TRO (trophinin)

symbol:
TRO
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.21
gene_family:
alias symbol:
MAGE-D3|KIAA1114|MAGED3
alias name:
None
entrez id:
7216
ensembl gene id:
ENSG00000067445
ucsc gene id:
uc004dtq.6
refseq accession:
NM_016157
hgnc_id:
HGNC:12326
approved reserved:
1997-10-30
Xp11.21
基因染色体位置图

TRO基因(也称为TROAP,英文全称Trophinin-Associated Protein)属于Trophinin基因家族,该家族主要参与细胞黏附(细胞间相互结合的过程)和胚胎发育调控。TRO基因编码的蛋白质在胎盘形成中起关键作用,通过与另一蛋白trophinin结合,帮助胚胎植入子宫壁(着床)。其主要作用位点是细胞膜,尤其在滋养层细胞(胎盘前体细胞)中高表达。突变可能导致胚胎着床失败或胎盘功能异常,与不孕症、复发性流产相关。该基因过表达可能促进肿瘤转移(如肝癌、乳腺癌),因其增强细胞黏附能力;而表达降低则可能引发妊娠并发症。TRO基因家族共性是通过调控细胞-细胞相互作用影响生殖与肿瘤进程。专业术语解释:细胞黏附(cell adhesion)指细胞通过表面分子相互识别结合;滋养层细胞(trophoblast)是胚胎外层分化的细胞,形成胎盘结构;着床(implantation)是胚胎附着于子宫壁的过程。目前中文译名"TROAP"存在争议,部分文献保留英文缩写。

This gene encodes a membrane protein that mediates cell adhesion between trophoblastic cells and the epithelial cells of the endometrium. The encoded protein participates in cell signalling during embryo implantation, and may also be involved in cancer formation. This gene is located near several other closely related genes on chromosome X. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2012]

这个基因编码介导滋养层细胞和子宫内膜上皮细胞之间细胞粘附的膜蛋白。胚胎植入期间在细胞信号编码的蛋白质参与,并且还可以参与癌症的形成。该基因位于附近多个转录变异体X染色体剪接结果等几个密切相关的基因。 [由RefSeq的,2012年9月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TRO基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1050010       rs1050011       rs1811845       rs2273138       rs2281383       rs4490972       rs4554616       rs5913785       rs5914241       rs5960055       rs6611391       rs7058659       rs7062848       rs10284089       rs12851962       rs17297490       rs45438793      

TRO基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGATGGAAGTCCAACTGCA
59
AGAACTGGGTCCACTACTG
58
GTGCCTCTATTTCAGATATACAGAC
59
GGTGCAGCCTTAGTAATAGTC
58
ACTCTGGAGAAGATGTTTCGA
59
GATTCCTGAGTGCTGATGAG
58
CTGAGGCTCACCTGTTACTC
60
CAGAGGGCCCTGAAATAGAG
60
CCAGGGCTGAGATTTATTCC
58
AGGATGTACTTTGGCTCCA
58
AAGTCCTCAAGTTTGCATGC
60
TGGTGTTGGAACCACTCAG
60
GGCAGATGACTATCTGGCT
59
CAGATGCTTGGACTTTCGG
59
CACCTGAATATGAGTTCTTCTGG
59
GTCTTTCTTCTGCACCCTG
59
TTAGTGAAGACCCTGTGGG
59
AGTAACAGGTGAGCCTTAGG
59
AGATAGGCTGTGGAAGATGC
60
ATTCAGATGCTTGGACAATCTG
59
      尚未收录相关数据

TRO基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRO基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
G5E9N2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12816 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q12816 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q12816 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q12816 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q12816 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q12816 (UniProtKB)
TAS
GO:0007566
Q12816 (UniProtKB)
TAS
GO:0030308
Q12816 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TRO基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ectopic Pregnancy 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Infertility 0.00272435 1 0 LHGDN
Endometriosis 0.00272435 1 0 LHGDN
ovarian neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Secondary malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of gallbladder 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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