TRG-AS1 (T cell receptor gamma locus antisense RNA 1)

symbol:
TRG-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
7p14.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
TRG antisense RNA 1
entrez id:
100506776
ensembl gene id:
ENSG00000281103
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_040085
hgnc_id:
HGNC:48974
approved reserved:
2013-07-23
7p14.1
基因染色体位置图

TRG-AS1是一种长链非编码RNA(lncRNA),属于TRG基因家族的一部分,该家族主要与T细胞受体γ(TCRγ)基因的调控相关。TRG-AS1位于人类7号染色体上,靠近TCRγ基因位点,可能在T细胞发育和免疫应答中起调控作用。其表达产物本身不编码蛋白质,但可通过表观遗传修饰或与RNA结合蛋白相互作用来调节邻近基因(如TCRγ)的表达。TRG-AS1的生物学功能尚不完全明确,但研究表明它可能参与T细胞受体多样性的形成,影响免疫系统的适应性。若TRG-AS1发生突变,可能导致TCRγ表达异常,进而干扰T细胞功能,增加自身免疫疾病或免疫缺陷的风险。该基因的过表达可能通过抑制TCRγ或其他免疫相关基因的表达而削弱T细胞活性,而低表达则可能破坏正常的免疫调控网络。TRG-AS1与某些淋巴系统恶性肿瘤(如T细胞淋巴瘤)的关联正在研究中,可能作为潜在生物标志物或治疗靶点。TRG基因家族的共性包括定位在TCRγ基因附近、参与免疫调控及通过非编码机制影响邻近基因表达。目前对TRG-AS1的研究仍处于早期阶段,需要进一步探索其在疾病中的具体机制。

None

TRG-AS1基因的碱基序列:[NCBI]
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TRG-AS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs733905       rs909157       rs909158       rs1006867       rs1808312       rs1808313       rs1808314       rs1810377       rs1810378       rs1810379       rs1810380       rs1810381       rs1882767       rs1986039       rs2002761       rs2011386       rs2011898      

TRG-AS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGACTCTGCTCTAAGCTC
59
CTTTCTCATTCCCAGCTGTG
59
TGCTCTAAGACTCATGGAGG
59
ACACATGATCCTCAGTCCT
58
AAAGGACTGAGGATCATGTG
57
TGTGATGACAGCAGAAACTG
59
AAAGGACTGAGGATCATGTG
57
TGATGACAGCAGAAACTGC
59
GGAGTCTGCTCTAAGAGCT
58
CCAGAGCAAAGATGCTCTG
59
TTGGACTCTGCTCTAAGCTC
59
TTTCTCATTCCCAGCTGTG
58
AAAGGACTGAGGATCATGTG
57
GATGACAGCAGAAACTGCA
59
TGGACTCTGCTCTAAGCTC
59
TTTCTCATTCCCAGCTGTG
58
GGAGTCTGCTCTAAGAGCTG
60
CAGAGCAAAGATGCTCTGC
59
      尚未收录相关数据

TRG-AS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRG-AS1基因的本体(GO)信息:

可能调控 TRG-AS1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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