TRGVB (T cell receptor gamma variable B (pseudogene))

symbol:
TRGVB
locus group:
pseudogene
location:
7p14.1
gene_family:
T cell receptor gamma locus at 7p14
alias symbol:
V6P
alias name:
T-cell receptor, gamma, variable r…
entrez id:
6987
ensembl gene id:
ENSG00000231202
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NG_001336
hgnc_id:
HGNC:12297
approved reserved:
1989-05-30
7p14.1
基因染色体位置图

TRGVB(T cell receptor gamma variable gene B)是T细胞受体(TCR)γ链可变区基因家族的一员,属于TRGV基因家族。TCR是T细胞表面识别抗原的关键分子,由α/β或γ/δ两条链组成,其中γ链由TRGV基因编码的可变区(V区)与恒定区(C区)构成。TRGV基因家族负责编码γ链的可变区,决定了TCR的抗原结合特异性。TRGVB与其他TRGV基因(如TRGVA、TRGVC等)具有相似结构,均包含可变(V)、多样(D)和连接(J)基因片段,通过V(D)J重排(一种基因片段随机组合的机制)产生多样性,使T细胞能识别多种病原体。TRGVB主要在γδ T细胞中表达,这类T细胞是先天免疫的重要组成,具有快速响应感染和肿瘤的能力,其功能包括直接杀伤靶细胞、分泌细胞因子(如IFN-γ、TNF-α)等。若TRGVB发生突变(如缺失或错义突变),可能导致γδ T细胞受体多样性降低或功能异常,影响免疫监视,增加感染或肿瘤风险。目前TRGVB与疾病的直接关联研究较少,但γδ T细胞功能紊乱与自身免疫病(如类风湿关节炎)、感染性疾病(如结核)和某些癌症(如结直肠癌)有关。若TRGVB过表达,可能增强γδ T细胞的活化与增殖,提升抗肿瘤或抗感染能力,但也可能引发过度炎症反应;若表达降低,则可能导致免疫缺陷。TRGVB的表达变化还可能影响其他TCR相关基因(如TRDV基因)的调控,进而改变γδ T细胞亚群的比例或功能。TRGV基因家族的共性包括:位于人类7号染色体(7p14),具有多基因和多等位基因特性,通过V(D)J重排产生高度多样性,并主要在γδ T细胞中发挥免疫识别作用。专业术语解释:V(D)J重排(V(D)J recombination)是淋巴细胞发育中基因片段随机组合的过程,产生多样的抗原受体;γδ T细胞(gamma delta T cells)是一类非经典T细胞,兼具先天和适应性免疫特性;错义突变(missense mutation)指导致氨基酸改变的基因突变。

None

TRGVB基因的碱基序列:[NCBI]
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TRGVB基因的碱基突变:           仅显示部分snp

TRGVB基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTATACACTGGTACCAGCA
57
AGTGATATTTGTCAGATGGCTC
58
TGAGCCATCTGACAAATATCAC
59
TCTCACCTAAGCAAACTCGA
59
TGAGCCATCTGACAAATATCAC
59
TCTCACCTAAGCAAACTCG
57
      尚未收录相关数据

TRGVB基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRGVB基因的本体(GO)信息:

可能调控 TRGVB基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.000271442 1 0 BeFree

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