TRIM6 (tripartite motif containing 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRIM6
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.4
gene_family:
Ring finger proteins|Tripartite motif-containing
alias symbol:
RNF89
alias name:
None
entrez id:
117854
ensembl gene id:
ENSG00000121236
ucsc gene id:
uc001mbc.3
refseq accession:
NM_001003818
hgnc_id:
HGNC:16277
approved reserved:
2001-11-21

基因染色体位置

基因染色体位置

11p15.4
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TRIM6（Tripartite Motif Containing 6）属于TRIM基因家族，该家族成员均含有保守的三联结构域（TRIM motif），包括RING结构域（具有E3泛素连接酶活性）、B-box锌指结构域（参与蛋白相互作用）和卷曲螺旋结构域（介导多聚化）。TRIM6主要定位于细胞质，其表达产物通过泛素-蛋白酶体系统调控天然免疫反应，尤其在抗病毒防御中起关键作用。它能催化干扰素调节因子3（IRF3）等蛋白的泛素化修饰，促进I型干扰素（IFN-α/β）的产生，从而激活下游抗病毒信号通路。该基因在造血系统、肝脏和免疫细胞中高表达。TRIM6的功能突变（如RING结构域突变）会导致泛素化活性丧失，削弱机体对RNA病毒（如流感病毒、登革热病毒）的抵抗能力，与慢性病毒感染和自身免疫疾病风险相关。过表达TRIM6会增强干扰素通路活性，可能引发过度炎症反应（如细胞因子风暴），而表达降低则导致病毒易感性增加。TRIM家族共性包括：①通过泛素化调控信号转导；②参与先天免疫、细胞增殖和凋亡；③多数成员具有抗病毒功能。研究发现TRIM6与多发性硬化症（MS）和系统性红斑狼疮（SLE）存在遗传关联，其异常表达可能通过干扰素通路失调促进自身免疫疾病发展。

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, B-box type 1 and B-box type 2 domain, and a coiled-coil region. The protein localizes to the nucleus, but its specific function has not been identified. This gene is mapped to chromosome 11p15, where it resides within a TRIM gene cluster. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A read-through transcript from this gene into the downstream TRIM34 gene has also been observed, which results in a fusion product from these neighboring family members. [provided by RefSeq, Oct 2010]

该基??因编码的蛋白是三方母题（TRIM）家族中的一员。 TRIM的基序包括三个锌结合结构域，一个环，B框1型和2 B框型结构域，以及一个卷曲螺旋区域。该蛋白定位于细胞核，但其特定的功能还没有被确定。该基因被映射到11p15染色体，它驻留在TRIM基因簇内。选择性剪接结果在多个抄本变形。从该基因的通读转录进入下游TRIM34基因也已经观察到，其导致从这些相邻家庭成员的融合产物。 [由RefSeq的，2010年10月提供]

OMIM数据库中对TRIM6基因的介绍     Wikipedia数据库中对TRIM6基因的介绍

基因序列

基因序列

TRIM6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRIM6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs720677       rs756035       rs870727       rs1074353       rs1074354       rs1368693       rs1813324       rs1989427       rs2001778       rs2011014       rs3082333       rs3740999       rs3751005       rs3751006       rs3763881       rs3824950       rs4255566      

基因表达

基因表达

TRIM6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGATGTCACAGAAAGGAGTG
59
CTCGGAACATACTTCTCAGC
58
CTCATCTCGGATCTGGAGC
59
CAGAACTCACTCCTTTCTGTG
58
GCTCATCTCGGATCTGGAG
59
GAACTCACTCCTTTCTGTGAC
58
TGATGTCACAGAAAGGAGTG
57
GCTCGGAACATACTTCTCAG
58
GATGTCACAGAAAGGAGTGAG
58
GGCTCGGAACATACTTCTC
57
CTCATCTCGGATCTGGAGC
59
GAACTCACTCCTTTCTGTGAC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TRIM6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRIM6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005622
E9PFM0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
E9PFM0 (UniProtKB)
IEA
GO:0000209
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0002230
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0002741
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0003674
Q9C030 (UniProtKB)
ND
GO:0005515
Q9C030 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9C030 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9C030 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0008134
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0010628
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0010629
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0010800
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0010994
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0016874
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0019901
Q9C030 (UniProtKB)
IPI
GO:0019901
Q9C030 (UniProtKB)
IPI
GO:0030674
Q9C030 (UniProtKB)
IPI
GO:0032496
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0033138
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0035458
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0045071
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0045892
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:0060340
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0061630
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:0070206
Q9C030 (UniProtKB)
IDA
GO:0098586
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:1990782
Q9C030 (UniProtKB)
IPI
GO:2000679
Q9C030 (UniProtKB)
IMP
GO:2000737
Q9C030 (UniProtKB)
IEA
GO:1901222
Q9C030 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRIM6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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