60635 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O60635 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TSPAN1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.00408156 5 0 BeFree_LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Uterine Cervical Neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 0 GAD
Diabetes Mellitus 0.002367032 1 0 GAD
Neoplasm Metastasis 0.001628651 6 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.001085767 4 0 BeFree
Gastric Adenocarcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree

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基因相关服务

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