TRIM21 (tripartite motif containing 21)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRIM21
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.4
gene_family:
Ring finger proteins|Tripartite motif-containing
alias symbol:
RNF81|RO52
alias name:
Ro/SSA 52kDa|E3 ubiquitin-protein …
entrez id:
6737
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ENSG00000132109
ucsc gene id:
uc001lyy.2
refseq accession:
NM_003141
hgnc_id:
HGNC:11312
approved reserved:
1994-01-06

基因染色体位置

基因染色体位置

11p15.4
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TRIM21（Tripartite Motif Containing 21）属于TRIM蛋白家族，该家族成员均含有三个保守结构域：RING结构域（具有E3泛素连接酶活性，参与蛋白质降解）、B-box结构域（介导蛋白质相互作用）和卷曲螺旋结构域（参与多聚化）。TRIM21主要定位于细胞质，但也可进入细胞核，其表达产物是一种具有抗病毒和免疫调节功能的蛋白质。TRIM21通过识别与抗体结合的病毒颗粒（这一过程称为抗体依赖性细胞内中和，ADIN），将其靶向泛素-蛋白酶体系统降解，从而发挥抗病毒作用。此外，TRIM21还参与调控炎症反应和自身免疫，它能通过NF-κB信号通路影响炎症因子的产生。TRIM21基因突变可能导致其功能丧失，使机体抗病毒能力下降，增加病毒感染风险，或导致炎症反应失调，与系统性红斑狼疮（SLE）和干燥综合征等自身免疫疾病相关。TRIM21过表达可能增强抗病毒反应，但过度激活免疫系统也可能引发自身免疫反应；而降低表达则可能导致免疫防御功能减弱，增加感染易感性。TRIM家族成员通常参与细胞增殖、凋亡、先天免疫和抗病毒防御等过程，具有相似的保守结构域和功能模式。TRIM21在自身免疫疾病中常作为自身抗原，其抗体水平可用于疾病诊断。

This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The encoded protein is part of the RoSSA ribonucleoprotein, which includes a single polypeptide and one of four small RNA molecules. The RoSSA particle localizes to both the cytoplasm and the nucleus. RoSSA interacts with autoantigens in patients with Sjogren syndrome and systemic lupus erythematosus. Alternatively spliced transcript variants for this gene have been described but the full-length nature of only one has been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的三方母题（TRIM）家族中的一员。 TRIM的基序包括三个锌结合结构域，一个环，B框型1和B框2型，和一个卷曲螺旋区域。所编码的蛋白质是罗萨核糖核蛋白，它包括一个单一的多肽和四个小RNA分子中的一个的一部分。的罗萨颗粒定位于细胞质和细胞核两者。罗萨与患者舍格伦综合征和系统性红斑狼疮的自身抗原相互作用。此基因可变剪接转录物变体已有描述，但只有一个的全长性质已确定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRIM21基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs15120       rs760217       rs890419       rs890420       rs915956       rs926100       rs926101       rs928913       rs928914       rs928915       rs1042302       rs1426377       rs1426378       rs2114294       rs2162297       rs2250241       rs2269328      

基因表达

基因表达

TRIM21基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATGTGCAGTCCACATCAC
59
TTCCAGGTATGCTCTGCTG
59
TACCTCTCCAGAACTCAGGA
59
AGAGTGATGTGGACTGCAC
59
ACCTCTCCAGAACTCAGGA
59
CAGAGTGATGTGGACTGCA
59
CATGTGCAGTCCACATCAC
59
TCTCCAAGCCTCACTTGTC
59
CTCTCCAGAACTCAGGAGTG
59
TCCAGAGTGATGTGGACTG
58
CATGTGCAGTCCACATCAC
59
TCCAAGCCTCACTTGTCTC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NFKB1
TRIM21
Unknown
23391827
RELA
TRIM21
Unknown
23391827

基因本体信息

TRIM21基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRIM21基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000209
P19474 (UniProtKB)
IDA
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P19474 (UniProtKB)
TAS
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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IDA
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P19474 (UniProtKB)
IDA
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P19474 (UniProtKB)
IDA
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P19474 (UniProtKB)
EXP
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P19474 (UniProtKB)
IDA
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P19474 (UniProtKB)
TAS
GO:0004842
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
IDA
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
TAS
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P19474 (UniProtKB)
TAS
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P19474 (UniProtKB)
TAS
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P19474 (UniProtKB)
TAS
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P19474 (UniProtKB)
IDA
GO:0006513
P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
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P19474 (UniProtKB)
IPI
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P19474 (UniProtKB)
IPI
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P19474 (UniProtKB)
IPI
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GO:0051091
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GO:0070206
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GO:0090086
P19474 (UniProtKB)
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GO:1902187
P19474 (UniProtKB)
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GO:0019005
P19474 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRIM21基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lupus Erythematosus, Systemic 0.022473594 55 5 BeFree_GAD_LHGDN
Sjogren's Syndrome 0.016445791 9 0 BeFree_GAD_LHGDN
Autoimmune Diseases 0.009520329 16 0 BeFree_LHGDN
Neonatal Systemic lupus erythematosus 0.007600372 28 0 BeFree
Congenital heart block 0.007328931 27 0 BeFree
Lupus Erythematosus 0.004885954 18 0 BeFree
Lupus Erythematosus, Discoid 0.003800186 14 0 BeFree
Lupus Vulgaris 0.003528744 13 0 BeFree
Sessile Serrated Adenoma/Polyp 0.002985861 11 0 BeFree
Hyperplastic Polyp 0.002985861 11 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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