TRERF1 (transcriptional regulating factor 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRERF1
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.1
gene_family:
SANT/Myb domain containing
alias symbol:
TReP-132|HSA277276|RAPA|dJ139D8.5
alias name:
None
entrez id:
55809
ensembl gene id:
ENSG00000124496
ucsc gene id:
uc003osd.3
refseq accession:
NM_033502
hgnc_id:
HGNC:18273
approved reserved:
2003-11-26

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a zinc-finger transcriptional regulating protein which interacts with CBP/p300 to regulate the human gene CYP11A1. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2014]

该基因编码与CBP / p300的相互作用调节人类基因CYP11A1锌指转录调控蛋白。在多个转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的，2014年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRERF1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs4714585       rs6935563       rs7739515       rs7739621       rs7741990       rs7742167       rs7742263       rs7742295       rs7742321       rs7742481       rs7742960       rs7762738       rs9296381       rs9367137       rs9462784       rs9462785       rs9462786      

基因表达

基因表达

TRERF1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGGAGTGTGGCAAAGTC
59
TCTGTTGTTCCTCCTGCTG
59
TTACCACTATGCCGGTTCG
59
AGTCTTTGCTGTAAGTGGCT
59
CTGTAGATGTTGAACCACGC
59
CCAGGGCAGAGATATCTTGG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
TRERF1
CCR7
Unknown
17006331
TRERF1
CD40
Repression
18652845
TRERF1
CD80
Repression
18652845
TRERF1
CD86
Repression
18652845
TRERF1
LILRB1
Repression
18652845
TRERF1
LILRB2
Repression
18652845
TRERF1
LILRB4
Repression
18652845

基因本体信息

TRERF1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRERF1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000118
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0001104
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0003700
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005667
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0006351
Q96PN7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0006694
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0006707
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0007275
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0008134
Q96PN7 (UniProtKB)
IPI
GO:0008301
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0030374
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0042592
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS
GO:0044212
Q96PN7 (UniProtKB)
IBA
GO:0045893
Q96PN7 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q96PN7 (UniProtKB)
IEA
GO:0046885
Q96PN7 (UniProtKB)
NAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRERF1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.123267234 3 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Peripheral Neuropathy 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Limb ischemia 0.000271442 1 0 BeFree
Noninfiltrating Intraductal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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