TRGV5P (T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene))

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRGV5P
locus group:
pseudogene
location:
7p14.1
gene_family:
T cell receptor gamma locus at 7p14
alias symbol:
V1S5P
alias name:
T-cell receptor, gamma, variable r…
entrez id:
6979
ensembl gene id:
ENSG00000228668
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NG_001336
hgnc_id:
HGNC:12291
approved reserved:
1989-05-30

基因染色体位置

基因染色体位置

7p14.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TRGV5P（T Cell Receptor Gamma Variable 5 Pseudogene）是T细胞受体γ（TCRγ）基因家族中的一个假基因（pseudogene），属于T细胞受体基因超家族。假基因是指与功能基因序列相似但通常因突变（如移码突变、终止密码子提前出现或启动子缺失）而丧失正常功能的基因片段。TCRγ基因家族参与编码T细胞受体的γ链，这是适应性免疫系统中T细胞识别抗原的关键组成部分，但TRGV5P本身因结构缺陷无法表达功能性蛋白。该基因位于人类7号染色体（7p14）的TCRγ基因簇内，与功能性TCRγ基因（如TRGV2、TRGV9等）共享相似的V（可变）区结构，但缺乏完整表达所需的调控元件或编码序列。假基因可能通过基因转换或同源重组影响邻近功能性基因的多样性，但其具体生物学作用尚不明确。TRGV5P的突变通常不会直接影响机体功能，因为假基因本身无活性，但若突变干扰邻近基因的调控可能间接影响TCRγ链的多样性。目前未发现TRGV5P与特定疾病的直接关联，但TCRγ基因家族的异常可能与T细胞淋巴瘤或自身免疫疾病相关。由于TRGV5P不表达，其过表达或低表达的情况不存在实际意义，但整个TCRγ家族的表达异常可能导致T细胞功能紊乱，例如免疫缺陷或过度活化。TCRγ基因家族的共性包括：编码T细胞受体的可变区，通过V（可变）、J（连接）和C（恒定）区基因片段的重排产生多样性，从而识别多种抗原。该家族成员在T细胞发育中至关重要，尤其在γδ T细胞（一类先天样T细胞）的抗原识别中发挥作用。总结而言，TRGV5P作为假基因，是TCRγ家族进化过程中的遗传遗迹，可能保留部分调控或结构作用，但对免疫功能无直接贡献。

None

无

OMIM数据库中对TRGV5P基因的介绍     Wikipedia数据库中对TRGV5P基因的介绍

基因序列

基因序列

TRGV5P基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRGV5P基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

TRGV5P基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTCCTGTATCCTGCCAGTC
60
TTCAGCAGATGACCCAGTC
59
TTCCTGTATCCTGCCAGTC
59
TTCAGCAGATGACCCAGTC
59
CCTGTATCCTGCCAGTCAG
60
TTCAGCAGATGACCCAGTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TRGV5P基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRGV5P基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRGV5P基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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