TRAV13-1 (T cell receptor alpha variable 13-1)

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TRAV13-1
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other
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14q11.2
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T cell receptor alpha locus at 14q11.2
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None
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28671
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ENSG00000211788
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uc058zds.1
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NG_001332
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HGNC:12108
approved reserved:
2000-05-15
14q11.2
基因染色体位置图

TRAV13-1(T细胞受体α可变区13-1)属于T细胞受体(TCR)基因家族,该家族编码T细胞表面识别抗原的关键蛋白。TCR基因家族分为α、β、γ和δ链,共同构成T细胞的抗原识别结构,通过与主要组织相容性复合体(MHC)结合来识别病原体或异常细胞。TRAV13-1是TCRα链的可变区基因之一,其表达产物参与T细胞受体多样性的形成,直接影响T细胞对特定抗原的识别能力。该基因的特点是其可变区序列高度多变,通过V(D)J重组(一种基因片段随机重排机制)产生多样性,使免疫系统能够应对各种病原体。主要作用位点为T细胞表面,与TCRβ链共同构成完整的TCR复合物。若TRAV13-1发生突变,可能导致TCR结构异常,影响抗原识别功能,进而引发免疫缺陷或自身免疫疾病。例如,某些突变可能减少T细胞多样性,削弱抗感染能力;或导致错误识别自身组织,引发类风湿性关节炎等自身免疫病。目前尚未明确其过表达或低表达的直接影响,但理论上过表达可能增加特定T细胞克隆的扩增,而低表达可能限制免疫应答范围。该基因家族(TRAV)的共性是通过可变区基因片段的重排产生大量TCR变体,为适应性免疫提供基础。由于TRAV13-1属于多基因家族,其功能可能与其他可变区基因存在冗余(功能重叠),但具体机制仍需进一步研究。在疾病关联方面,TCR基因的异常与T细胞淋巴瘤、自身免疫疾病和免疫缺陷综合征有关,但TRAV13-1的特异性作用尚不明确。专业术语解释:V(D)J重组是淋巴细胞中基因片段(V、D、J)随机组合的过程,产生抗体或TCR的多样性;MHC(主要组织相容性复合体)是细胞表面呈递抗原的蛋白质。若需更深入研究,建议结合免疫组库测序(immune repertoire sequencing)分析其实际表达模式。

None

TRAV13-1基因的碱基序列:[NCBI]
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TRAV13-1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

TRAV13-1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGACATCCATTCGAGCTG
58
TCTCCATTCACCAAGTCCAG
60
ATGACATCCATTCGAGCTG
58
TCTCCATTCACCAAGTCCA
58
ATGACATCCATTCGAGCTG
58
CTCCATTCACCAAGTCCAG
58
      尚未收录相关数据

TRAV13-1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRAV13-1基因的本体(GO)信息:

可能调控 TRAV13-1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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