TRIM39-RPP21 (TRIM39-RPP21 readthrough)

symbol:
TRIM39-RPP21
locus group:
other
location:
6p22.1
gene_family:
alias symbol:
None
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None
entrez id:
202658
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ENSG00000248167
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uc063mrm.1
refseq accession:
NM_001199119.1
hgnc_id:
HGNC:38845
approved reserved:
2011-02-21
6p22.1

TRIM39-RPP21是一个融合基因,由TRIM39(Tripartite Motif Containing 39)和RPP21(Ribonuclease P/MRP Subunit P21)两个基因的部分序列融合而成。TRIM39属于TRIM蛋白家族,该家族成员通常包含RING结构域、B-box结构域和卷曲螺旋结构域,参与多种细胞过程如抗病毒反应、细胞增殖和凋亡调控。TRIM39在细胞周期调控和DNA损伤应答中发挥作用,其过表达可能抑制细胞增殖并促进凋亡,而表达降低则可能增加基因组不稳定性。RPP21是核糖核酸酶P(RNase P)的一个亚基,RNase P负责tRNA前体的加工,对蛋白质合成至关重要。TRIM39-RPP21融合基因的功能尚未完全阐明,但可能保留了部分亲本基因的特性,影响细胞周期和RNA加工。TRIM39的突变或异常表达与某些癌症如多发性骨髓瘤和卵巢癌相关,而RPP21的缺陷可能导致tRNA加工异常,影响蛋白质合成。TRIM39-RPP21的过表达可能干扰正常细胞周期调控和RNA代谢,导致细胞功能紊乱,而表达降低可能影响基因组稳定性和蛋白质合成效率。TRIM家族基因的共同特点是含有保守的TRIM结构域,参与泛素化、先天免疫和转录调控等过程。该融合基因的研究有助于理解其在疾病中的作用,并为相关治疗提供潜在靶点。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring TRIM39 (tripartite motif-containing 39) and RPP21 (ribonuclease P/MRP 21kDa subunit) genes on chromosome 6. The read-through transcript encodes a fusion protein that shares sequence identity with each individual gene product. [provided by RefSeq, Nov 2010]

此轨迹表示天然产生的读通过相邻TRIM39之间转录(三方39含有基序)和RPP21(核糖核酸酶P / MRP 21kDa亚基)第6号染色体的基因的通读转录物编码的融合蛋白股序列同一性与每个单独的基因产物。 [由RefSeq的,2010年11月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TRIM39-RPP21基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs113880128       rs115949008       rs116281378       rs138695474       rs141246881       rs150343286       rs180917323       rs184679111       rs188255140       rs189970255       rs192990613       rs373934055       rs532258332       rs535333104       rs537135556       rs558067388       rs567718874      

TRIM39-RPP21基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAAACAGCTAATTGCGGATGTG
60
ACGCTCTTACGATCCTCTG
59
TAAACAGCTAATTGCGGATGTG
60
ACGCTCTTACGATCCTCTG
59
CAGCTAATTGCGGATGTGAC
60
CTTGACGCTCTTACGATCCT
60
CAGCTAATTGCGGATGTGAC
60
CTTGACGCTCTTACGATCCT
60
AACGCTTCCTCAATGATCC
58
GTTTGGAATCTGCTTGGCT
59
AACGCTTCCTCAATGATCC
58
GTTTGGAATCTGCTTGGCT
59
      尚未收录相关数据

TRIM39-RPP21基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRIM39-RPP21基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码

可能调控 TRIM39-RPP21基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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