TSHZ1 (teashirt zinc finger homeobox 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TSHZ1
locus group:
protein-coding gene
location:
18q22.3
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type|ZF class homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
NY-CO-33|TSH1
alias name:
None
entrez id:
10194
ensembl gene id:
ENSG00000179981
ucsc gene id:
uc002lly.4
refseq accession:
NM_005786
hgnc_id:
HGNC:10669
approved reserved:
1999-07-23

基因染色体位置

基因染色体位置

18q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a colon cancer antigen that was defined by serological analysis of recombinant cDNA expression libraries. The encoded protein is a member of the teashirt C2H2-type zinc-finger protein family and may be involved in transcriptional regulation of developmental processes. Mutations in this gene may be associated with congenital aural atresia syndrome. [provided by RefSeq, Jan 2012]

这个基因编码，是由重组cDNA表达文库的血清学分析所定义的结肠癌抗原。所编码的蛋白质是teashirt C2H2型锌指蛋白家族的成员，并可能参与发育过程的转录调控。在这个基因的突变可以与先天性外耳道闭锁综合症有关。 [由RefSeq的，2012年1月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TSHZ1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs766485       rs766486       rs766487       rs960551       rs1345018       rs1345019       rs1440298       rs1440299       rs1440300       rs1530193       rs1550459       rs1866731       rs1866732       rs1866733       rs1978899       rs2083446       rs2083447      

基因表达

基因表达

TSHZ1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTGACACTGTTTGATCTGTG
60
CTCAGGAACATAAGATGCGC
59
CAAACTTGTTCTCCGAGTCC
59
GAACCCGACTTCTTTAAATCCA
59
CATTTCTGCCTCAACTTGC
58
CTCCGTCTCTTCATTGCAC
59
AAACAAACAGGAGCTTGGA
58
TCCTCAGGAACATAAGCCT
58
CTCGGCAGCTTATGTTCCT
60
TTTCCTGAATGTCCAAAGACAG
59
GGGTGACACTGTTTGATCTG
59
TCAGGAACATAAGATGCGC
58
CATTTCTGCCTCAACTTGCT
59
CTCCGTCTCTTCATTGCAC
59
CTCGGCAGCTTATGTTCCT
60
CCTGAATGTCCAAAGACAGC
59
CAAACTTGTTCTCCGAGTCC
59
GAACCCGACTTCTTTAAATCC
57
AACAAACAGGAGCTTGGAC
58
TCCTCAGGAACATAAGCCT
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TSHZ1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TSHZ1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0010468
H0YKA1 (UniProtKB)
IEA
GO:0010468
H0YN23 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
H0YN23 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0009952
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0042474
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0060023
Q6ZSZ6 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TSHZ1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
AURAL ATRESIA, CONGENITAL 0.123257302 12 2 BeFree_CLINVAR
Aortic Aneurysm, Thoracic 0.004071628 15 0 BeFree
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Ataxia, Spinocerebellar 0.001900093 7 0 BeFree
alpha-Thalassemia 0.001900093 7 0 BeFree
Spinocerebellar Ataxia Type 2 0.001357209 5 0 BeFree
Presenile dementia 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 3 BeFree
Plaque, Amyloid 0.001085767 4 0 BeFree
Cerebral Amyloid Angiopathy 0.001085767 4 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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