TRAV38-1 (T cell receptor alpha variable 38-1)

symbol:
TRAV38-1
locus group:
other
location:
14q11.2
gene_family:
T cell receptor alpha locus at 14q11.2
alias symbol:
TRAV381|TCRAV14S2|TCRAV38S1
alias name:
None
entrez id:
28644
ensembl gene id:
ENSG00000211816
ucsc gene id:
uc021rpx.2
refseq accession:
NG_001332
hgnc_id:
HGNC:12137
approved reserved:
2000-05-15
14q11.2
基因染色体位置图

TRAV38-1(T细胞受体α可变区基因38-1)属于T细胞受体(TCR)基因家族中的TRAV(TCR α链可变区)亚家族,该家族编码T细胞受体α链的可变区片段,是适应性免疫系统识别抗原的关键组成部分。TCR基因家族的共性是通过V(D)J基因重排(一种DNA片段随机组合的机制)产生高度多样化的T细胞受体,使T细胞能够识别各种病原体或异常细胞(如癌细胞)表面的抗原肽-MHC复合物。TRAV38-1在T细胞发育过程中表达,其产物与其他TCR链(如β链)结合形成功能性TCR,参与抗原识别和免疫应答激活。该基因的作用位点主要在T细胞表面,通过与抗原提呈细胞(APC)相互作用触发下游信号通路。若TRAV38-1发生突变,可能导致TCR结构异常,影响抗原识别能力,进而引发免疫缺陷或自身免疫疾病(如多发性硬化症或类风湿关节炎)。目前尚未明确报道该基因过表达或低表达的直接病理影响,但TCR表达水平的异常通常与免疫失调相关——例如过表达可能增强自身免疫反应,而低表达可能导致免疫监视功能下降。由于TRAV家族成员间具有高度序列同源性,其他TRAV基因可能补偿TRAV38-1的功能缺失。需要注意的是,TRAV38-1这类基因的研究仍处于早期阶段,其具体机制和疾病关联需进一步探索。专业术语解释:V(D)J重排指B细胞或T细胞发育中基因片段(V可变区、D多样性区、J连接区)的随机组合过程;MHC(主要组织相容性复合体)是细胞表面提呈抗原的蛋白质。

None

TRAV38-1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
TRAV38-1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

TRAV38-1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTCCACCTGTCTTGAATCC
59
CTCAGGGTCACAGTCTCTG
59
TCCACCTGTCTTGAATCCG
59
AACTCAGGGTCACAGTCTC
59
TCCACCTGTCTTGAATCCG
59
CTCAGGGTCACAGTCTCTG
59
      尚未收录相关数据

TRAV38-1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRAV38-1基因的本体(GO)信息:

可能调控 TRAV38-1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。